ATP 结合框,亚科 C,成员 9; ABCC9
磺酰脲受体2;SUR2
HGNC 批准的基因符号:ABCC9
细胞遗传学位置:12p12.1 基因组坐标(GRCh38):12:21,797,389-21,941,426(来自 NCBI)
▼ 说明
ABCC9 基因编码调节性磺酰脲受体(SUR2),该受体与成孔亚基 KCNJ8(600935 和 KCNJ11(600937))共同组装,形成核苷酸门控钾通道(Smeland 等人总结,2019)。
▼ 克隆与表达
ATP 敏感钾通道或 K(ATP) 通道的特征是,当细胞质细胞表面的 ATP 浓度增加时,通道开放受到抑制。稻垣等人(1996) 指出,磺酰脲类药物被广泛用作治疗非胰岛素依赖型糖尿病(NIDDM) 的口服降血糖药,已被证明可以抑制 K(ATP) 通道的活性。 Aguilar-Bryan 等人克隆了与高亲和力磺酰脲受体 SUR(600509) 相对应的 cDNA(1995)。稻垣等人(1995) 表明胰腺 β 细胞 K(ATP) 通道至少由 2 个亚基组成:BIR(600937) 和 SUR。 Inagaki 等人克隆了 SUR 的同种型,命名为磺酰脲受体 2(SUR2)(1996) 来自大鼠脑 cDNA 文库。 5,300 bp 的 cDNA 序列编码 1,545 个氨基酸的多肽,与 SUR 具有 68% 的同一性。 Northern blot分析显示Sur2的组织分布与SUR不同。
Chutkow 等人使用大鼠 Sur2 作为探针(1996) 从骨骼肌 cDNA 文库中克隆了 SUR2。 Northern blot分析检测到3个SUR2转录本,大小分别为9.4、7.6和5.6 kb,其中较长转录本在心脏和骨骼肌中水平最高。在其他检查的组织中几乎没有检测到 SUR2 表达。查特科等人(1996) 克隆了 2 个选择性剪接的小鼠 Sur2 cDNA,编码 1,512 和 1,547 个氨基酸的推导蛋白,计算分子量分别为 170 和 174 kD。小鼠 Sur2 具有 13 个跨膜结构域和细胞内 Walker A 和 B ATP 结合结构域。与人类 SUR2 表达模式相反,小鼠 Sur2 普遍表达为 9.4 kb 转录本。骨骼肌和心脏中也检测到了最高水平的 8.6 kb 转录物,而主动脉和膀胱中的水平较低。 16.5 天小鼠胚胎的原位杂交证实了普遍存在的表达。
斯梅兰等人(2019) 指出 ABCC9 被选择性剪接以产生 2 个主要亚型:SUR2A 和 SUR2B。
▼ 测绘
作者:FISH,Chutkow 等(1996) 将 ABCC9 基因定位到染色体 12p12.1。
▼ 基因功能
稻垣等人(1996) 发现大鼠 Sur2 和 BIR 在 COS-1 细胞中的共表达重建了心肌和骨骼肌中描述的 K(ATP) 通道的特性。然而,Sur2/BIR 通道对 ATP 和磺酰脲格列本脲的敏感性均低于 SUR/BIR 通道。 Sur2/BIR 通道可被心脏 K(ATP) 通道开放剂克罗卡林和吡那地尔激活,但不会被二氮嗪激活。作者指出,Sur2 对磺酰脲类药物的亲和力比 SUR 低 500 倍。
▼ 分子遗传学
扩张型心肌病10
比恩格拉伯等人(2004) 在 ABCC9 基因的外显子 38 中发现了 2 个突变,导致扩张型心肌病(CMD1O; 608569)。一名 55 岁时被诊断出患有移码突变(601439.0001)的男性在 60 岁时死于心力衰竭。一名 40 岁时被诊断出的女性进行了 ala1513 至 thr 的替换(601439.0002)。她的父亲在 54 岁时被诊断出患有心力衰竭,并于 55 岁时去世。所有 3 人均有室性心动过速且冠状动脉造影正常。 SUR 蛋白的 C 末端有助于 K(ATP) 通道转移,用 Kir6.2(600937) 重构的移码和错义 SUR2A 突变体在质膜中的表达量降低;然而,突变的 K(ATP) 通道复合物形成了具有完整孔特性的功能通道。结构分子动力学刺激表明,残基 ala1513 和 leu1524 位于 C 端 β 链侧翼,非常接近标志性 Walker A 基序,这是协调 ATP 结合框蛋白催化口袋中核苷酸所需的。用空间更大且更亲水的苏氨酸残基替换 ala1513 或移码引起的 C 末端截断会破坏 C 末端 β 链的折叠。 ATP 诱导的 K(ATP) 通道门控在两种通道突变体中均出现异常,表明突变诱导的结构改变扭曲了 ATP 依赖性孔调节。
