原钙粘蛋白-β 1; PCDHB1
PCDH-β-1
HGNC 批准的基因符号:PCDHB1
细胞遗传学位置:5q31.3 基因组坐标(GRCh38):5:141,051,374-141,059,346(来自 NCBI)
▼ 说明
钙粘蛋白是钙依赖性细胞间粘附分子,原钙粘蛋白构成非经典钙粘蛋白的一个亚家族。 PCDHB1 是染色体 5q31 上 PCDHB 基因簇(604967) 16 个串联排列的基因之一。与 PCDHA(参见 604966)和 PCDHG(参见 604968)基因不同,它们的功能是“变量”。外显子剪接至下游恒定区外显子以产生 mRNA,PCDHB 基因不使用恒定区外显子来产生 mRNA。因此,每个单外显子 PCDHB 基因编码该蛋白的胞外、跨膜和短胞质结构域(Wu 等人,2001)。有关 PCDHB 基因的更多信息,请参阅 604967。
▼ 克隆与表达
Wu 和 Maniatis(1999) 通过对脑 cDNA 文库进行 PCR 克隆了全长 PCDHB1。
通过比较基因组序列分析,Wu 等人(2001) 表明人 PCDHB1 与小鼠 Pcdhb1 最为同源,后者位于最后一个 Pcdha 恒定区外显子下游 77 kb 处。小鼠 Pcdhb1 编码 818 个氨基酸的蛋白质,与人类蛋白质有 88% 的一致性。它具有一个信号肽、6 个典型的原钙粘蛋白胞外域、一个跨膜片段和一个短胞质结构域。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Wu 等人(2001) 将 PCDHB1 基因定位到染色体 5q31。他们将小鼠 PCDHB 基因定位于 18c 号染色体。