含有三联基序的蛋白质 7; TRIM7
糖原相互作用蛋白;GNIP
HGNC 批准的基因符号:TRIM7
细胞遗传学位置:5q35.3 基因组坐标(GRCh38):5:181,193,924-181,205,196(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Reymond 等人使用 B框 结构域共有序列筛选 EST 数据库中的新 TRIM 家族成员(2001) 鉴定并克隆了小鼠和人类 TRIM7。推导的蛋白质包含 N 端 RING 结构域、2 型 B框 结构域和卷曲螺旋区域。对几种成人组织的 Northern 印迹分析检测到骨骼肌中存在 2 kb 的转录物。表达在胚胎组织中普遍存在。用荧光标记的 TRIM7 转染骨肉瘤和 HeLa 细胞导致弥漫性核和细胞质表达。
Skurat 等人使用兔糖原蛋白(GYG; 603942) 作为诱饵,对人骨骼肌 cDNA 文库进行酵母 2 杂交筛选,然后进行数据库分析(2002) 鉴定并克隆了 4 个由选择性剪接产生的 TRIM7 变体。一个转录本与 Reymond 等人分离的 TRIM7 相同(2001) 并编码推导的 221 个氨基酸的蛋白质。斯库拉特等人(2002) 将另外 3 个转录本指定为 GNIP1、GNIP2 和 GNIP3。 GNIP1 编码最长的推导蛋白,有 511 个氨基酸,计算分子量为 56.6 kD。 GNIP1 的 N 端 206 个氨基酸与 TRIM7 的相同,但 GNIP1 延伸至包括 C 端 B30.2 样结构域。 GNIP2 编码一种截短的 303 个氨基酸蛋白,该蛋白缺乏 GNIP1 的所有 N 端结构域,仅具有 B30.2 样结构域。 GNIP3 是一种由 329 个氨基酸组成的蛋白质,与其他 GNIP 蛋白质的 N 末端不同,但它具有 C 末端 B30.2 结构域。 Northern 印迹分析在骨骼肌和胎盘中分别检测到约 3.4 和 1.3 kb 的主要转录物。在其他组织中也检测到了一些次要的转录本。
▼ 基因功能
通过酵母 2-杂交分析,Skurat 等人(2002) 确定 GNIP1 和 GNIP2 直接与糖原相互作用。糖原蛋白和表位标记的 GNIP2 可以从转染的 COS 细胞中进行免疫共沉淀。 GNIP2 在体外自糖基化反应中增加了葡萄糖与糖原的结合。两种蛋白质的浓度相同时会出现最大激活,表明化学计量比为 1:1。 GNIP2 使反应速度提高约 4 倍,但对糖原蛋白与 UDP-葡萄糖的亲和力没有影响。当使用低分子质量受体时,GNIP2不影响糖原蛋白的葡萄糖转移,表明GNIP2的作用仅限于自糖基化反应。
▼ 基因结构
斯库拉特等人(2002)确定TRIM7基因含有8个外显子。
▼ 测绘
通过辐射混合分析,雷蒙德等人(2001) 将 TRIM7 基因定位到染色体 5qter。