RALBP1 相关 EPS 结构域蛋白 1; REPS1
HGNC 批准的基因符号:REPS1
细胞遗传学位置:6q24.1 基因组坐标(GRCh38):6:138,903,493-138,988,253(来自 NCBI)
▼ 说明
REPS1 基因编码参与内吞作用和囊泡转移的蛋白质(Drecourt 等人总结,2018)。
▼ 克隆与表达
Xu 等人通过对从人胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行大规模测序,然后进行数据库分析(2001) 鉴定了小鼠 Reps1 的人类直系同源物。推导的 744 个氨基酸的 REPS1 蛋白的计算分子量为 85 kD。它具有一个包含 2 个 EF 手基序的中央 EPS15(600051) 同源(EH) 结构域,后面是 2 个富含脯氨酸的基序。小鼠和人类 REPS1 具有 83% 的氨基酸同一性。 Northern 印迹分析检测到,在所有 16 个受检查的人体组织中,大约 2.8 kb REPS1 转录物的表达存在差异,其中心脏和睾丸中的表达最高。
库利斯等人(2002) 表明,荧光标记的小鼠 Reps1 与大鼠 Rab11fip2(608599) 共定位于转染 NIH3T3 细胞核周区域的核内体回收处。
▼ 基因功能
通过酵母 2 杂交和突变分析,Cullis 等人(2002) 表明小鼠 Reps1 的分离 EH 结构域与大鼠 Rab11fip2 的 NPF 基序相互作用。这两种蛋白似乎共同发挥作用,抑制 Egf 受体(EGFR; 131550) 的再循环,但不抑制转铁蛋白受体(TFRC; 190010) 的再循环。 Reps1 和 Rab11fip2 还与主要网格蛋白接头复合物 AP2 的 α-adaptin(AP2A1; 601026) 亚基共沉淀。
▼ 基因结构
徐等人(2001) 确定 REPS1 基因包含 20 个外显子,跨度超过 44 kb。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Xu 等人(2001) 将 REPS1 基因定位到染色体 6q23.1-q24.1。
▼ 分子遗传学
Drecourt 等人在 2 名姐妹中发现,她们的父母无血缘关系,患有神经退行性病变并伴有脑铁积累 7(NBIA7;617916)(2018) 鉴定了 REPS1 基因中的复合杂合错义突变(V78L,614825.0001 和 A113E,614825.0002)。两种突变均发生在 EH1 结构域,这是一个与 RALBP1(605801) 相互作用形成内体回收区室的保守区域。这些变异是通过外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。与对照相比,与铁一起孵育时,患者成纤维细胞的细胞铁含量显着增加(10 至 30 倍的变化),并且野生型 RESP1 能够将铁含量恢复到对照水平。为了响应高铁,患者细胞的转铁蛋白受体(TFRC; 190010) mRNA 水平出现正常且适当的降低,但患者细胞中 TFRC 的量并未减少,这表明 TFRC 的翻译后溶酶体降解受损。与对照组相比,患者细胞的转铁蛋白(190000) 和 TFRC 转移和回收受损,在表面和核周区域聚集,以及溶酶体异常增大。患者细胞还表现出 TFRC 棕榈酰化减少,这是调节 TFRC 内吞作用所必需的。添加抗疟药青蒿酯可挽救异常的 TFRC 棕榈酰化并降低培养的患者成纤维细胞中的铁含量。由于其他 NBIA 相关基因的突变,在对 NBIA 患者细胞的研究中也观察到了类似的结果。德雷库特等人(2018) 的结论是,某些形式的 NBIA 是由内体循环缺陷引起的,应被视为细胞转移障碍。
▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):
.0001 神经退行性伴脑铁积累 7(1 个家族)
REPS1,VAL78LEU
Drecourt 等人在 2 名姐妹中发现,她们的父母无血缘关系,患有神经退行性病变并伴有脑铁积累 7(NBIA7;617916)(2018) 鉴定了 REPS1 基因中的复合杂合错义突变:c.232G-C 颠换(c.232G-C,NM_001286611.1),导致 val78-to-leu(V78L) 取代,以及 c.338C - 颠换,导致 ala113-to-glu(A113E;614825.0002) 取代。两种突变均发生在 EH1 结构域,这是一个与 RALBP1(605801) 相互作用形成内体回收区室的保守区域。这些变异是通过外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。在 dbSNP、外显子组测序项目(ESP) 或 ExAC 数据库中均未发现 V78L 变体,而 A113E 在所有 3 个数据库中的发现频率较低(ExAC 中为 0.011%,ESP 中为 0.0001)。在 200 条对照染色体中未发现这两种变体。免疫印迹分析检测到患者成纤维细胞中存在少量 REPS1。
.0002 神经退行性伴脑铁积累 7(1 个家族)
RESP1,ALA113GLU(rs201191394)
讨论 RESP1 基因中的 c.338C-A 颠换(c.338C-A,NM_001286611.1),导致 ala113-to-glu(A113E) 取代,这种取代在 2 名患有神经变性的姐妹中以复合杂合状态发现脑铁积累 7(NBIA7;617916),Drecourt 等人(2018),参见 614825.0001。