X 射线修复交叉互补 5; XRCC5
X 射线修复,补充缺陷,中国仓鼠,5
Ku 抗原,80-KD 亚基;Ku80
Ku86
HGNC 批准的基因符号:XRCC5
细胞遗传学位置:2q35 基因组坐标(GRCh38):2:216,109,348-216,206,293(来自 NCBI)
▼ 说明
人类 XRCC5 DNA 修复基因补充了放射敏感性突变体 xrs-6,该突变体源自中国仓鼠卵巢细胞,该细胞在 DNA 双链断裂修复方面存在缺陷,并且无法进行 V(D)J 重组。 XRCC5 基因编码 Ku 自身抗原的 80 kD 亚基,这是一种异二聚体,通过结合 DNA 双链断裂并促进非同源末端连接(NHEJ) 途径修复的能力,有助于基因组完整性。
▼ 克隆与表达
DNA 双链断裂是破坏 DNA 分子完整性的主要损伤。这种损害是由电离辐射造成的。啮齿类动物细胞中已鉴定出许多 DNA 双链断裂修复缺陷的突变体,并将其分为不同的互补组。一组突变体中存在缺陷的修复基因被命名为 XRCC5。 Jeggo 等人使用微细胞介导的染色体转移方法(1992) 通过转移人类 2 号染色体,实现了仓鼠 xrs 突变体修复缺陷的补充。这些细胞对电离辐射的敏感性及其重新连接辐射诱导的 DNA 双链断裂的能力受损,通过 2 号染色体得到了纠正。辐射敏感性的校正仅是部分的。在仅含有 2 号染色体长臂的 1 个杂交体中观察到互补。
塔乔利等人(1994) 通过遗传和生化方法表明,XRCC5 是 Ku 蛋白的 80 千道尔顿亚基。 Ku 与游离双链 DNA 末端结合,是 DNA 依赖性蛋白激酶的 DNA 结合成分。因此,Ku 蛋白参与 DNA 修复和 V(D)J 重组,并且 Ku-DNA 依赖性蛋白激酶复合物可能在这些相同过程中发挥作用。有关 Ku p70 亚基的讨论,请参见 152690。
▼ 基因功能
图特贾等人(1994) 从 HeLa 细胞中纯化出一种酶,他们称之为 DNA 解旋酶 II,一种 ATP 依赖性 DNA 解旋酶。他们证明它是 72 和 87 kD 多肽的异二聚体。测序表明它与 Ku 自身抗原相同。这种特定 DNA 解旋酶 II/Ku 抗原的唯一核位置、其对双链 DNA 的高度特异性亲和力、其丰度及其独特的 DNA 双链体解旋活性表明该分子在 DNA 代谢中的其他作用。
李等人(2002) 构建了包含 Ku86 基因座定向破坏的人类体细胞系。 Ku86 杂合的人结肠癌细胞单倍体不足,多倍体细胞增加,细胞增殖减少,p53 水平升高,并对电离辐射轻微超敏。第二个 Ku86 等位基因的功能失活导致细胞倍增时间大大缩短。这些细胞只能进行有限次数的细胞分裂,之后它们就会发生凋亡。这些实验证明 Ku86 基因座在人类体细胞组织培养细胞中至关重要。
Mari 等人使用人类和仓鼠细胞(2006)表明DNA末端的Ku异二聚体与溶液中的Ku70/Ku80处于动态平衡,表明NHEJ复合物的形成是可逆的。 DNA 双链断裂时 XRCC4(194363) 的积累取决于 Ku70/Ku80 的存在,但不依赖于 PRKDC(600899)。马里等人(2006) 发现 XRCC4 直接与 Ku70 相互作用,他们假设 XRCC4 作为 Ku70/Ku80 和 LIG4 之间的灵活系绳(601837)。
Guirouilh-Barbat 等人(2007) 研究了 Xrcc4 和 Ku80 缺失的 XR-1 CHO 细胞中的 NHEJ,并显示这些突变的影响存在差异。虽然由于使用双链断裂远端的微同源性,Xrcc4-null 细胞中存在显着的末端连接,但 NHEJ 的效率降低了。相比之下,Ku80的敲除几乎不影响末端连接的效率。然而,在两种突变细胞系中,末端连接的准确性都降低了。 Guirouilh-Barbat 等人(2007) 得出结论,KU80/XRCC4 途径是保守的,可以以有限的诱变为代价容纳非完全互补的末端。
