内酰胺酶,β-2; LACTB2
包含 LACTB2/NCOA2 融合基因
HGNC 批准的基因符号:LACTB2
细胞遗传学位置:8q13.3 基因组坐标(GRCh38):8:70,637,266-70,669,185(来自 NCBI)
▼ 说明
LACTB2 是一种核编码的线粒体核糖核酸内切酶,属于金属-β-内酰胺酶(MBL) 超家族。 LACTB2 活性对于线粒体功能和细胞活力至关重要(Levy et al., 2016)。
▼ 克隆与表达
通过数据库分析,Levy 等人(2016) 将 LACTB2 鉴定为人类线粒体中的 MBL 蛋白。推导的 288 个氨基酸蛋白包含预测的 27 个氨基酸 N 端线粒体定位信号和 MBL 核心结构域。分级分离和色谱分析表明,内源性 LACTB2 作为可溶性单体蛋白定位于 HeLa 细胞的线粒体基质。
▼ 测绘
于等人(2016) 指出 LACTB2 基因对应到 8 号染色体。
Gross(2020) 根据 LACTB2 序列(GenBank AF151841) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 LACTB2 基因对应到染色体 8q13.3。
▼ 基因功能
Yu 等人利用结构和功能分析(2016) 证明人 LACTB2 是一种内切核糖核酸酶,优先使用其催化位点内的 Zn(2+) 离子切割单链 RNA 底物中嘌呤-嘧啶二核苷酸序列的 3-prime 末端。突变分析表明,延长的 RNA 结合位点在 LACTB2 RNA 降解活性中发挥着重要作用。 HEK293E 细胞中 LACTB2 的敲低导致显着的细胞损伤和形态变化,表明 LACTB2 对于线粒体功能和细胞活力很重要。 LACTB2 的敲低也导致线粒体转录本的适度积累,而 LACTB2 的过度表达则导致线粒体转录本的适度减少。
▼ 细胞遗传学
Yu 等人使用全基因组和转录组测序分析(2016) 在结直肠癌中发现了 LACTB2 基因的外显子 1 和 NCOA2 基因的外显子 22(601993) 之间的融合,两者都位于 8 号染色体上(CRC; 114500)。嵌合 DNA 结构还包含 VPS13B(607817) 的非编码内含子片段,该片段也位于 8 号染色体上的 LACTB2 和 NCOA2 之间,表明融合是通过复杂的染色体内重排产生的。 LACTB2/NCOA2 融合蛋白缺乏各自基因的主要功能域,表明功能丧失重排。在 99 例 CRC 病例中的 6 例(6.1%) 中检测到 LACTB2/NCOA2 转录物,并且 NCOA2 在 CRC 中下调,但 LACTB2 没有。 NCOA2 表达抑制 Wnt(参见 606359)信号传导并发挥肿瘤抑制功能,而 LACTB2/NCOA2 融合蛋白在相同条件下缺乏这些作用。