具有 SH3 结构域的 NCK 相互作用蛋白; NCKIPSD

来自染色体 3p21 的全 1 融合基因; AF3P21
SH3 蛋白与 NCK 相互作用,90-KD; SPIN90
黄蜂相互作用 SH3 蛋白;WISH

HGNC 批准的基因符号:NCKIPSD

细胞遗传学位置:3p21.31 基因组坐标(GRCh38):3:48,673,844-48,685,915(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

萨诺等人(2000) 在一名 23 岁患者中发现了 NCKIPSD 基因,他们将其称为 AF3p21,作为 MLL 基因(159555) 的新型融合伴侣,该患者患有 t(3; 11)(p21;q23)。早川等人(2001) 进一步表征了 AF3p21 基因。 AF3p21 编码由 722 个氨基酸组成的核蛋白,具有 SH3 结构域、富含脯氨酸的结构域和二分核定位信号。该蛋白的SH3结构域与FYN(137025)具有高度同源性。点印迹RNA分析显示,AF3p21基因在所有受检查的成人和胚胎人体组织中表达,包括骨髓、脑、肝脏、胸腺、肺和骨骼肌。 HeLa 细胞 RNA 的 Northern 印迹分析检测到 3.5 kb 转录物。该蛋白质的表观分子量为 80 kD,并且仅定位于细胞核中。

Westendorf 和 Koka(2004) 使用 FHOD1(606881) 作为诱饵对人骨髓 cDNA 表达文库进行酵母 2 杂交筛选,获得了 WISH 的假定剪接变体,他们将其称为 WISH-B。推导的 663 个氨基酸的 WISH-B 蛋白缺少全长 WISH 的 C 端结构域。

▼ 基因结构

早川等人(2001) 确定 NCKIPSD 基因跨度 19 kb,包含 13 个外显子。

▼ 测绘

萨诺等人(2000) 将 NCKIPSD 基因定位到染色体 3p21。

▼ 基因功能

Rahimi 等人使用蛋白质下拉和免疫沉淀分析(2012) 发现 SPIN90 的 SH3 结构域与 IGPR1(TMIGD2; 614715) 富含脯氨酸的 C 末端相互作用。任一蛋白的过表达或敲低分别增加或减少三维培养中小鼠或人内皮细胞的管形成。拉希米等人(2012) 假设 IGPR1 和 SPIN90 之间的相互作用调节血管生成。

Westendorf 和 Koka(2004) 使用酵母 2-杂交筛选人骨髓 cDNA 表达文库,发现 FHOD1 与 PRKCBP1(ZMYND8; 615713)、亲环蛋白 B(PPIB; 123841) 和 WISH-B 相互作用。免疫共沉淀分析证实了 FHOD1 和 WISH-B 之间的相互作用。结构域分析表明,WISH-B 的 N 端 SH3 和 PST 结构域主要与 FHOD1 的 FH1 结构域相互作用。 WISH-B 的 N 末端结构域(而非全长 WISH-B)抑制转染 HEK293T 细胞中 FHOD1 诱导的应力纤维形成。然而,全长 WISH-B 改变了 FHOD1 的溶解度,表明 WISH-B 可能影响 FHOD1 的亚细胞定位或将其招募到更大的蛋白质复合物中。

▼ 细胞遗传学

萨诺等人(2000) 在一名 23 岁患者中鉴定出 AF3p21 基因是 MLL 基因(159555) 的新融合伴侣,该患者患有 t(3;11)(p21;q23) 治疗相关性白血病(AML, FAB M5b) )。早川等人(2001) 发现在患者白血病细胞的 DNA 中,MLL 基因的内含子 6 融合在 AF3p21 基因外显子 1 上游的位置,der(11) 染色体形成 MLL-AF3p21白血病细胞中存在融合转录本,而der(3)染色体不形成任何融合转录本。