磷脂酰肌醇 3,4,5-三磷酸酯依赖性 RAC 交换剂 2; PREX2
DEP 域包含蛋白 2; DEPDC2
HGNC 批准的基因符号:PREX2
细胞遗传学位置:8q13.2 基因组坐标(GRCh38):8:67,952,046-68,237,032(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Rosenfeldt 等人通过搜索与 PREX1(606905) 相似的序列,然后进行 PCR,(2004)克隆了 2 个 DEPDC2 剪接变体,他们称之为 PREX2a 和 PREX2b。全长 PREX2a 转录物编码具有 N 端 Dbl(MCF2; 311030) 同源结构域的蛋白质,后跟 血小板-白细胞C 激酶底物(PLEK; 173570) 同源结构域、2 个 DEP 结构域、2 个 PDZ 结构域和 C 端肌醇多磷酸盐4-磷酸酶(InsPx4) 结构域。 PREX2b 蛋白含有 980 个氨基酸,缺少 PREX2a 的 C 端 InsPx4 结构域。 Northern 印迹分析在骨骼肌、小肠和胎盘中检测到 10 kb PREX2a 转录本,在心脏中检测到 3.5 kb PREX2b 转录本。
唐纳德等人(2004) 从人类骨骼肌和大脑 cDNA 文库中克隆了 PREX2。全长 183 kD 蛋白与 PREX1 具有 59% 的同一性。 Northern blot分析检测到PREX2广泛表达,在骨骼肌、心脏和胎盘中表达水平最高。外周血白细胞中未检测到 PREX2。
Donald 等人使用蛋白质印迹分析(2008)发现Prex2在小鼠脑和肺中大量表达,在肝、胸腺和脾中表达较低。在大脑中,小脑表达最高,额叶皮层、纹状体、杏仁核和海马表达较低。原位杂交显示 Prex2 mRNA 高度局限于小脑,在浦肯野细胞(包括树突)中表达。
▼ 基因功能
罗森菲尔德等人(2004) 发现人胚胎肾细胞中 PREX2b 的过表达会刺激 RAC(602048) 上的 GTP 负载,并在较小程度上刺激 CDC42(116952) 上的负载,但不会刺激 RHOA(165390) 上的负载。它还刺激血清反应元件(SRE) 依赖性转录,并且 RAC 和 SRE 的 PREX2 激活进一步受到显性活性 p110 PI3 激酶 γ 亚基(PIK3CG; 601232) 的刺激。罗森菲尔德等人(2004) 得出结论,PREX2 可能在 G 蛋白偶联受体调节小 GTP 酶中发挥作用。
Rac 激活后,猪主动脉内皮(PAE) 细胞具有膜皱褶和片状伪足。唐纳德等人(2004) 表明 PAE 细胞中 PREX2 的表达诱导了这种“激活的 Rac”的产生。 PI3K 信号传导的抑制会减弱这种形态,而 PDGF(参见 PDGFB;190040)刺激则会增强这种形态。 PREX2 介导的 GTP 装载到 RAC 上受到 PI3K 和 G 蛋白 β-1(GNB1; 139380)/γ-2(GNG2; 606981) 亚基的协同刺激。磷脂酰肌醇3,4,5-三磷酸与PREX2的直接结合足以刺激PREX2 RAC-鸟嘌呤核苷酸交换因子活性。
法恩等人(2009) 将 PREX2a 鉴定为 PTEN(601728) 相互作用蛋白。 PREX2a mRNA 在人类癌细胞中更为丰富,并且在野生型 PTEN 的肿瘤中显着增加,野生型 PTEN 表达 PIK3CA(171834) 的激活突变体,编码磷酸肌醇 3-激酶亚基 α(PI3K-α) 的 p110 亚基。 PREX2a 抑制 PTEN 脂质磷酸酶活性并仅在 PTEN 存在时刺激 PI3K 通路。 PREX2a 刺激细胞生长,并与 PIK3CA 突变体配合,促进不依赖生长因子的增殖和转化。 PREX2a 的消耗减少了磷酸化 AKT 的数量以及具有完整 PTEN 的人类细胞系的生长。因此,Fine 等人(2009) 得出结论,PREX2a 是 PI3K 通路的一个组成部分,可以拮抗癌细胞中的 PTEN。
▼ 基因结构
罗森菲尔德等人(2004) 确定 DEPDC2 基因包含 32 个外显子,跨度约为 265 kb。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Rosenfeldt 等人(2004) 将 DEPDC2 基因定位到染色体 8q13.1。唐纳德等人(2004) 将 DEPDC2 基因定位到染色体 8q13.2。
▼ 分子遗传学
伯杰等人(2012) 对 25 种转移性黑色素瘤的基因组进行了测序并匹配了种系 DNA。观察到了广泛的点突变率:原发于非紫外线暴露的四肢无毛皮肤的黑色素瘤中最低(每 Mb 基因组 3 和 14 个),中间是源自躯干有毛皮肤的黑色素瘤( 5 至 55 个/Mb),并且在有长期阳光照射史的患者中最高(111 个/Mb)。全基因组序列数据分析发现,PREX2(乳腺癌中的一种 PTEN 相互作用蛋白和 PTEN 负调节因子)是一个显着突变的基因,在 107 例人类黑色素瘤的孤立扩展队列中突变频率约为 14%。 PREX2突变具有生物学相关性,因为突变体PREX2的异位表达加速了体内永生化人类黑素细胞的肿瘤形成。
▼ 动物模型
唐纳德等人(2008) 发现 10 日龄 Prex2 -/- 小鼠的浦肯野细胞树突相对较薄,但在其他方面表现正常。然而,在成年 Prex2 -/- 小鼠中,浦肯野树突干变得干瘪且无序。 Prex2 -/- 小鼠表现出轻微的运动协调缺陷,这种缺陷随着年龄的增长而逐渐恶化,并且雌性比雄性更为明显。 Prex1/Prex2双敲除小鼠以预期的孟德尔频率获得,但它们存在共济失调,基本运动活动减少,姿势和步态异常,运动协调能力受损,即使在年轻时也是如此。唐纳德等人(2008) 得出结论,PREX1 和 PREX2 是浦肯野细胞形态和小脑功能的调节因子。