蛋白质酪氨酸磷酸酶,受体型,α; PTRA
PTP-α; PTPA
RPTPase-α
LCA 相关磷酸酶; LRP
HGNC 批准的基因符号:PTPRA
细胞遗传学位置:20p13 基因组坐标(GRCh38):20:2,864,184-3,038,669(来自 NCBI)
▼ 说明
重要的细胞功能,例如细胞增殖和信号转导,部分受到蛋白酪氨酸激酶(PTK;参见 147795)和蛋白酪氨酸磷酸酶(PTPases;EC 3.1.3.48)活性之间的平衡调节。 PTPase 可分为 2 类:包含单个保守 PTPase 结构域的小型可溶性酶,例如 T 细胞蛋白酪氨酸磷酸酶(PTPT;176887),以及包含 2 个串联 PTPase 结构域的更大、更复杂的受体连接 PTPase。 PTPRA 属于后一组,其中还包括白细胞共同抗原(LCA 或 PTPRC;151460)和白细胞抗原相关酪氨酸磷酸酶(LAR 或 PTPRF;179590)(Kaplan 等人(1990) 总结)。
▼ 克隆与表达
Jirik 等人通过使用与小鼠 Ptprc 的 PTPase 结构域相对应的探针筛选肝母细胞瘤细胞系 cDNA 文库(1990) 克隆了人类 PTPRA,他们将其称为 LRP。预测的 793 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 87.5 kD(未糖基化)。该蛋白包含一个前导肽,随后是一个 121 个残基的胞外结构域、一个跨膜片段和 2 个串联的胞质内催化结构域。胞外区有 8 个潜在的 N-糖基化位点和多个 O-糖基化位点。 Northern 印迹分析在所有检查的人类细胞系中检测到 2 个 3.0 至 3.5 kb 的 LRP 转录本。在小鼠组织和细胞系中也检测到普遍表达。
Krueger 等人通过用果蝇 Ptp 筛选人胎盘 cDNA 文库(1990) 克隆了几种 PTPase,包括 PTPRA,他们将其称为 PTP-α。推导的 793 个氨基酸蛋白具有 N 末端信号肽,随后是胞外结构域、跨膜片段和含有重复 PTPase 样结构域的胞质区域。 PTP-α 富含丝氨酸和苏氨酸,并具有多个潜在的 N-糖基化位点。
Kaplan 等人通过使用白细胞共同抗原(LCA 或 PTPRC;151460)探针筛选人脑干 cDNA 文库(1990) 克隆了 PTPRA,他们将其称为 RPTPase-α。推导的蛋白质含有802个氨基酸。在细胞外结构域之外,存在一些变异性,人 PTPRA 与小鼠 Ptpra 仅在 5 个氨基酸上不同。 Northern 印迹分析在各种人类细胞系和组织中检测到 4.3-和 6.3-kb 转录本,较大的转录本在胎儿组织中更为普遍。
马修斯等人(1990) 克隆了小鼠 Ptpra,他们将其称为 Lrp。推导的 793 个氨基酸的蛋白质具有 N 末端前导序列,随后是胞外结构域、跨膜区域和具有 2 个保守酪氨酸磷酸酶催化结构域的胞质结构域。预计细胞外区域是高度糖基化的。马修斯等人(1990) 还鉴定了一种 Lrp 剪接变体,其中包含保留阅读框但破坏第一个酪氨酸磷酸酶结构域的插入。 RNA 转移印迹分析检测到 Lrp 在小鼠组织中广泛表达。
▼ 基因功能
Krueger 等人使用在大肠杆菌中表达的人 PTP-α 的细胞质片段(1990) 证实 PTP-α 对磷酸化测试底物具有强大的 PTPase 活性。
▼ 测绘
Jirik 等人通过对啮齿动物与人类体细胞杂交的研究(1990) 将 PTPRA 基因定位到染色体 20p13。位于 20 号染色体上的其他家族成员包括 SRC(190090)、HCK(142370) 和 PTP1B(176885)。卡普兰等人(1990) 通过分析啮齿动物-人类体细胞杂交体中的分离模式,将 PTPRA 基因定位于染色体 20pter-20q12。拉奥等人(1992) 通过放射性和荧光原位杂交将 PTPA 定位到染色体 20p(20pter-p12) 的远端部分。 Jirik 等人通过原位杂交(1992) 将 PTPA 基因定位于染色体 20p13。
施尼特格等人(1992) 将小鼠 Ptpra 基因定位到 2 号染色体,证实了人类 20 号染色体与小鼠 2 号染色体远端片段之间的特殊同源性。