趋化因子、CC 基序、配体 4; CCL4

小诱导细胞因子 A4; SCYA4
巨噬细胞炎症蛋白 1-β; MIP1B
MIP1B1
免疫激活2; ACT2
AT744.1

HGNC 批准的基因符号:CCL4

细胞遗传学位置:17q12 基因组坐标(GRCh38):17:36,103,827-36,105,614(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Lipes 等人通过差异杂交筛选激活的 T 细胞文库(1988) 鉴定了一种免疫激活基因,称为 ACT2。在用植物血凝素激活T细胞、用金黄色葡萄球菌激活B细胞以及用脂多糖激活单核细胞后,该基因被快速诱导。利佩斯等人(1988)分离出含有全长编码区的cDNA。推导的氨基酸序列预测了一个由 92 个氨基酸组成的开放解读码组,其中包括一个非常疏水的 N 末端,预计它是一种信号肽。使用杆状病毒表达系统,他们表明该基因编码一种分泌产物。因此,ACT2 很可能是一种细胞因子。

欧文等人(1990) 鉴定了 MIP-1-α(182283) 和 MIP-1-β 的人类同源物,分别将它们命名为 464.1 和 744.1。他们表示,这 2 个基因在用各种有丝分裂原激活 T 细胞后表现出平行调节,并编码具有 55% 序列相似性的蛋白质。 464.1和744.1基因在基因组中相距14kb,并且以头对头的方式排列。每个基因都以额外的拷贝形式存在,分别称为 464.2(SCYA3L1; 601395) 和 744.2(CCL4L; 603782)。

MIP1B 是一种 8 kD 酸性蛋白,在单核细胞、T 细胞和其他淋巴细胞中受到刺激后表达上调。它属于 CC 趋化因子亚家族,指导特定白细胞亚群的迁移。莫迪等人(2001) 指出,自从分离出第一个 MIP1B 分子克隆以来,关于编码 MIP1B 和相关蛋白质的基因的确切数量一直存在混乱。他们证明,MIP1B 由 2 个旁系同源基因 ACT2(CCL4) 和 LAG1(CCL4L) 编码,这两个基因紧密位于 17 号染色体的长臂上。这些蛋白质具有共同的长度,并且 92 个氨基酸中有 89 个是相同的。前 2 个氨基酸差异发生在信号肽中,而第三个差异则发生在成熟蛋白质中。在转录区域内,基因在 662 个核苷酸中有 25 个不同。

Lu 等人使用 RT-PCR 分析(2004) 表明 ACT2 和 LAG1 是不同的基因,单核细胞主要表达 ACT2,而外周 B 淋巴细胞表达 ACT2 和 LAG1 的混合物。卢等人(2004) 还鉴定了主要表达 LAG1 的 B 细胞系。他们得出结论,单核细胞和 B 细胞使用不同的机制来调节这 2 个基因的表达。卢等人(2004) 认为最有效的抗 HIV 药物是那些能够增加与 CCR5 具有最高亲和力的 CCL4 蛋白(即 ACT2 或 LAG1)表达的药物(601373)。

科洛布兰等人(2005) 表明 CCL4 和 CCL4L 都会产生缺乏外显子 2 的剪接变体。

▼ 基因功能

科奇等人(1995) 确定 RANTES(187011)、MIP-1-α(182283) 和 MIP-1-β 是 CD8+ T 细胞产生的主要 HIV 抑制因子。

卡明-刘易斯等人(2001) 证明通常合成 MIP-1-β 的主要是穿孔素(170280)-低记忆 CD8+ T 细胞。这种 β 趋化因子显然是由主要 CD8+ T 细胞群合成的,其表型与细胞毒性 T 淋巴细胞效应功能不一致。作者建议应将非裂解性 CD8+ T 细胞亚群作为针对 HIV-1 的保护性免疫的相关性进行检查。

▼ 基因结构

纳波利塔诺等人(1991) 对 ACT2 基因的外显子和外显子/内含子剪接点以及外显子 1 上游的序列进行了测序。经典的 TATA 框紧邻转录起始位点的上游。上游序列具有启动子活性。

▼ 测绘

通过体细胞杂交分析和原位杂交,Modi 等人(1991) 将 SCYA4 基因分配到比 Irving 等人稍远的位置(1990):17q21-q23 而不是 17q11-q21。田崎等人(1999) 报道了 AT744.1 相对于 17q11.2 处 CC 趋化因子基因簇中其他基因的排列。通过基因组序列分析,莫迪等人(2001) 确定 ACT2 和 LAG1 基因位于 17 号染色体上,相距约 651 kb。

莫迪等人(2006) 指出 CCL18(603757)、CCL3(182283) 和 CCL4 位于 17q12 上的 47 kb 间隔内。

▼ 命名法

莫迪等人(2001)指出ACT2与CCL4、SCYA4和MIP1B同义,而LAG1与CCL4L和SCYA4L同义。