用于 SLC2A4 的 ASPSCR1 系链,包含 UBX 域; ASPSCR1

肺泡软部分肉瘤染色体区域,候选 1
ASPL
TETHER,包含 GLUT4 的 UBX 域;TUG

此条目中涉及的其他实体:
包含 ASPSCR1/TFE3 融合基因

HGNC 批准的基因符号:ASPSCR1

细胞遗传学位置:17q25.3 基因组坐标(GRCh38):17:81,977,629-82,017,406(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

细胞遗传学研究发现,在肺泡软部肉瘤(ASPS; 606243) 病例中,由于不可逆 t(X;17)(p11.2;q25) 而导致 der(17) 复发(Joyama 等,1999)。 Ladanyi 等人使用 TFE3(314310) 探针进行 Southern 印迹分析(2001) 在几个 ASPS 病例中鉴定出非种系带,这与 TFE3 与 17q25 上的基因的重排和可能的融合一致。通过在 2 个 ASPS 病例中扩增包含 TFE3 3-prime 部分的 cDNA 的 5-prime 部分,他们鉴定了一个新序列 ASPSCR1(作者指定为 ASPL),与 TFE3 外显子 4 或外显子 3 框内融合。 RT-PCR 分析在所研究的所有 12 个 ASPS 病例中均检测到 ASPSCR1/TFE3 融合转录本。 ASPSCR1/TFE3 融合体用融合的 ASPSCR1 序列取代了 TFE3 的 N 端部分,同时保留了 TFE3 DNA 结合域,这表明 ASPS 发病机制中的转录失调。

拉达尼等人(2001) 鉴定了 ASPSCR1 转录物的主要和次要剪接形式,其区别在于外显子 2 中是否存在 47 核苷酸片段,该片段编码 ASPSCR1 的 5 引物非翻译部分的一部分。他们确定 ASPSCR1 cDNA 编码推导的 476 个氨基酸的蛋白质,其 C 末端含有 UBX 样结构域。 Northern 印迹分析在所有测试的组织中检测到主要的 1.9-kb 转录物,其中在心脏、骨骼肌、胰腺和睾丸中表达最高。胎儿组织中的表达明显低于成人组织中的表达。在所有测试的癌细胞系中也发现了 ASPSCR1 表达。

海曼等人孤立地(2001) 在两名 5 岁非洲裔比利时女孩中鉴定出 ASPSCR1 基因,他们称之为 RCC17,与 TFE3 结合,她们的乳头状肾细胞癌(300854) 携带易位 t(X;17)(p11.2) ;q25)。在这两名患者中,t(X;17) 将 RCC17 的 N 末端区域与 TFE3 的 C 末端区域融合,包括 bHLH DNA 结合结构域和亮氨酸拉链二聚化结构域。相互融合转录本 TFE3/RCC17 也得到表达。

克劳蒂尔等人(2013) 指出推导的 553 个氨基酸的 ASPSCR1 蛋白包含 2 个 N 端泛素样结构域,随后是一个 SHP 框、一个卷曲螺旋区域和一个泛素调节 X 结构域。

▼ 基因功能

胰岛素(176730) 通过动员 GLUT4 葡萄糖转运蛋白(138190) 刺激脂肪和肌肉中的葡萄糖摄取。在没有胰岛素的情况下,GLUT4 被隔离在细胞内,并在胰岛素刺激后的几分钟内重新分布到质膜上。博根等人(2003)描述了一种功能筛选来鉴定调节 GLUT4 分布的蛋白质,并将 TUG 鉴定为 GLUT4 的假定系链,包含 UBX 结构域。他们鉴定出 ASPL 蛋白可能是鼠 TUG 的人类同源物。在截短形式中,TUG 以显性失活方式发挥作用,抑制中国仓鼠卵巢细胞和 3T3-L1 脂肪细胞中胰岛素刺激的 GLUT4 重新分布。全长 TUG 与 GLUT4 形成复合物;在 3T3-L1 脂肪细胞中,该复合物存在于未刺激的细胞中,并且大部分被胰岛素分解。内源性 TUG 位于未刺激的 3T3-L1 脂肪细胞中的 GLUT4 胰岛素可动员池中,并且不被胰岛素动员至质膜。 TUG 的不同区域需要结合 GLUT4 并在转染的非脂肪细胞中将 GLUT4 保留在细胞内。博根等人(2003) 得出结论,TUG 捕获内吞的 GLUT4 并将其束缚在细胞内,并且胰岛素通过释放该束缚来调动保留的 GLUT4 池。博根等人(2003)发现TUG存在2种亚型,其中较长的亚型在氨基末端含有与泛素相似的序列,预计长度为550个残基。短形式的可能起始密码子相当于长形式的蛋氨酸-78。

通过亲和纯化、SDS-PAGE 和质谱分析,Cloutier 等人(2013) 发现 VCP(601023)、ASPSCR1、UBXN6(611946) 和 METTL21D(615260) 在 METTL21D 转染的 HEK293 细胞中相互作用。重组 METTL21D 在体外甲基化反应中不会甲基化 ASPSRC1 或 UBXN6,但 ASPSRC1(而非 UBXN6)的存在增强了 METTL21D 依赖性 VCP 甲基化。