尿苷二磷酸糖基转移酶 2 家族,成员 B28; UGT2B28
HGNC 批准的基因符号:UGT2B28
细胞遗传学位置:4q13.2 基因组坐标(GRCh38):4:69,280,475-69,295,050(来自 NCBI)
▼ 正文
有关 UDP 糖基转移酶(UGT) 基因家族的背景信息,请参阅 UGT1A1(191740)。 UGT2B 糖基转移酶催化葡萄糖醛酸转移到大量内源性化合物,特别是类固醇,以促进它们从靶细胞中消除。
▼ 克隆与表达
Levesque 等人通过使用 UGT2B4(600067)、UGT2B7(600068) 和 UGT2B15(600069) 探针库筛选前列腺癌 cDNA 文库,然后进行 RT-PCR 分析(2001)分离出编码UGT2B28 3种亚型的cDNA,他们将其命名为UGT2B28 I型、II型和III型。序列分析预测,由 529 个氨基酸组成的 I 型蛋白(分别与 UGTB10(600070) 和 UGT2B11(603064) 具有 89% 和 95% 的同一性)包含内质网(ER) 靶向信号,即膜锚定区,以及底物和辅因子结合域。 335 个氨基酸的 II 型异构体缺乏 UDPGA 结合域和跨膜区。 412 个氨基酸的 III 型亚型在其 C 末端保留了跨膜区,但缺乏底物结合结构域。所有 3 种类型仅具有 1 个 N 连接糖基化位点。蛋白质印迹分析显示 52-、35-和 42-kD 蛋白的表达,分别对应于 I、II 和 III 型 UGT2B28 蛋白。 Northern印迹分析显示UGT2B28 I型、II型和III型转录物分别为1.6、1.4和1.3 kb,在肾细胞系中表达。 RT-PCR 分析在肝脏和乳腺中检测到了所有 3 种形式。 III 型也在其他几种组织和乳腺癌细胞系中表达。功能分析表明 I 型 UGT2B28 具有类固醇底物的葡萄糖醛酸化能力,但 II 型或 III 型则不然。免疫荧光分析证明所有 3 种类型均在核周结构和 ER 中表达,并与蛋白质二硫键异构酶(P4HB;176790) 共定位。
▼ 基因结构
Levesque 等人通过筛选 PAC 基因组文库(2001)确定UGT2B28基因至少含有5个外显子。
▼ 测绘
Levesque 等人通过筛选 PAC 基因组文库(2001) 确定 UGT2B28 基因对应到 4 号染色体,其他 UGT2B 基因聚集在该染色体上。
▼ 群体遗传学
Menard 等人使用 100 名健康、无血缘关系的白人志愿者的 DNA(2009) 描述了常见的 UGT2B17(601903) 和 UGT2B28 缺失,并观察到 UGT2B17 和 UGT2B28 的拷贝数变异(CNV) 在白种人中发生率分别为 27% 和 13.5%,其中 43% 携带两个基因的 2 个拷贝,57% 携带两个基因拷贝。至少有 1 个删除。 UGT2B17 和 UGT2B28 的 CNV 与 UGT2B15 基因(600069) 中的 D85Y 多态性(rs1902023) 共现,产生 7 种不同的单倍型。作者得出结论,在不评估 UGT2B28 和 UGT2B15 中的 D85Y 变异的情况下分析 UGT2B17 的 CNV 可能会高估或低估每个基因的表型影响。