抑癌亚染色体可转移片段候选基因 4; TSSC4
抑癌 STF cDNA 4
HGNC 批准的基因符号:TSSC4
细胞遗传学位置:11p15.5 基因组坐标(GRCh38):11:2,400,750-2,403,876(来自 NCBI)
▼ 说明
TSSC4 基因是一种非印迹肿瘤抑制基因,位于染色体 11p15.5 上的印迹基因域中(Lee 等,1999)。
▼ 克隆与表达
由于 11p15 上有大量印记基因,跨度约为 1 Mb,因此该区域似乎代表人类基因组中 2 个已知大印记结构域中的一个,另一个是 15q11-q13 的 Prader-Willi/Angelman 综合征结构域(参见105830)。锦鲤等人(1993) 分离出一种亚染色体可转移片段(STF),该片段可抑制横纹肌肉瘤细胞系 RD 的体外生长,证实该区域内存在 1 个或多个肿瘤抑制基因。胡等人(1997) 发现 STF 跨度约为 2.5 Mb,其中 D11S12 位于其近端,D11S1318 位于其远端。在该 STF 的一组印记基因中,Lee 等人(1999) 鉴定了 2 个新基因,命名为 TSSC4 和 TSSC6(603853),它们在所检查的任何胎儿或胚胎外组织中都没有印记。 TSSC4 cDNA 编码一个由 349 个氨基酸组成的预测蛋白质,该蛋白质与之前报道的蛋白质没有密切的相似性。 Northern 印迹分析显示,TSSC4 基因在胎儿脑、肺、肝脏和肾脏中以大约 1.6 kb 的转录本表达。 TSSC4 和 TSSC6 基因均位于 11p15 上 1 Mb 印记域的中心,其中包含 7 个印记基因。因此,11p15 的印记基因结构域似乎包含至少 2 个印记子结构域,在这两个子结构域之间,TSSC4 和 TSSC6 基因由于缺乏初始沉默或印记的早期发育松弛而基本上逃脱了印记。
▼ 其他特点
李等人(1999) 指出,在 11p15 上已鉴定出 7 个印记基因:IGF2(147470),它编码癌症中重要的自分泌生长因子; H19(103280),一种非翻译 RNA,其印记调节 IGF2; ASCL2(601886),果蝇 achaete-scute 的同源物,在滋养层中表达; KCNQ1(607542),编码电压门控钾通道; p57(KIP2)(CDKN1C; 600856),编码细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂; TSSC5(IMPT1;602631),编码预测的跨膜转运蛋白; TSSC3(602131),也称为 IPL,是小鼠凋亡诱导基因的同源物。除 IGF2 外,所有这些基因均由母体等位基因表达。