TATA框结合蛋白相关因子 9； TAF9

TAF9 RNA 聚合酶 II，TATA 框结合蛋白相关因子，32-KD
TATA框结合蛋白相关因子2G； TAF2G
TBP 相关因子，RNA 聚合酶 II，32-KD； TAFII32
TAFIID32
TAFII31

HGNC 批准的基因符号：TAF9

细胞遗传学位置：5q13.2 基因组坐标（GRCh38）：5:69,364,743-69,369,824（来自 NCBI）

▼ 说明

RNA 聚合酶 II 转录因子 IID（参见 313650）是 TATA 结合蛋白（600075）和多种 TBP 相关因子（TAF）的复合物。 TAF 是激活而非基础转录所必需的，并用于介导各种激活剂和基础转录机制之间的信号。

▼ 克隆与表达

克莱姆等人（1995）克隆了人类 TFIID 亚基，他们将其命名为 hTAFII32。从 HeLa 细胞核提取物中分离出 32 kD 蛋白质并进行部分测序。设计了简并寡聚物并用于探测人类 HeLa 细胞 cDNA 文库。鉴定出的 cDNA 推导有 264 个残基的氨基酸序列，与果蝇 TAFII40 相关。

Lu 和 Levine（1995）也克隆了 TAF9，他们将其称为 TAFII31。

桑塔玛等人（2005）确定人 CINAP（AK6; 619357）和 TAFIID32 是从相同基因座生成的，作为共享外显子 1 和 2 的选择性剪接转录本。然而，TAFIID32 在不同的读数中使用 CINAP ATG 起始密码子下游的 ATG 起始密码子尽管转录本中有一个共同的 5-prime 区域，但产生了 2 个不同的蛋白质，没有共享的氨基酸序列。 Northern blot 和半定量 RT-PCR 显示这两种转录物在所有测试的人体组织和细胞系中都有表达。人类 CINAP 和 TAFIID32 的不寻常基因排列在哺乳动物中保守，包括黑猩猩、大鼠、小鼠和狗，但在其他检查的脊椎动物中不保守，包括鱼类和两栖动物，其中 CINAP 和 TAFIID32 直向同源物在不同的基因座编码。

▼ 基因功能

克莱姆等人（1995）表明 TAFII32 与 GTF2B（189963）以及病毒转录反式激活因子 VP16 相互作用。作者表明，重组表达的 TAFII32 在部分重组 TFIID 复合物中发挥功能，并且该重组复合物通过 GAL4-VP16 融合蛋白介导激活。

Lu 和 Levine（1995）使用免疫沉淀和结合分析表明，TAF9 与 p53（191170）的 N 末端结构域相互作用，其位点与 MDM2（164785）（p53 活性的主要细胞负调节因子）结合的位点相同。 TAF9 抗体抑制 p53 激活的转录。 Lu 和 Levine（1995）得出结论，p53 活性是由竞争 p53 蛋白同一区域的 2 个蛋白调节的。

Chen 和 Manley（2000）在鸡 DT40 细胞中使用条件性 TAF9 敲除细胞系，证明 TAF9 通常不是 RNA pol II 介导的体内转录所必需的，尽管 TAF9 的缺失导致许多其他 TAF 和凋亡细胞的共缺失死亡。在使用 DT40-TAF9 细胞的其他研究中，Chen 和 Manley（2003）证明，TAF9 的消耗会导致 TFIID 的破坏，说明 TAF9 在 TFIID 结构完整性中的关键作用以及 TFIID 功能能力（TAF 含量大大降低）。各种 TAF9 嵌合体的互补分析揭示了 TAF9 组蛋白折叠基序的严格序列要求。人 TAF9 和相关因子 TAF9L（TAF9B; 300754）均恢复了 DT40 细胞中鸡 TAF9 的基本功能。

弗龙蒂尼等人（2005）证明TAF9和TAF9B同时存在于TFIID和TFTC（不含TATA结合蛋白的含有TAF的复合物）复合物中，并且具有不同和重叠的功能。 TAF9 与 TAF9B 一起在所有测试的细胞类型中普遍表达。体内和体外实验显示 TAF9 和 TAF9B 与 TAF6（602955）组蛋白折叠对有类似的相互作用。 HeLa细胞中细胞凋亡的刺激使TAF9和TAF9B表达水平分别增加约6至9倍和约1.5倍。在 MCF7 和 HeLa 细胞中，TAF9B 过表达对 p53 稳定性的影响比 TAF9 弱。 SiRNA 敲低实验表明，这两个基因对于细胞活力都是必需的。用 TAF9 或 TAF9B siRNA 处理的细胞的基因表达分析表明，这两种蛋白调节不同的基因组，只有很小的重叠。

▼ 生化特征

冷冻电子显微镜

比尼奥塞克等人（2013）展示了人类核心-TFIID 复合物的结构，由 TAF4（601796）、TAF5（601787）、TAF6、TAF9 和 TAF12（600773）各 2 个拷贝组成，通过冷冻电子显微镜以 11.6 埃分辨率测定。该结构揭示了 2 倍对称、交错的结构，具有明显的突起，容纳了 TAF 的所有保守结构特征，包括组蛋白折叠。比尼奥塞克等人（2013）进一步证明，1 TAF8（609514）-TAF10（600475）复合物的结合破坏了核心-TFIID 的原始对称性。比尼奥塞克等人（2013）提出，通过增加剩余的 TAF 和 TBP 各 1 个拷贝，由此产生的不对称结构可作为功能支架来使 Holo-TFIID 组装成核。

▼ 测绘

通过分析人类/啮齿动物体细胞杂交体、单染色体杂交体的 PCR 扩增以及 FISH，Evans 等人（1999）将 TAF2G 基因定位到染色体 5q11.2-q13.1。

通过基因组序列分析，Santama 等人（2005）将 TAF9 基因定位到染色体 5q13.2。 TAF9 和 AK6 基因彼此重叠并共享相同的前 2 个外显子。