前列腺癌相关转录 19，非编码； PCAT19

长基因间非编码 RNA 1190； LINC01190
lincRNA 1190

HGNC 批准的基因符号：PCAT19

细胞遗传学位置：19q13.2 基因组坐标（GRCh38）：19:41,454,169-41,500,649（来自 NCBI）

▼ 说明

PCAT19 是一种长非编码 RNA（lncRNA），可能在前列腺癌的发展和侵袭性中发挥作用（参见 HPC15, 611959）（Hua 等人，2018；Gao 等人，2018）。

▼ 克隆与表达

通过数据库分析，Hua 等人（2018） 发现了 PCAT19 的多个变体。其中，具有不同转录起始位点的 2 种变体（称为 PCAT19 短型和 PCAT19 长型）在前列腺肿瘤中最为丰富。细胞分级分离和实时定量 PCR 分析表明，PCAT19-long 定位于前列腺癌细胞系的核部分。

▼ 测绘

高等人（2018） 报道，PCAT19 基因对应到染色体 19q13，位于 ATP5SL（617262） 和 CEACAM21（618191） 基因之间。

▼ 分子遗传学

华等人（2018） 证实 PCAT19 基因内 rs11672691 的 G 等位基因的纯合性与前列腺癌诊断后的不良预后相关（参见 HPC15, 611959）。作者确定 PCAT19-short 的启动子区域（位于 PCAT-long 的内含子 3 中）包含 rs11672691。 SNP 以相互方式调节 2 个 PCAT19 亚型的表达，其中 G 风险等位基因与 PCAT19-short 丰度降低和 PCAT19-long 丰度增加相关。转录因子NKX3.1（602041）和YY1（600013）优先结合PCAT19-short启动子区rs11672691的A非风险等位基因并促进PCAT19-short的表达。相反，rs11672691的G风险等位基因降低了NKX3.1和YY1的结合，导致启动子活性较弱，但增强子活性较强，随后激活了PCAT19-long。体外和体内分析表明，长 PCAT19 会增加细胞增殖并促进前列腺癌进展。 RNA Pull-down 测定表明，PCAT19-long 与 RNA 结合蛋白 HNRNPAB（602688） 相互作用，激活促进侵袭性前列腺癌的细胞周期基因子集。华等人（2018） 得出的结论是，rs11672691 的 G 风险等位基因介导了侵袭性前列腺癌发生和进展的启动子-增强子转换机制。

高等人（2018） 证实 PCAT19 内含子 SNP rs11672691 的 G 风险等位基因与侵袭性前列腺癌相关。此外，G 风险等位基因与 PCAT19 和 CEACAM21 的较高表达水平相关，并且 PCAT19 和 CEACAM21 的上调与前列腺癌的发展相关。作者确定转录因子 HOXA2（604685） 直接结合包含 rs11672691 的增强子元件，并显示出对 G 风险等位基因的偏好。 PCAT19 的敲除导致 CEACAM21 mRNA 水平降低，表明 PCAT19 有助于 CEACAM21 调节。 rs11672691 的变异也直接改变了 CEACAM21 启动子活性，并有助于 HOXA2 介导的 CEACAM21 表达调节。前列腺癌细胞中 CRISPR/Cas9 介导的单核苷酸编辑揭示了 rs11672691 的 G 风险等位基因对 PCAT19 和 CEACAM21 表达增强以及前列腺癌增殖和严重程度的直接影响。