锌指蛋白 668; ZNF668

HGNC 批准的基因符号:ZNF668

细胞遗传学位置:16p11.2 基因组坐标(GRCh38):16:31,060,847-31,074,240(来自 NCBI)

ZNF668 是 DNA 修复的调节剂,是 DNA 损伤反应的一部分。 ZNF668 还促进 DNA 损伤诱导的 p53 激活和稳定(TP53; 191170)(Hu et al., 2013)。

▼ 克隆与表达

胡等人(2011) 在推导的 619 个氨基酸 ZNF668 蛋白中鉴定出 2 个 N 末端核定位信号。免疫印迹分析和免疫荧光显微镜显示,ZNF668 蛋白定位于细胞核,在核仁中积累,并与人乳腺癌细胞中的核仁蛋白 NPM(164040) 和 nucleostemin(GNL3; 608011) 共定位。

▼ 基因功能

通过免疫印迹分析和免疫沉淀,Hu 等人(2011) 证实 ZNF668 与人乳腺癌和骨肉瘤细胞中的 NPM 和 nucleostemin 相互作用。 ZNF668 还与 p53 及其负调节因子 MDM2 相互作用(164785)。突变分析表明,ZNF668 通过其 N 端一半区域结合 MDM2 和 p53,这些区域也是 ZNF668 核仁定位所必需的。 ZNF668 通过破坏 MDM2 介导的 p53 泛素化和降解来调节 p53 稳定性和活性。 ZNF668 的过表达可抑制乳腺癌细胞系的增殖,并以 p53 依赖性和非依赖性方式阻止小鼠肿瘤形成。胡等人(2011) 得出结论,ZNF668 是调节 p53 稳定性的乳腺肿瘤抑制基因。

胡等人(2013) 发现,用针对 ZNF668 的小干扰 RNA(siRNA) 治疗的人骨肉瘤细胞在电离辐射(IR) 治疗后的存活率低于对照组。彗星分析显示,用 IR 和 ZNF668 siRNA 处理的细胞中 DNA 损伤增加,修复效率降低。与对照组相比,ZNF668 敲低细胞的同源重组(HR) 率显着降低,并且可以通过重新引入 ZNF668 来恢复 HR 效率。 ZNF668 介导的双链断裂(DSB) 修复孤立于 ATM(607585) 和 CHK2(604373) 途径。 ZNF668 促进 TIP60(KAT5; 601409) 介导的 H2AX(H2AFX; 601772) lys5 乙酰化和染色质松弛。 ZNF668 还促进紫外线诱导的 DNA 损伤位点的 RPA(179835) 激活。胡等人(2013) 得出结论,ZNF668 将染色质松弛与 DNA 修复控制中的 DNA 损伤反应联系起来。

▼ 测绘

Gross(2016) 根据 ZNF668 序列(GenBank BC021997) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 ZNF668 基因对应到染色体 16p11.2。

▼ 分子遗传学

Shaheen 等人发现,一名男性婴儿(患者 13DG0784)由沙特阿拉伯近亲出生,患有神经发育障碍,生长不良、耳朵大、面容畸形(NEDGEF; 620194)(2016) 鉴定出 ZNF668 基因中的纯合无义突变(Q319X; 617103.0001)。该突变是通过自合性作图和外显子组测序发现的。没有对该变体进行功能研究。

2 个兄弟姐妹,出生于土耳其近亲父母(家庭 2),包括 NEDGEF、Alsaif 等人(2021) 鉴定了 ZNF668 基因中的纯合无义突变(R371X; 617103.0002)。成纤维细胞源自其中 1 名患者以及 Shaheen 等人报道的患者(2016) 表明,与对照组相比,辐射后 DNA 损伤和修复受损,细胞活力下降。研究结果表明,这种疾病是由于 DNA 损伤和修复机制的功能异常造成的。

▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):

.0001 神经发育障碍,伴有生长不良、耳朵大和面容畸形
ZNF668、GLN319TER

Shaheen 等人发现,一名男性婴儿(患者 13DG0784)由沙特阿拉伯近亲出生,患有神经发育障碍,生长不良、耳朵大、面容畸形(NEDGEF; 620194)(2016) 在 ZNF668 基因中鉴定出纯合 c.955C-T 转换(c.955C-T, NM_001172668),导致 gln319 到 ter(Q319X) 的取代。该突变是通过自合性作图和外显子组测序发现的。该患者有一个患有类似疾病的兄弟,他在 3 周大时死亡;无法从该患者身上获得 DNA。没有对该变体进行功能研究。

阿尔赛夫等人(2021) 提供了 Shaheen 等人报告的患者的随访情况(2016),指出患者在 13 个月大时死亡。使用针对 N 末端的抗体对患者成纤维细胞进行免疫染色,结果显示 ZNF668 完全缺失,与 ZNF668 缺陷一致,并且与对照相比,辐射后 DNA 损伤和修复受损。这些发现与患者细胞活力下降有关。

.0002 神经发育障碍,伴有生长不良、耳朵大和面部畸形
ZNF668、ARG371TER

Alsaif 等人在 2 名同胞中,由近亲土耳其父母出生(家庭 2),患有神经发育障碍,生长不良、耳朵大和面容畸形(NEDGEF; 620194)(2021) 在 ZNF668 基因中鉴定出纯合 c.1111C-T 转换(c.1111C-T,NM_024706),导致 arg371 到 ter(R371X) 取代。来自其中一名同胞的成纤维细胞的免疫染色显示 ZNF668 的核定位减少,这与 ZNF668 缺陷一致。与对照组相比,患者成纤维细胞在辐射后还表现出 DNA 损伤和修复受损以及细胞活力下降。