具有序列相似性的家族53,成员B; FAM53B
SIMPLET、MEDAKA、同系物
KIAA0140
HGNC 批准的基因符号:FAM53B
细胞遗传学位置:10q26.13 基因组坐标(GRCh38):10:124,619,292-124,744,378(来自 NCBI)
▼ 说明
Simplet 是 FAM53B 的青鳉直系同源物,在发育过程中调节细胞增殖和运动(Thermes 等,2006)。
▼ 克隆与表达
Nagase 等人通过对从大小分级的人 KG-1 细胞系 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,(1995) 获得了部分 FAM53B 克隆,他们将其命名为 KIAA0140。 Northern 印迹分析在检查的所有人体组织和细胞系(肝脏除外)中检测到 KIAA0140。在骨骼肌中检测到最高表达。
泰尔梅斯等人(2006) 克隆了青鳉 Fam53b,由于 smp 敲低青鳉胚胎的出现,他们将其称为 simplet(smp)(参见动物模型)。推导的 407 个氨基酸蛋白有 2 个高度保守的区域,每个区域都有一个 14-3-3 蛋白(参见 YWHAB,601289)结合基序。第二个保守区域也具有核定位信号。青鳉胚胎的整体原位杂交和实时 PCR 检测到从中囊胚转变开始的 smp 表达,其中它主要定位于中枢神经系统和发育体节的多能和增殖细胞。数据库分析在脊椎动物中检测到 smp 直系同源物,但在无脊椎动物(包括脊索动物)中未检测到。
▼ 基因功能
Thermes 等人通过酵母 2-杂交分析人脑 cDNA 文库,然后进行测序(2006) 发现 FAM53B 与 14-3-3 家族的几个成员相互作用,包括 YWHAB、YWHAZ(601288) 和 YWHAE(605066)。 FAM53B(但不是青鳉 smp)也与 SKIIP(603055) 相互作用。
▼ 测绘
Nagase 等人通过对人类/啮齿动物杂交组进行 PCR 检测(1995) 将 FAM53B 基因定位到 10 号染色体。
Hartz(2017) 根据 FAM53B 序列(GenBank D50930) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 FAM53B 基因对应到染色体 10q26.13。
▼ 动物模型
泰尔梅斯等人(2006) 发现青鳉胚胎中 smp 的敲低会导致胚胎变小并延迟胚胎发育,并导致异常大细胞在背侧积累。在极端情况下,受影响的胚胎异常异常,以至于无法确定其发育阶段。由于这种表型,作者将这个基因称为“simplet”,即《白雪公主》中愚蠢的侏儒 Dopey 的法语名字。 smp 的敲低不会干扰胚胎模式,也不会诱导细胞凋亡,但 smp 变形细胞会减少培养物中的细胞增殖和迁移。 smp 的过度表达会扰乱原肠胚形成,有时会延迟原肠胚形成,导致早期体细胞分裂过程中的体轴异常,并导致中脑和后脑缺陷。