外核糖核酸酶1; ERI1
组蛋白 mRNA 3-引物末端特异性外核糖核酸酶;HEXO
HGNC 批准的基因符号:ERI1
细胞遗传学位置:8p23.1 基因组坐标(GRCh38):8:9,002,897-9,100,104(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
后生动物复制依赖性组蛋白 mRNA 以高度保守的茎环结构结束,该结构是调节组蛋白 mRNA 稳定性所必需的,并与茎环结合蛋白(SLBP; 602422) 结合。 Dominski 等人在 RNA 亲和纯化测定中使用组蛋白 mRNA 茎环序列(2003) 从 HeLa 全细胞提取物中分离出 HEXO(组蛋白 mRNA 末端特异性核酸外切酶)蛋白。他们使用质谱法对 HEXO 蛋白的区域进行了测序,并将该蛋白与序列数据库中的全长蛋白进行匹配。 HEXO 编码一个 50 kD 的蛋白质,其中包含能够识别染色体 DNA 中富含 AT 的支架附着区域(SAR) 的 SAP 结构域,以及与 DEDD 核酸外切酶家族成员相似的核酸外切酶结构域。
▼ 基因功能
Dominski 等人使用抗体耗竭和免疫共沉淀实验(2003) 确定 HEXO 直接与 SLBP 同时结合茎环 RNA。迁移率变化测定显示出由与茎环RNA结合的HEXO和SLBP组成的稳定复合物。 RNA 3-杂交和补充RNA的2-杂交实验证明了HEXO与茎环结构的序列特异性结合,并证实了HEXO与SLBP的同时结合。诱变表明茎环对于 HEXO 结合至关重要,并且茎环 mRNA 3 引物的长度和序列影响 HEXO 的结合效率。杆状病毒表达的重组 HEXO 表现出核酸外切酶 3-prime-to-5-prime 活性,显示出对组蛋白 mRNA 的最高亲和力。 SLBP 与茎环 RNA 的结合可阻断 HEXO 介导的降解。
▼ 生化特征
晶体结构
谭等人(2013) 报道了人 SLBP(602422) RNA 结合结构域、人 3-prime-HEXO 和 26 核苷酸茎环 RNA 三元复合物的晶体结构。茎环中只有 1 个碱基被 SLBP 特异性识别,这 2 个蛋白质主要识别 RNA 的形状。 SLBP和3-prime-HEXO彼此没有直接接触,并且诱导茎环环的结构变化介导它们的协同结合。 3-prime 侧翼序列位于 3-prime-HEXO 活性位点,但三元复合物限制了修剪的程度。