微RNA LET7B; MIRLET7B

LET7,线虫,同源物,B; LET7B
miRNA LET7B
MIRNLET7B

HGNC 批准的基因符号:MIRLET7B

细胞遗传学位置:22q13.31 基因组坐标(GRCh38):22:46,113,686-46,113,768(来自 NCBI)

▼ 说明

MicroRNA(miRNA) 是一种小型非编码调节 RNA,可通过靶向特定 mRNA 来下调转录。 Let7 是 miRNA 家族的创始成员之一,首次在秀丽隐杆线虫中被发现。线虫 let7 有几种人类同源物,所有这些 LET7 miRNA 都具有相同的种子序列,这对于目标识别至关重要。在人类 LET7 miRNA 中,LET7B 和 LET7E(611250) 差异最大,有 4 个核苷酸差异。在人类、小鼠和线虫中,LET7 的表达在胚胎阶段几乎检测不到,但在分化后和成熟组织中表达增加(Lee 和 Dutta,2007)。有关 LET7 的更多信息,请参阅 LET7A1(605386)。

▼ 克隆与表达

Lagos-Quintana 等人使用定向克隆程序从 HeLa 细胞总 RNA 中克隆 miRNA(2001) 鉴定了秀丽隐杆线虫 let7 的 9 个人类同源物,包括 LET7B。 LET7B 序列是 UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU。

▼ 基因功能

Lee 和 Dutta(2007) 使用数据库分析、荧光素酶报告基因检测和诱变,在 HMGA2(600698) 的 3 素子 UTR 中确定了 6 个功能性 LET7 靶位点。作者用 LET7B 和 LET7E 的组合异位表达来代表所有 LET7 miRNA,减少了肺癌细胞系中 HMGA2 的表达和细胞增殖。相反,抑制 LET7 会诱导 HMGA2 mRNA 和蛋白质。没有 3-prime UTR 的 HMGA2 ORF 的过表达挽救了 LET7 对肺癌细胞的生长抑制作用。

急性淋巴细胞白血病(ALL) 是最常见的儿童癌症,而急性髓细胞白血病(AML; 601626) 是成人最常见的急性白血病。 Mi 等人使用全基因组 mRNA 表达分析(2007) 发现与 AML 相比,LET7B 在 ALL 中是下调的 miRNA。实时 PCR 证实,与 AML 样本和正常对照相比,所有样本中 LET7B 均下调。

塞尔巴赫等人(2008) 使用蛋白质组学方法 SILAC(“在细胞培养物中用氨基酸进行稳定同位素标记”)来测量数千种蛋白质合成因 miRNA 转染或内源 miRNA 敲低而发生的变化。与此同时,他们使用微阵列定量了 mRNA 水平。他们研究了减少 HeLa 细胞中 LET7B 表达的影响。其他分析研究了 HeLa 细胞中 miRNA 过度表达的影响。他们的数据表明,固定 LET7B 水平的上调和下调对蛋白质组具有很大程度上互补的作用,LET7B 水平有可能调节数千个基因的蛋白质生产。塞尔巴赫等人(2008) 观察到 Dicer(606241) 具有多个对目标识别至关重要的 LET7 3-prime UTR 种子,是 LET7B 敲低 SILAC 中上调最强烈的基因之一,但在微阵列数据中却没有。因此,他们认为 Dicer 可能是 LET7B 的直接翻译目标。这提出了 LET7B 可以调节成熟 mRNA 水平的可能性。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Lagos-Quintana 等人(2001) 将 MIRNLET7B 基因定位到 22 号染色体,距 MIRNLET7A3 基因(612143) 938 个核苷酸。米等人(2007) 指出 MIRNLET7B 基因对应到染色体 22q13。