家族性心房颤动 12
Olson 等人对一名患有阵发性心房颤动(ATFB12; 614050) 的 53 岁白人女性进行了研究(2007) 对心脏离子通道基因进行了测序,并鉴定了 ABCC9 基因的杂合突变(T1547I;601439.0003)。作者表示,随后对另外 154 名具有不同 AF 表现的患者进行 T1547I ABCC9 突变的针对性筛查表明,这种特定的基因替代并不常见。
多毛症骨软骨发育不良
van Bon 等人在来自 10 个患有多毛症骨软骨发育不良(Cantu 综合征;239850)家族的 14 名患者中,有 11 名患者进行了研究(2012) 鉴定了 ABCC9 基因(601439.0004-601439.0007) 中 4 个不同错义突变的杂合性。范邦等人(2012) 指出,先前报道的与 CMD10 相关的 ABCC9 突变发生在仅在亚型 SUR2A 中转录的外显子中,显示出高心肌表达,这可能解释了为什么该表型仍然局限于心脏。
Harakalova 等人在 16 名 Cantu 综合征患者中的 14 名中进行了研究(2012)鉴定了ABCC9基因中11种不同错义突变的杂合性(参见例如601439.0004、601439.0005和601439.0008-601439.0011)。除一对母子外,所有可获得父母 DNA 的患者均显示该突变是从头出现的。所有突变都涉及蛋白质的高度保守区域,并且在 5,000 多个公开可用的全外显子组序列中不存在任何突变。电生理学研究表明,突变通道减少了 ATP 介导的钾通道抑制,导致通道开放。
癌症中的体细胞突变
勒加洛等人(2012) 使用全外显子组测序全面搜索 13 个原发性浆液性子宫内膜肿瘤中的体细胞突变(见 608089),随后对 18 个基因进行了重新测序,这些基因在超过 1 个肿瘤中发生突变和/或是来自 40 个肿瘤的丰富功能分组的组成部分。其他浆液性肿瘤。勒加洛等人(2012) 在 ABCC9 基因中发现了高频率(6%) 的体细胞突变。
智力障碍和肌病综合症
Smeland 等人在来自挪威北部同一地区 2 个无关家庭的 6 名患者中,可能有芬兰血统,患有智力障碍和肌病综合征(IDMYS; 619719)(2019) 鉴定了 ABCC9 基因中的纯合剪接位点突变(601439.0012)。该突变是通过基因组的下一代靶向测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分离。表达突变的细胞的体外功能表达测定显示,与对照相比,蛋白质表达减少约 50%,并且 K(ATP) 通道功能完全丧失,与功能丧失一致。没有证据表明存在显性负效应。作者推测,一些表型特征可能是由于横纹肌、平滑肌和脑血管系统中该基因的功能被破坏所致。
▼ 动物模型
斯梅兰等人(2019)发现,尽管感觉运动功能正常,但 Abcc9 基因外显子 8 存在无义突变的纯合小鼠由于易疲劳而表现出运动性能逐渐下降。年长的突变小鼠出现心脏异常,包括左心室功能受损、扩张型心肌病和高血压。认知和行为测试中未观察到异常。与对照组相比,CRISPR/Cas9介导的斑马鱼abcc9基因敲除导致整体运动减少和总游泳距离减少,但它们的运动时间相似。与对照组相比,突变斑马鱼出现收缩功能障碍、心输出量减少、心脏增大、红细胞速度增加(可能是高血压)。他们还表现出近距性是一种孤立的畸形特征。在突变小鼠中没有观察到近距性。
▼ 等位基因变异体(12 个精选示例):
