CCDC26 长非编码 RNA; CCDC26

卷曲螺旋结构域蛋白 26
视黄酸调节剂；RAM

HGNC 批准的基因符号：CCDC26

细胞遗传学位置：8q24.21 基因组坐标（GRCh38）：8:129,351,694-129,680,239（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

Yin等人使用逆转录病毒介导的插入诱变（2006） 建立了一种白血病细胞系 WY-1，该细胞对视黄酸（RA） 诱导的分化和凋亡具有抵抗力。逆转录病毒整合位点的图谱揭示了它插入到 CCDC26 基因的第一个内含子中，他们称之为 RAM。推导的蛋白质由 109 个氨基酸组成，预测分子量为 13.2 kD，具有 N 端信号序列。 EST数据库分析表明RAM在骨髓、脾脏、睾丸、眼睛、心脏、肾脏和皮肤中表达，其中在胚胎中表达最为突出。

▼ 基因结构

尹等人（2006） 确定 CCDC26 基因包含 4 个外显子，跨度超过 328 kb。第一个外显子周围的区域包含 3 个假定的 RA 响应元件。

▼ 测绘

通过基因组序列分析，Yin 等人（2006） 将 CCDC26 基因对应到染色体 8q24.21。

▼ 基因功能

尹等人（2006） 表明 9-cis RA 消除了亲代白血病细胞系中的 RAM 表达，但没有消除 WY-1 RA 抗性子细胞系中的 RAM 表达，这表明 WY-1 细胞中的逆转录病毒插入增强并维持了 RAM 表达，从而导致RA 反应性改变。 WY-1 细胞（而非亲本细胞系）也能抵抗 TRAIL（TNFSF10；603598）诱导的细胞凋亡。小干扰RNA（siRNA） 敲低RAM 本身不会激活细胞分化或细胞死亡，但会促进9-cis RA 诱导的分化和TRAIL 触发的细胞凋亡。

▼ 分子遗传学

扬楚斯等人（2022） 确定 rs55705857-G 等位基因（613040.0001） 是 8q24.21 位点（GLM7; 613032） 对 IDH1（147700）/IDH2（147650） 突变低级别胶质瘤（LGG） 易感性的致病风险变异。该变异存在于 CCDC26 基因内含子中的大脑和黑素细胞特异性增强子中。扬楚斯等人（2022） 表明 G 等位基因破坏 OCT2（164176）/OCT4（164177） 转录因子结合，从而增加与 MYC（190080） 启动子的相互作用并增加 MYC 表达。 IDH 突变神经胶质瘤中风险等位基因的存在增强了 LGG 特异性转录谱。在 IDH 突变 LGG 小鼠模型中，直系同源小鼠基因座的突变加速了肿瘤的发展，并将外显率从 30% 增加到 70%。扬楚斯等人（2022） 指出 rs55705857-G 变异与 40% IDH1/2 突变 LGG 患者的神经胶质瘤风险有关。

▼ 等位基因变异体（1 个选定示例）：

.0001 神经胶质瘤易感性 7
CCDC26,（rs55705857）-G

扬楚斯等人（2022） 鉴定出 SNP rs55705857 的 G 等位基因是 8q24.21 位点（GLM7; 613032） 对 IDH1（147700）/IDH2（147650） 突变低级别胶质瘤易感性的致病风险变异。 SNP rs55705857 位于长非编码 RNA CCDC26 的内含子中，位于脑和黑素细胞特异性增强子内，该增强子在选择性细胞谱系中具有活性，包括产生成体神经元干细胞（NSC） 和少突胶质细胞前体细胞的胚胎前体细胞（OPC）。扬楚斯等人（2022） 表明，从机制上讲，rs55705857-G 风险等位基因消除了 OCT2/4（164176/164177） 与该增强子的结合，并表现出与 MYC（190080） 启动子的物理相互作用增加以及 MYC 转录增加，表明 OCT2/4 的结合非风险 rs55705857-A 等位基因限制 MYC 表达。非风险 rs55705857-A 等位基因及其周围序列在鸭嘴兽等所有哺乳动物物种中完全保守。