防御素,β,123; DEFB123
防御素,β,23; DEFB23
HGNC 批准的基因符号:DEFB123
细胞遗传学位置:20q11.21 基因组坐标(GRCh38):20:31,440,632-31,450,257(来自 NCBI)
▼ 说明
β-防御素是典型的阳离子抗菌肽家族,其共同的特征基序由 6 个保守的半胱氨酸组成。 DEFB123 是染色体 20q11.1 上β-防御素簇的一部分,在男性生殖道中表达(Radhakrishnan 等,2005)。
▼ 克隆与表达
Schutte 等人通过使用多种计算工具进行基因组序列分析(2002) 鉴定出人类 DEFB123。预测的蛋白质含有 β-防御素特征的 6-半胱氨酸结构域。 EST数据库分析表明DEFB123被转录。
Radhakrishnan 等人使用 RT-PCR 和 EST 数据库分析(2005) 克隆了人和猕猴 DEFB123。预测的人类 DEFB123 蛋白有 67 个氨基酸,并包含 β-防御素的保守 6-半胱氨酸特征基序。人体组织的 RT-PCR 显示仅在男性生殖道中大量表达 DEFB123。 DEFB123在睾丸和附睾头区表达丰富,但在体区表达较低。
▼ 基因结构
拉达克里希南等人(2005) 确定,像大多数 β-防御素基因一样,DEFB123 包含 2 个外显子。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Schutte 等人(2002) 将 DEFB123 基因定位在染色体 20q11.1 上的 β-防御素基因簇内。同线小鼠簇位于 2 号染色体上。
▼ 进化
Radhakrishnan 等人的进化分析(2005) 认为染色体 20q11.1 上的 β-防御素基因簇(包括 DEFB123)起源于一系列重复事件和正选择。
▼ 命名法
舒特等人(2002) 指出小鼠和人类 β-防御素基因是使用茎根“Defb”命名的。和“DEFB”,分别。小鼠基因编号从1开始,而人类基因编号从101开始。在确认直系同源基因的情况下,使用较低的基因编号。例如,小鼠 β-defensin-1(Defb1) 和人 β-defensin-1(DEFB101) 被确认为直系同源物,因此分别命名为 Defb1 和 DEFB1(602056)。