SKI 家族转录核抑制子 1; SKOR1
功能性 SMAD 抑制元件 15;FUSSEL15
LBX1 COREPRESSOR 1,小鼠,同系物; LBXCOR1
CORL1
HGNC 批准的基因符号:SKOR1
细胞遗传学位置:15q23 基因组坐标(GRCh38):15:67,825,509-67,834,582(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
水原等人(2005) 克隆了小鼠 Lbxcor1,他们将其称为 Corl1。推导的 936 个氨基酸蛋白具有 N 端富含半胱氨酸的区域,随后是 Corl 同源(CH1) 结构域和 C 端卷曲螺旋区域。小鼠组织的 RT-PCR 检测到胚胎脑中表达最高,其次是成年脑和睾丸。小鼠胚胎的原位杂交显示,Corl1 在脊髓中表达最高,其中 Corl1 在背角中间神经元中选择性表达。 Corl1 也在中脑-后脑边界后方的有丝分裂后神经元子集中表达。表位标记的 Corl1 定位于转染的人胚胎肾细胞的核点状结构中。
通过数据库搜索,Arndt 等人(2007) 鉴定了 SKOR1,他们将其称为 FUSSEL15。人类FUSSEL15蛋白含有921个氨基酸,计算分子量为100 kD,并含有一个具有进化保守的SAND基序的Ski同源结构域。人类 FUSSEL15 和 FUSSEL18(617138) 蛋白具有 86% 同源性,并形成 Ski/SnoN 亚家族,与该组的其他成员具有 28% 同源性。原位杂交显示Fussel15在小鼠神经系统中表达。 PCR 分析检测到 FUSSEL15 在成人小脑中表达,但在胚胎脑中未检测到。在人小脑中,FUSSEL15在浦肯野细胞中表达,在浦肯野细胞体和分支树突中具有特定的表达模式。
▼ 基因功能
水原等人(2005) 表明小鼠 Corl1 与一般转录辅阻遏物相互作用,例如 Hdac1(601241)、Ctbp(CTBP1; 602618) 和 Grg1(TLE1; 600189),并且 Corl1 具有转录抑制活性。 Corl1 与 Lbx1(604255)(一种在背角中间神经元中选择性表达的同源域转录因子)相互作用,并与 Lbx1 合作抑制神经母细胞瘤细胞系中的转录。突变分析表明,Corl1 的 N 端和 C 端区域是与 Lbx1 相互作用所必需的,而 CH1 结构域是转录抑制所必需的。 Corl1 辅阻遏物活性不依赖于 Grg1,Grg1 也充当 Lbx1 辅阻遏物。水原等人(2005) 得出结论,CORL1 作为 LBX1 的转录辅阻遏物,调节背侧脊髓的细胞命运决定。
通过免疫沉淀分析,Arndt 等人(2007) 表明,像 FUSSEL18 一样,FUSSEL15 直接与 SMAD 蛋白相互作用,特别是 SMAD1(601595)、SMAD2(601366) 和 SMAD3(603109)。与 FUSSEL18 不同,FUSSEL15 对 TGF-β(190180) 信号传导只有很小的影响,而是拮抗骨形态发生蛋白(BMP;参见 112264) 信号传导途径,可能是通过其 SMAD 蛋白失活而实现的。
▼ 测绘
Hartz(2007) 根据 LBXCOR1 序列(GenBank AY669507) 与基因组序列(build 36.1) 的比对,将 LBXCOR1 基因对应到染色体 15q23。