.0001 心肌病,扩张,1O
ABCC9、3-BP DEL、4-BP INS、EX38
Bienengraeber 等人在一名 55 岁男性患有扩张型心肌病伴室性心动过速(CMD1O; 608569) 中进行了研究(2004) 发现了 ABCC9 基因中的一个复杂突变,先是 3 bp 缺失,然后是 4 bp 插入(4570-4572delTTAinsAAAT),导致 leu1524 发生移码,并引入 4 个异常末端残基,随后引入提前终止密码子。患者于60岁时去世,无扩张型心肌病家族史。在 500 名不相关的对照个体中未发现这种突变。
.0002 心肌病,扩张,1O
ABCC9、ALA1513THR
Bienengraeber 等人对一名患有扩张型心肌病伴室性心动过速(CMD1O; 608569) 的 40 岁女性进行了研究(2004) 在 ABCC9 基因的核苷酸 4537 处鉴定出 G 到 A 的转变,导致密码子 1513(A1513T) 处丙氨酸到苏氨酸的取代。患者的父亲因心力衰竭去世,享年 55 岁。该突变在患者的母亲中不存在,表明遗传自受影响的父亲。在 500 名不相关的对照个体中未发现这种突变。
.0003 心房颤动,家族性,12(1 名患者)
ABCC9、THR1547ILE
Olson 等人对一名患有阵发性心房颤动(ATFB12; 614050) 的 53 岁白人女性进行了研究(2007) 鉴定了 ABCC9 基因外显子 38 中 4640C-T 转变的杂合性,导致 C 末端保守残基处发生 thr1547 至 ile(T1547I) 取代。该患者的亲属拒绝进行临床或基因评估,但在 2000 名无关且主要是白人的对照中并未发现突变。膜片钳分析表明,T1547I 突变损害了 K(ATP) 电流的腺嘌呤核苷酸依赖性诱导。与 Kir6.2(KCNJ11; 600937) 孔共表达的突变体 SUR2A 产生了一个异常通道,该通道保留了 ATP 诱导的钾电流抑制,但对 ADP 的反应减弱。此外,Kir6.2 基因敲除小鼠响应肾上腺素刺激而出现 AF,而野生型小鼠则保持正常窦性心律。
.0004 多毛症骨软骨发育不良
ABCC9、ARG1154TRP
van Bon 等人在 3 名无关的多毛性骨软骨发育不良患者(Cantu 综合征;239850)中进行了研究(2012) 鉴定了 ABCC9 基因外显子 27 中从头 3460C-T 转变的杂合性,导致在第二个 1 型跨膜结构域(TMD2) 中的高度保守残基处发生 arg1154-to-trp(R1154W) 取代。在 5,000 多个公开的外显子组中均未发现该突变。
Harakalova 等人对一名患有 Cantu 综合征的 5.5 岁女孩进行了研究(2012) 鉴定了 ABCC9 中的从头 R1154W 突变的杂合性。患者表现出 Cantu 综合征的特征性面容和全身多毛症,伴有深部掌/足底皱纹、皮肤柔软、头发呈银色光泽、动脉导管未闭和卵圆孔,左心室处于正常上限在尺寸方面。
.0005 多毛症骨软骨发育不良
ABCC9,ARG1154GLN
来自 3 个 Cantu 综合征家庭的 5 名患者(239850),其中包括一名母亲和 2 名女儿,最初由 Grange 等人报道(2006),范邦等人(2012) 鉴定了 ABCC9 基因外显子 27 中 3461G-A 转变的杂合性,导致第二个 1 型跨膜结构域(TMD2) 中高度保守的残基处 arg1154 到 gln(R1154Q) 取代。在 5,000 多个公开的外显子组中均未发现该突变。
一名 15 个月大的男孩和一名无关的 20 岁女性患有 Cantu 综合征,以及 Scurr 等人之前报道的一名 21 岁女性患者(2011),哈拉卡洛娃等人(2012) 鉴定了 ABCC9 中 R1554Q 突变的杂合性。人胚胎肾细胞中的由内向外膜片钳实验表明,与野生型相比,R1154Q 突变通道的 ATP 敏感性降低。
