泛素特异性蛋白酶 4; USP4
泛素特异性蛋白酶;UNP
HGNC 批准的基因符号:USP4
细胞遗传学位置:3p21.31 基因组坐标(GRCh38):3:49,277,144-49,340,053(来自 NCBI)
▼ 说明
泛素特异性蛋白酶(UBP) 是一组去泛素化酶,具有 2 个特征基序:Cys 框和 His 框(Frederick 等人总结,1998)。
▼ 克隆与表达
古普塔等人(1993) 分离出编码 Unp 的小鼠 cDNA,Unp 是一种与人类 TRE 癌基因相似的蛋白质。 Gupta 等人使用蛋白质印迹法(1994) 发现 Unp 的表观分子质量为 180 kD。他们报告说,Unp 的过度表达导致注射到无胸腺小鼠体内的 NIH 3T3 细胞发生致癌转化。
Gray 等人通过用鼠 Unp cDNA 筛选人类额叶皮层文库(1995) 分离出编码人类 UNP 的 cDNA。对克隆的分析揭示了一个大的开放读码,有可能编码 854 个氨基酸、分子量为 97 kD 的蛋白质。人类和小鼠蛋白质具有 90% 的序列同一性。原发性肺肿瘤样本的 Northern 印迹分析表明,相对于正常成人肺,小细胞癌和腺癌中 UNP mRNA 的水平升高。
弗雷德里克等人(1998) 对其他 UNP cDNA 进行了测序,发现与 Gray 等人报道的序列存在一些差异(1995),包括 2 个单核苷酸插入,将预测蛋白 UNPEL(UNP 扩展长亚型)的长度增加到 963 个氨基酸。他们还回收了编码较短亚型(称为 UNPES)的 cDNA。两种亚型均表现出去泛素化活性。针对 UNP 的抗体在蛋白质印迹上检测到 2 种 105 至 110 kD 的蛋白质。 Frederick 等人利用表达表位标记的 UNP 的哺乳动物细胞的免疫细胞化学和细胞分级分离研究(1998)证明人类蛋白质的两种亚型主要位于细胞质中(在勘误表中,Frederick 等人(1998)引用了来自 Gray 实验室的个人通讯,指出 Gupta 等人(1993)在哺乳动物细胞提取物的核部分中定位 Unp 的数据显然是错误的。) Northern blot分析显示,在所有测试的组织中,UNP 表达为紧密迁移的 mRNA 簇。然而,作者没有发现小细胞肺癌细胞系中 UNP 转录物过度表达的证据。
▼ 基因结构
迪弗鲁西奥等人(1998) 报道小鼠 Unp 基因包含 22 个外显子,分布超过 47 kb。在第三个内含子中鉴定出经过加工的核糖体 S2 假基因。
▼ 测绘
通过对种间回交的分析,Gupta 等人(1993) 将 Unp 基因定位到小鼠 9 号染色体上的一个区域,该区域显示出与人类 3p 号染色体同线性的同源性。
通过荧光原位杂交,Gray 等人(1995) 将人类 UNP 基因定位到 3p21.3,该区域与肺部肿瘤有关。 Frederick 等人使用相同的技术(1998) 将地图位置细化为 3p21.31。