罗伯茨等人(2010) 在体外和细胞中证明,NHEJ 对核苷酸损伤双链断裂的准确有效修复需要 5-prime-deoxyribose-5-磷酸/脱嘌呤/脱嘧啶(dRP/AP) 裂解酶活性。此外,经典定义的 NHEJ 在将这一末端清洁步骤与细胞连接相结合方面具有独特的有效性,有助于将该途径与其他稳健的替代 NHEJ 途径区分开来。 NHEJ 因子 Ku 被鉴定为有效的 5-prime-dRP/AP 裂解酶。与其他裂解酶类似,Ku 通过涉及希夫碱共价中间体与脱碱基位点的机制对脱碱基位点的 DNA 3 引物进行切口。罗伯茨等人(2010) 通过使用细胞提取物表明,Ku 对于有效去除双链断裂附近的 AP 位点至关重要,并且与此结果一致,在用裂解酶减弱的 Ku 补充的细胞中,此类断裂的连接特别减少突变体。虽然 Ku 之前被认为只能识别目的并招募其他处理目的的因素,但 Roberts 等人的数据(2010) 也支持 Ku 在最终处理步骤中发挥意想不到的直接作用。
▼ 生化特征
晶体结构
沃克等人(2001) 分别以 2.7 埃和 2.5 埃的分辨率确定了单独的人类 Ku 异二聚体和与 55 核苷酸 DNA 元件结合的人类 Ku 异二聚体的晶体结构。 Ku70 和 Ku80 具有共同的拓扑结构,并形成二元对称分子,并具有围绕双链 DNA 的预成型环。结合位点可以支撑 2 个完整的 DNA 圈,同时仅环绕中心 3-4 个碱基对。 Ku 不与 DNA 碱基接触,也很少与糖磷酸骨架接触,但它在空间上适合主要和次要凹槽轮廓,以便将 DNA 螺旋定位在穿过蛋白质环的确定路径中。沃克等人(2001) 得出的结论是,这些特征经过精心设计,可以在结构上支持断裂的 DNA 末端,并在末端处理和连接过程中使 DNA 螺旋进入跨连接处的相位。
▼ 测绘
陈等人(1992) 使用体细胞杂交分析和通过荧光原位杂交(FISH) 分析的微细胞介导的染色体转移将 XRCC5 基因分配给 2p。他们得出的结论是,该位置可能在 2p21 到 2p12 之间。对于 XRCC5 基因的区域作图,Chen 等人(1994) 在仅包含人类 2 号染色体片段的突变背景中构建了一组 X 射线杂交体和一组微细胞介导的 2 号染色体杂交体。通过使用 FISH、染色体显带和这些 X 射线杂交体的物理作图,他们将 XRCC5 基因定位于 2q35。分离分析进一步证实了这一结果,表明修复良好的杂交体的抗辐射表型与人类 2q35 染色体片段共分离。小池等人(1996) 将同源基因定位到小鼠 1 号染色体和大鼠 9 号染色体。
布朗特等人(1995) 为包含 XRCC5 的 2q33-q34 区域组装了 YAC 重叠群。
▼ 动物模型
迪菲利潘托尼奥等人(2000) 证明缺乏 Ku80 的小鼠细胞显示染色体畸变显着增加,包括断裂、易位和非整倍性。尽管观察到染色体不稳定,Ku80 -/- 小鼠的癌症发病时间仅稍早一些。 p53(191170) 的缺失与 Ku80 协同促进肿瘤发生,使得所有 Ku80 -/-/p53 -/- 小鼠在 3 个月龄前死于播散性亲 B 细胞淋巴瘤。肿瘤是由一组特定的染色体易位和涉及 IgH 和 c-Myc 的基因扩增引起的,让人想起伯基特淋巴瘤(113970)。迪菲利潘托尼奥等人(2000) 得出结论,Ku80 是一种看护基因,通过抑制染色体重排的机制维持基因组的完整性。
库德尔等人(2004) 创建了 Rad54(604289)/Xrcc5 双突变小鼠,并确定同源重组和非同源末端连接成分协同修复 DNA 损伤。双突变小鼠的组织和细胞显示出自发的 DNA 损伤。作者得出的结论是,即使是轻微的修复缺陷也会在其他突变的背景下产生深远的影响。