.0006 多毛症骨软骨发育不良
ABCC9,CYS1043TYR
van Bon 等人对一名患有 Cantu 综合征(239850) 的 4.5 岁女孩进行了研究(2012) 鉴定了 ABCC9 基因中从头 3128G-A 转变的杂合性,导致第二个 1 型跨膜结构域(TMD2) 中的 cys1043-to-tyr(C1043Y) 取代。在 5,000 多个公开的外显子组中均未发现该突变。
.0007 多毛性骨软骨发育不良
ABCC9、ALA478VAL
van Bon 等人在患有 Cantu 综合征的父女(239850) 中(2012) 鉴定了 ABCC9 基因中 1433C-T 转变的杂合性,导致第一个 1 型跨膜结构域(TMD1) 中由 ala478 替换为 val(A478V)。在 5,000 多个公开的外显子组中均未发现该突变。
.0008 多毛症骨软骨发育不良
ABCC9、ARG1116HIS
Harakalova 等人在一对患有 Cantu 综合征的母子(239850) 中(2012) 鉴定了 ABCC9 基因中 3347G-A 转变的杂合性,导致第二个跨膜结构域中高度保守的残基处 arg1116 到 his(R1116H) 取代。超过 5,000 个公开可用的全外显子组序列中不存在该突变。人胚胎肾细胞中的由内向外膜片钳实验表明,与野生型相比,R1116H 突变通道的 ATP 敏感性降低。
.0009 多毛症骨软骨发育不良
ABCC9、ARG1116CYS
Scurr 等人先前报道,一名 4 岁男孩患有 Cantu 综合征(239850)(2011),哈拉卡洛娃等人(2012) 鉴定了 ABCC9 基因中 3346C-T 转变的杂合性,导致第二个跨膜结构域中高度保守的残基处的 arg1116 到 cys(R1116C) 取代。超过 5,000 个公开可用的全外显子组序列中不存在该突变。
.0010 多毛性骨软骨发育不良
ABCC9、SER1020PRO
一名 12 岁女孩患有 Cantu 综合征(239850),最初由 Robertson 等人报道(1999),哈拉卡洛娃等人(2012) 鉴定了 ABCC9 基因中从头 3058T-C 转变的杂合性,导致第二个跨膜结构域中高度保守的残基处发生 ser1020 到 pro(S1020P) 的取代。超过 5,000 个公开可用的全外显子组序列中不存在该突变。
.0011 多毛性骨软骨发育不良
ABCC9、HIS60TYR
Scurr 等人之前报道过一名 15 岁女孩患有 Cantu 综合征(239850)(2011),哈拉卡洛娃等人(2012) 鉴定了 ABCC9 基因中 178C-T 转变的杂合性,导致跨膜结构域 0 中高度保守的残基发生 his60 到 tyr(H60Y) 取代。
.0012 智力障碍和肌病综合症
ABCC9、IVS8DS、G-A、+1
Smeland 等人在来自挪威北部同一地区 2 个无关家庭的 6 名患者中,可能有芬兰血统,患有智力障碍和肌病综合征(IDMYS; 619719)(2019) 在 ABCC9 基因中鉴定出纯合的 G 到 A 转换(c.1320+1G-A, NM_020297.2),导致剪接缺陷和跨膜内外显子 8(Ala389_Gln440del) 的框内缺失1 个域(TMD1)。该突变是通过基因组的下一代靶向测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分离。该变体存在于共享的纯合性区域内。它在 gnomAD 数据库中以杂合状态存在,在芬兰人群中的频率为 0.0007,在非芬兰欧洲人中的频率为 0.00004。它在 gnomAD 的亚洲和非洲人群中不存在,并且从未在纯合状态下观察到。表达突变的细胞的体外功能表达测定显示,与对照相比,蛋白质表达减少约 50%,并且 K(ATP) 通道功能完全丧失,与功能丧失一致。没有证据表明存在显性负效应。