酰基辅酶A结合域含有蛋白5; ACBD5
KIAA1996
HGNC 批准的基因符号:ACBD5
细胞遗传学位置:10p12.1 基因组坐标(GRCh38):10:27,182,838-27,242,111(来自 NCBI)
▼ 说明
酰基辅酶A结合蛋白,例如ACBD5,在长链酰基辅酶A的隔离、转移和分布中发挥作用,并且可以作为信号分子参与细胞代谢和基因调控(Punzo等人,2010)。
▼ 克隆与表达
Ohara 等人通过对从大小分级的人脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(2002) 获得了部分 ACBD5 克隆,他们将其命名为 KIAA1996。推导的 437 个氨基酸序列与 Bos taurus 内氮平相关蛋白前体具有显着的一致性。 RT-PCR ELISA 检测到所有成人和胎儿组织中都有不同的 KIAA1996 表达,其中成人大脑中的表达水平最高。在所检查的所有特定成人大脑区域中均检测到表达,并且在黑质中最高。
蓬佐等人(2010) 报道 ACBD5 的预测分子量为 54.7 kD。定量 RT-PCR 检测到所有检查的正常血细胞类型中 ACBD5 的表达。
八吉田等人(2017) 报道人类 ACBD5 同工型 2 含有 490 个氨基酸。它的 N 末端有一个酰基辅酶 A 结合结构域(ACBD),C 末端有一个卷曲螺旋结构域和一个单跨膜结构域。
▼ 基因结构
蓬佐等人(2010)确定ACBD5基因包含13个外显子。
▼ 测绘
蓬佐等人(2010) 指出 ACBD5 基因定位在标记 D10S586 和 D20S611 之间,定位于染色体 10p12.1(Hartz, 2015)。
▼ 基因功能
八吉田等人(2017) 表明,人 ACBD5 是一种过氧化物酶体膜蛋白,其 N 端 ACBD 暴露于细胞质,C 端单跨膜结构域介导过氧化物酶体靶向和膜锚定。 ACBD5 的缺失并不影响人皮肤成纤维细胞中过氧化物酶体的生物合成,但它会损害超长链脂肪酸(VLCFA) 的过氧化物酶体 β 氧化。 HeLa 细胞中的敲除分析表明,ACBD5 优先与 VLC-CoAs 结合,并直接介导 VLCFA 的过氧化物酶体 β 氧化,其中 ACBD 和 ACBD5 的过氧化物酶体定位至关重要。
费迪南杜斯等人(2017) 使用 CRISPR-Cas9 基因编辑在 HeLa 细胞中引入 ACBD5 缺陷,并观察到异常的 VLCFA 谱,C26:0 水平增加、C26:0/C22:0 比率增加,以及 C26:0 溶血磷脂酰胆碱增加。此外,在 ACBD5 缺陷的 HeLa 细胞中,C26:0 β-氧化活性降低,加载 D3-C22:0 导致 D3-C26:0 积累。作者得出结论,ACBD5 缺乏会导致过氧化物酶体 VLCFA 代谢受损。
▼ 分子遗传学
Abu-Safieh 等人在来自沙特近亲家庭的 3 名患有视网膜营养不良和脑白质营养不良(RDLKD; 618863) 的同胞中(2013) 鉴定了 ACBD5 基因(616618.0001) 中的剪接突变的纯合性,该突变与疾病分离,并且在 160 个沙特外显子组、190 个对照或外显子组变异服务器数据库中未发现。
Ferdinandusse 等人在一位患有视网膜营养不良和脑白质营养不良的阿拉伯联合酋长国女孩中,表现出 C26:0 过氧化物酶体 β 氧化受损,但 ACOX1(609751) 和 ABCD1(300371) 基因突变呈阴性(2017) 对候选基因 ACBD5 进行了测序,并鉴定了与家族中疾病分离的缺失/插入突变(616618.0002) 的纯合性。
▼ 历史
尽管 Punzo 等人。 Pippucci 等人(2010) 在一个患有常染色体显性血小板减少症的意大利大家族(R 家族)中鉴定出 ACBD5 基因(H8Y) 中的杂合错义变异,与染色体 10p12 相关(参见 THC2, 188000)(2011) 确定该家族的疾病是由染色体 10p12-p11.1 上 ANKRD26 基因启动子区域的杂合突变引起的(610855.0001)。
▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):
.0001 视网膜营养不良伴脑白质营养不良
ACBD5,1205+1G-A
Abu-Safieh 等人在来自沙特近亲家庭(CRSPW) 的 3 名患有视网膜营养不良伴脑白质营养不良(RDLKD; 618863) 的同胞中(2013) 鉴定了 ACBD5 基因中剪接供体位点转换(c.1205+1G-A, NM_145698.3) 的纯合性,预计会引起移码,导致过早终止密码子(Gly402AspfsTer5)。该突变在家族中随疾病分离,在 160 个沙特外显子组、190 个直接测序的沙特对照或外显子组变异服务器数据库中均未发现。蛋白质印迹分析显示没有证据表明预期的较小条带代表截短的蛋白质,这表明该突变导致蛋白质严重不稳定,因此可以被视为无效等位基因。
.0002 视网膜营养不良伴脑白质营养不良
ACBD5、DEL/INS、NT626
Ferdinandusse 等人在一名来自阿拉伯联合酋长国患有视网膜营养不良和脑白质营养不良(RDLKD; 618863) 的女孩中(2017) 鉴定了缺失/插入突变(c.626-689_937-234delins936+1075_c.936+1230inv) 的纯合性,导致外显子 7 和 8 缺失,并预计会导致过早终止密码子(Asp208ValfsTer30)。她的近亲父母都是突变杂合子。免疫印迹和免疫荧光分析表明患者成纤维细胞中不存在 ACBD5。在用野生型 ACBD5 转染的患者成纤维细胞中,受损的极长链脂肪酸(VLCFA) 代谢得到挽救,C26:0 溶血磷脂酰胆碱、D3-C28:0 和 D3-C26:0 水平显着降低,并且显着降低。未标记的 C26:0 减少,C26:0/C22:0 比率减少。