PDZ 包含域 4； PDZD4

PDZK4
PDZRN4L
KIAA1444
LU1

HGNC 批准的基因符号：PDZD4

细胞遗传学位置：Xq28 基因组坐标（GRCh38）：X:153,802,166-153,830,544（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

Nagase 等人通过对从尺寸分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序（2000） 克隆了 PDZD4，他们将其命名为 KIAA1444。 RT-PCR ELISA 检测成人和胎儿脑中 PDZD 高表达。

Katoh和Katoh（2004）通过以PDZRN4（609730）序列作为查询的数据库检索，鉴定出了人和鼠的PDZD4，他们将其称为PDZRN4L。推导的 769 个氨基酸的 PDZD4 蛋白包含二分核定位信号和 PDZ 结构域。 PDZD4 蛋白与小鼠直系同源物具有 93% 的序列同一性，与 PDZRN4 选择性剪接形式 PDZRN4S 具有 49.9% 的序列同一性。

Nagayama 等人使用微阵列分析来识别滑膜肉瘤（SS） 中上调的基因，然后进行数据库分析（2004） 孤立鉴定了 PDZD4 的 3 个选择性剪​​接变体。推导的变体编码的 PDZD4 蛋白长度为 673（Adult1）、769 和 660 个氨基酸；然而，体外翻译研究和 COS-7 细胞中的表达显示仅 769-（Fetal1/SS）和 660-氨基酸（Adult2/Fetal2）变体的翻译。推导的 Fetal1/SS 和 Adult2/Fetal2 PDZD4 变体均具有预测的 N 末端 PDZ 结构域，以及为 Fetal/SS 变体预测的附加 N 末端 PDZ 结构域。 Northern 印迹分析在成人大脑中检测到 4.5- 和 3.8-kb 转录本，在胎儿大脑中检测到 4.2- 和 3.8-kb 转录本。在另外检查的 15 个成人组织中均未检测到 PDZD4 转录本。 SS 细胞系和 SS 组织仅表达 4.2 kb 转录物，对应于 Fetal1/SS 变体。在检查的其他几种癌细胞中未检测到 Fetal1/SS 变体的表达。 COS-7 细胞中的免疫细胞化学将 Fetal1/SS 和 Adult2/Fetal2 PDZD4 变体定位于质膜下的区域。

▼ 基因功能

Nagayama 等人使用小干扰 RNA 表达（2004）下调滑膜肉瘤细胞系 HS-SY-2 和 YaFuSS 中 PDZD4 Fetal1/SS 变体的表达，并通过 MTT 测定观察到细胞生长的抑制和细胞活力的降低。重组 PDZD4 Fetal1/SS 变体在胶质母细胞瘤细胞系和 COS-7 细胞（均缺乏内源性 PDZD4）中的过表达，通过集落数量测定显示细胞生长增加。永山等人（2004） 认为 PDZD4 Fetal1/SS 变体作为癌基因，可能在滑膜肉瘤的癌变过程中发挥作用。

▼ 基因结构

Katoh 和 Katoh（2004） 确定 PDZD4 基因至少包含 8 个外显子。永山等人（2004） 确定 PDZD4 基因包含 9 个在 Adult1 变体中转录的外显子。 Fetal1/SS 转录本包含替代外显子 2，但缺少外显子 3，而 Adult2/Fetal2 转录本缺少外显子 2、3 和 4。

▼ 测绘

通过辐射杂交分析，Nagase 等人（2000） 将 PDZD4 基因对应到 X 染色体。通过基因组序列分析，Katoh 和 Katoh（2004） 将 PDZD4 对应到 Xq28，将小鼠同源物对应到 X 染色体带 A6。