SDS3 同源物,SIN3A 核心抑制复合物成分; SUDS3

SDS3,酵母,同源物; SDS3
SIN3A 相关蛋白,45-KD; SAP45

HGNC 批准的基因符号:SUDS3

细胞遗传学位置:12q24.23 基因组坐标(GRCh38):12:118,376,555-118,418,033(来自 NCBI)

▼ 说明

SDS3 是组蛋白脱乙酰酶(参见 HDAC1;601241)依赖性 SIN3A(607776) 辅阻遏物复合体的亚基(Fleischer 等人,2003)。

▼ 克隆与表达

Alland 等人使用小鼠 Sin3a 的 C 末端作为小鼠胚胎 cDNA 文库的酵母 2 杂交筛选中的诱饵(2002) 克隆 Sds3。数据库分析表明,推导的328个氨基酸的蛋白质与人SDS3有99.6%的同一性,与酵母Sds3有18%的同一性。对一组成年小鼠组织的分析检测到 2.4-kb 转录物的广泛表达,以及由替代多聚腺苷酸化信号产生的 1.8-kb 转录物的广泛表达。表达分析揭示了核染色模式。对瞬时转染的人胚胎肾细胞中的 Sds3 进行蛋白质印迹分析,结果显示其表观分子质量约为 48 kD,而过表达时则有一条不太显着的 52 kD 条带。

弗莱舍等人(2003) 从 K562 人红白血病细胞中纯化了 SIN3A 复合物。通过对与复合物相关的多肽进行微测序,然后进行数据库分析、RT-PCR 和筛选 K562 细胞 cDNA 文库,他们克隆了全长 SDS3,并将其称为 SAP45。推导的蛋白质含有328个氨基酸。 Northern 印迹分析检测到所有检查的人类细胞系中都有 SDS3 表达。

▼ 基因功能

奥兰德等人(2002) 表明小鼠 Sds3 可以同源二聚化,并且可以在体外和体内与小鼠 Sin3a 和 Sin3b(607777) 相互作用。 Sds3 的 N 末端区域介导同源二聚化,中心区域介导 Sin3 结合。 Sds3 和 Sin3b 还与 Hdac1(601241) 形成复合物。 Sds3 不表现出内在的脱乙酰酶活性,但以 Sin3b 增强的方式招募 HDAC 催化活性。跨越同源二聚化和 Sin3 相互作用结构域的 Sds3 片段在报告基因测定中抑制转录活性,并且同源二聚化结构域或 Sin3 相互作用结构域的破坏降低了 Sds3 的抑制活性,表明这两种功能都有助于 Sds3 相关的转录活性。镇压活动。

通过凝胶过滤组分的蛋白质印迹分析,Fleischer 等人(2003) 发现 SDS3 与 K562 红白血病细胞中超过 500 kD 的 SIN3A 复合物以及较小的蛋白质复合物相关。除 SDS3 外,SIN3A 复合体还包含 SAP180(ARID4B;609696)、SAP130(609697)、RbAp48(RBBP4;602923)、SAP30(603378)、HDAC1 和 HDAC2(605164)。 SAP180、SAP130 和 SDS3 结合 SIN3A 的中央 HDAC 相互作用域。 SAP130 和 SDS3 还结合 SIN3A N 端一半的序列,与 HDAC 相互作用结构域不同。 SAP180、SAP130 和 SDS3 在靶向 DNA 时均会抑制转录。

▼ 测绘

国际辐射混合测绘联盟将 SDS3 基因测绘到 12 号染色体(RH94298)。

▼ 动物模型

大卫等人(2003)报道小鼠Sds3的种系或体细胞缺失产生与猖獗的非整倍性、有缺陷的核分裂以及因此的胞质分裂失败相关的细胞致死状态。 Sds3缺陷细胞无法对中心异染色质组蛋白进行脱乙酰化和甲基化,也无法招募必需的异染色质相关蛋白,导致染色体关联异常,从而导致染色体分离失败。 Sin3 结合缺陷的突变 Sds3 分子未能挽救 Sds3 无效表型。大卫等人(2003) 提出 SDS3 及其相关的 SIN3/HDAC 成分在细胞分裂过程中染色体的正确分布中发挥着核心作用。