丙酮酸脱氢酶磷酸酶调节亚基; PDPR
KIAA1990
HGNC 批准的基因符号:PDPR
细胞遗传学位置:16q22.1 基因组坐标(GRCh38):16:70,113,626-70,163,427(来自 NCBI)
▼ 说明
PDPR 是线粒体丙酮酸脱氢酶磷酸酶(EC 3.1.3.43) 的调节亚基。它通过降低催化亚基(PDP1; 605993) 对 Mg(2+) 的敏感性来抑制 Mg(2+) 依赖性和 Ca(2+) 刺激的活性(Lawson et al., 1997)。
▼ 克隆与表达
劳森等人(1997) 克隆牛 Pdpr。推导的 878 个氨基酸蛋白具有 31 个残基 N 端线粒体靶向前序列,随后是具有预测的 FAD 结合基序的成熟 847 个残基蛋白。
Ohara 等人通过对从大小分级的人脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(2002) 克隆了 PDPR,他们将其命名为 KIAA1990。推导的 883 个氨基酸的蛋白质与牛 Pdpr 具有 92% 的同一性。 RT-PCR ELISA 在所有成人和胎儿人体组织中检测到可变的 KIAA1990 表达,其中在成人肺和卵巢中表达最高。在所检查的所有特定成人大脑区域中均检测到可变的 KIAA1990 表达,其中在胼胝体和小脑中高表达。
▼ 基因功能
劳森等人(1997) 证实重组牛 Pdpr 与 Pdpc(PDP1) 结合并抑制其催化活性。与天然 Pdpr 一样,精胺与重组蛋白结合并抵消其对 Pdpc 的抑制活性。
▼ 测绘
Hartz(2018) 根据 PDPR 序列(GenBank AK000941) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 PDPR 基因对应到染色体 16q22.1。
▼ 分子遗传学
关联待确认
有关 PDPR 基因突变与 Joubert 综合征之间可能关联的讨论(参见 213300),请参见 617835.0001。
▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):
.0001 意义未知的变体
PDPR、GLY454CYS
该变异被归类为意义不明的变异,因为其对朱伯特综合征的贡献尚未得到证实。
阿拉扎米等人(2015) 报道了 2 个兄弟(家庭 13DG0274),由近亲父母所生,具有 Joubert 综合征特征(参见 213300),他们在 PDPR 中为 c.1360G-T 颠换(c.1360G-T,NM_017990)纯合子基因,导致 gly454 替换为 cys(G454C),从而与该家族中的疾病分离。这位出生 3 天的弟弟在 30 周时被确诊。妊娠时双侧后脑室和侧脑室扩张。他出生时就有呼吸急促的症状,但没有畸形特征或多指畸形。脑成像显示脑室扩大,涉及后角和颞角,并伴有邻近白质发育不全、胼胝体发育不全以及后枕叶皮质和内侧枕叶皮质的窄脑回/小脑回。肾脏超声检查正常。男孩1岁的弟弟根据脑桥的臼齿外观和薄胼胝体被诊断为朱伯特综合征;他四肢都患有轴后多指畸形。