酰基辅酶A硫酯酶2; ACOT2
过氧化物酶体长链酰基辅酶A硫酯酶; PTE2
MTE1
PTE1A,小鼠,同源物
HGNC 批准的基因符号:ACOT2
细胞遗传学位置:14q24.3 基因组坐标(GRCh38):14:73,567,620-73,575,658(来自 NCBI)
▼ 说明
酰基辅酶A硫酯酶,例如ACOT2,是一组将辅酶A酯(例如酰基辅酶A、胆汁辅酶A和前列腺素辅酶A酯)水解为相应的游离酸和辅酶A的酶(Hunt等人,2005)。
▼ 克隆与表达
通过 EST 数据库搜索与过氧化物酶体硫酯酶同源的蛋白质,Jones 和 Gould(2000) 鉴定了一个包含开放解读码组的克隆,该开放解读码组以接近一致的过氧化物酶体靶向信号 1 基序 Ser-lys-val 终止。相应的基因被作者称为 PTE2,编码推导的 421 个氨基酸的蛋白质,预测分子量为 46.3 kD。 PTE2 与大鼠 Cte1 和大鼠 Mte1 的同一性分别为 76% 和 72.3%,与人 PTE1 的同一性仅为 19%(608123)。免疫荧光测定表明,人成纤维细胞中 Myc 标记的 PTE2 被导入过氧化物酶体并靶向过氧化物酶体腔,并且 PTE2 定位于 Zellweger 综合征皮肤成纤维细胞系的胞质溶胶,无法导入过氧化物酶体基质蛋白。
Hunt 等人通过搜索小鼠 Acot 基因的直系同源数据库,然后对肝脏总 RNA 进行 RT-PCR(2006)克隆了人类ACOT2。推导的 483 个氨基酸蛋白具有假定的 62 个氨基酸 N 端线粒体定位信号,随后是催化位点和其 C 端可能的过氧化物酶体靶向信号。如果没有线粒体定位信号,ACOT2 与 ACOT1(614313) 具有 98.6% 的氨基酸同一性。 Northern 印迹分析检测到 1.8 kb ACOT2 转录本在心脏、肝脏、骨骼肌和肾脏中高表达,而在胎盘和胰腺中表达较弱。荧光标记的 ACOT2 在转染的人成纤维细胞中显示出点状细胞质分布,并且使用线粒体追踪器证实了线粒体定位。
威斯汀等人(2004) 克隆了小鼠 Pte-Ia(Acot3),ACOT2 的同源物,并鉴定了 2 个剪接变体,命名为 5-prime-1 和 5-prime-2。 5-prime-1 变体含有额外的 11 个 N 端氨基酸。免疫荧光测定表明,Pte-Ia 被导入过氧化物酶体并定位于 Zellweger 综合征皮肤成纤维细胞系的胞质中。没有观察到 5-prime-1 变体的线粒体定位。 RT-PCR显示Pte-Ia在小鼠肾脏中高表达。在用过氧化物酶体增殖剂治疗和禁食后,野生型小鼠的肝脏中 Pte-Ia 上调,但 PPAR-α(170998) 缺失小鼠的肝脏中 Pte-Ia 没有上调。
▼ 基因功能
Jones 和 Gould(2000) 使用体外酶测定表明,重组 ACOT2 对中链和长链酰基辅酶 A 表现出高酰基辅酶 A 硫酯酶活性,最佳 pH 为 8.5。它对肉豆蔻酰辅酶 A 最为活跃,但对棕榈酰辅酶 A、硬脂酰辅酶 A 和花生酰辅酶 A 也表现出高活性。
威斯汀等人(2004) 报道小鼠 Pte-Ia 主要对长链酰基辅酶 A 有活性,不受游离辅酶 A 调节。
Hunt 等人通过分析重组人类蛋白(2006) 表明 ACOT1 和 ACOT2 具有相似的底物特异性,两种酶对 12 至 20 个碳原子的长链饱和酰基辅酶 A 和长链不饱和酰基辅酶 A,例如 C16:1-CoA 和C18:1-CoA。没有检测到具有 8 个或更少碳酰基辅酶 A 的 ACOT1 或 ACOT2 活性。
▼ 基因结构
亨特等人(2005)指出ACOT2基因包含3个编码外显子。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Hunt 等人(2006) 将 ACOT2 基因对应到染色体 14q24.3 上的 80 kb ACOT 基因簇。从着丝粒到端粒,基因的顺序是 ACOT1、ACOT2、ACOT4(614314) 和 ACOT6(614267)。他们将小鼠 Acot2 基因定位到 12D3 号染色体上类似的 Acot 基因簇,只不过小鼠 Acot 簇有 6 个基因。小鼠 Acot3 和 Acot5 基因没有人类直向同源物。
▼ 命名法
亨特等人(2005)建议对哺乳动物酰基辅酶A硫酯酶/水解酶的命名法进行修订,将Jones和Gould(2000)描述的PTE2重命名为ACOT2,并将Westin等人描述的小鼠Pte-Ia重命名(2004)作为Acot3。