末端核苷酸转移酶5B; TENT5B
具有序列相似性的家族46,成员B; FAM46
HGNC 批准的基因符号:TENT5B
细胞遗传学位置:1p36.11 基因组坐标(GRCh38):1:27,005,020-27,012,850(来自 NCBI)
▼ 说明
TENT5B 是一种聚腺苷酸聚合酶(PAP),属于核苷酸转移酶(NTase) 超家族。 TENT5B 通过消耗 ATP 分子来催化目标 mRNA 3-prime 末端的聚腺苷酸化(Hu et al., 2020)。
▼ 克隆与表达
Hu 等人使用免疫荧光分析(2020) 表明 TENT5B(他们称之为 FAM46B)广泛分布于人类胚胎干细胞中。分级分析揭示了 FAM46B 的细胞质偏好,尽管它也出现在核级分中。
▼ 测绘
Gross(2020) 根据 TENT5B 序列(GenBank BC012790) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 TENT5B 基因对应到染色体 1p36.11。
▼ 基因功能
使用 RT-PCR 和蛋白质印迹分析,Liang 等人(2018) 表明 FAM46B 表达在前列腺癌(PC; 176807) 组织和细胞系中下调。 FAM46B 沉默促进 P69 细胞的增殖和细胞周期进展,而 FAM46B 过表达抑制 LNCaP 和 PC-3 细胞的增殖和细胞周期进展。同样,FAM46B 过表达可抑制小鼠 PC 肿瘤的生长。 PC 组织中 FAM46B 的表达与 β-连环蛋白(CTNNB1;116806) 的表达呈负相关。用β-连环蛋白信号抑制剂处理P69细胞可抑制FAM46B沉默诱导的PC细胞增殖和细胞周期进展,表明FAM46B通过调节β-连环蛋白表达来抑制PC细胞增殖和细胞周期进展。
Hu 等人通过分析单细胞 RNA 测序数据(2020) 表明,在合子基因组激活(ZGA) 之前,FAM46B 在小鼠和人类植入前胚胎中独特且高度表达。 ZGA 之后,FAM46B 转录水平急剧下降。然而,与小鼠胚胎中的 Fam46b 不同,FAM46B 在人胚泡中重新激活,并且在人外胚层中独特且高度表达。 RT-PCR 分析表明,FAM46B 在人多能细胞中特异性表达,但在分化后急剧下调。 FAM46B 并不直接参与多能性维持,而是通过防止 mRNA 降解来维持某些基因的翻译效率,从而对人类胚胎干细胞的活力至关重要。
▼ 生化特征
胡等人(2020) 以 2.7 埃分辨率确定了 Xenopus Fam46b 的晶体结构。该结构包含一个N端催化结构域(NCD)和一个C端螺旋结构域(HD),它们一起形成一个巨大的裂缝。 NCD 很大,由中央 8 链 β 折叠构成,周围有 7 个 α 螺旋,涉及典型的 NTase 核心。 Fam46b 结构在整体折叠和某些域间连接方面类似于原核 PAP 和 CCA 添加酶,这将 Fam46b 与其他真核非典型 PAP 区分开来。功能分析表明,Fam46b 是一种类似细菌的 PAP,它通过消耗 ATP 分子,选择性地将一串非模板化 AMP 添加到目标 mRNA 的 3 端。作者利用诱变确定了 Fam46b 的催化中心和潜在的 RNA 结合区域。