ETS 变异转录因子 2; ETV2
ETS 变异基因 2
ETS 相关蛋白 71,小鼠,同源物; ER71; ETSRP71
HGNC 批准的基因符号:ETV2
细胞遗传学位置:19q13.12 基因组坐标(GRCh38):19:35,641,745-35,644,871(来自 NCBI)
▼ 说明
ETV2 是一种转录激活因子,可调节发育胚胎中造血细胞和内皮细胞谱系的规范和稳定性(Liu et al., 2015)。
▼ 克隆与表达
Brown 和 McKnight(1992) 克隆了小鼠 Etv2,他们将其命名为 Er71。推导的蛋白质含有 335 个氨基酸,可能代表部分序列。对几种小鼠组织的 Northern 印迹分析在成年睾丸中检测到 1.7 kb 转录本,在 8.5 天的小鼠胚胎中检测到 1.2 kb 转录本。在检查的任何其他组织中均未检测到表达。
De Haro 和 Janknecht(2005) 确定小鼠 Etv2 有 2 个替代翻译起始位点,产生 336 或 358 个氨基酸的蛋白质。 Northern 印迹分析在小鼠睾丸中检测到一个主要的 1.7-kb 转录本和一个次要的 1.5-kb 转录本。 RT-PCR 发现支持细胞中 Etv2 表达最高。通过数据库分析,De Haro 和 Janknecht(2005) 鉴定了人类 ETV2 的 cDNA。推导的蛋白质含有370个氨基酸。 De Haro 和 Janknecht(2005) 还鉴定了从成人髓质中分离出的人类 ETV2 cDNA,该 cDNA 缺乏外显子 2,编码仅含有全长 ETV2 最后 249 个氨基酸的截短蛋白。
▼ 基因功能
Brown 和 McKnight(1992) 发现小鼠 Er71 与 Gabpa(600609) 和 Er81(ETV1; 600541) 一样,识别五核苷酸 DNA 序列 5-prime-CGGAA/T-3-prime。
通过电泳迁移率变动分析,De Haro 和 Janknecht(2005) 发现小鼠 Etv2 的 2 个亚型以相同的亲和力与 MMP1(120353) 启动子结合,并且显示出由 MMP1 启动子驱动的报告基因的类似激活。
Koyano-Nakakawa 等人使用 FACS 分析(2012) 证明 Etv2 是小鼠卵黄囊中造血和内皮谱系发育所必需的,因为早在胚胎第 7.5 天,Etv2 突变体卵黄囊中就缺乏造血和内皮谱系。对表达 Etv2-EYFP 融合蛋白的转基因小鼠的分析表明,早期内皮标记物 Tie2(TEK;600221)呈阳性的内皮细胞存在于 Etv2 突变体卵黄囊中,但这些 Tie2 阳性细胞并未发育成功能性造血集落形成单位。 Etv2 的过度表达增强了胚胎干细胞分化为造血和内皮谱系的潜力。胚胎干细胞微阵列鉴定出 Lmo2(180385) 是 Etv2 的直接靶标。
Liu 等人通过对分化的小鼠胚胎干(ES) 细胞进行染色质免疫沉淀测序分析(2015) 确定 Etv2 是控制基因调控网络和参与中胚层血管生成祖细胞规范的信号传导的因子。 Etv2 通过直接调节 VEGF(参见 192240)信号传导来诱导调节造血和内皮细胞谱系规范的关键基因。 Etv2 功能是 Flk1(KDR; 191306) 阳性血管生成祖细胞群的生成和扩增所必需的,以保证发育中的胚胎中有适当的血液和内皮细胞。 ETS基因是Etv2的直接目标,因为Etv2正向调节其自身和其他ETS基因的表达,从而建立ETS层次结构,通过ETS转换机制维持Etv2启动的血液和内皮细胞程序。
▼ 基因结构
De Haro 和 Janknecht(2005) 确定小鼠 Etv2 基因包含 7 个外显子,跨度 3 kb。启动子区域没有 TATA 框,但有一个功能性 Sp1(189906) 结合位点。人类ETV2基因还含有7个外显子。
▼ 测绘
Stumpf(2021) 根据 ETV2 序列(GenBank BC144448) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 ETV2 基因对应到染色体 19q13.12。
De Haro 和 Janknecht(2005) 将小鼠 Etv2 基因定位到 7A3 号染色体上的一个区域,该区域显示出与人类染色体 19q13 同线性的同源性。
▼ 分子遗传学
关联待确认
巴塞尔-鲑鱼等(2021) 报道了一个连续 4 次妊娠的家庭,同时出现胎儿先天性心脏畸形和椎骨异常。此外,在 1 名胎儿中观察到轴后多指畸形。胎儿超声心动图显示不同类型的复杂心脏缺陷,包括法洛四联症、左心发育不全和间隔缺损。椎骨异常包括半椎骨。通过外显子组测序,作者在所有 4 个胎儿的 ETV2 基因(NM_014209.2) 中发现了复合杂合变异:外显子 5 中父系遗传的 1-bp 缺失(c.350del),导致移码,预计会导致提前终止密码子(Gly117AlafsTer90) 和缺少 ETS 结构域的截短蛋白; DNA 结合域内有一个母系遗传的错义变体(asp253 变为 tyr,D253Y)。在超过 1,200 个对照的内部数据库中未发现这两种变体,但在 gnomAD 数据库中,两种变体均以较低的次要等位基因频率存在(分别为 0.0004 和 0.0001,从来没有纯合性)。作者表示,这是人类中与 ETV2 相关的可识别表型的第一份报告。