半青素； HMCN1

FIBULIN 6； FBLN6
FIBL6

HGNC 批准的基因符号：HMCN1

细胞遗传学位置：1q25.3-q31.1 基因组坐标（GRCh38）：1:185,734,391-186,190,949（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

Vogel 和 Hedgecock（2001）克隆了秀丽隐杆线虫 hemicentin。推导的 5,198 个氨基酸的分泌蛋白包含一个 N 端结构域、48 个串联 Ig 模块、一个亲水间隔区、3 个串联 EGF（131530）模块和一个新的 C 端结构域。他们将秀丽隐杆线虫半中心素与 Carpten 等人鉴定的人类同源物进行了比较（2000）。 N 端结构域最为高度保守，具有 43% 的同一性，包括 2 个半胱氨酸的保守性。人半中心区的不同之处在于它包含 44 个串联 Ig 模块、6 个线虫蛋白中未发现的血小板反应蛋白 I（188060）模块和 8 个 EGF 模块。

▼ 基因结构

卡普滕等人（2000）确定 hemicentin 基因跨度约为 600 kb。

▼ 测绘

通过样本测序和外显子捕获，Carpten 等人（2000）将 hemicentin 基因（他们将其命名为 Z47）定位到染色体 1q24-q31。 Vogel 和 Hedgecock（2001）指出 hemicentin 基因定位于染色体 1q24-q25。

Gross（2016）根据 HMCN1 序列（GenBank AF156100）与基因组序列（GRCh38）的比对，将 HMCN1 基因对应到染色体 1q25.3-q31.1。

▼ 分子遗传学

舒尔茨等人（2003）在编码 hemicentin 的基因的外显子 104 中发现了 16273A-G 转换（608548.0001），该转换在先前患有年龄相关性黄斑变性 1（ARMD1; 603075）的一个大 3 代家族成员中与疾病单倍型完全分离。克莱因等人报道（1998）。通过 RT-PCR 分析，Schultz 等人（2003）证明半中心蛋白在成纤维细胞、视网膜色素上皮细胞和视网膜内皮细胞中表达，但外显子 104 在各种细胞类型中选择性剪接。

Fisher 等人在总共 1,662 名 ARMD 患者和 1,160 名对照者中进行了研究（2007）未能发现该疾病与 HMCN1 基因中的几种多态性和单倍型之间的显着关联。

舒尔茨等人（2005）回顾了有关半盘素在 ARMD 中的作用的文献、Q5345R 突变的关联研究结果以及 1q31 上的 ARMD 基因座的连锁证据。他们的结论是，如果在 HMCN1 基因中发现额外的致病突变，或者如果 ARMD 的第二个更常见的危险因素位于同一区域，则数据可以得到协调。

Pras 等人在患有 ARMD 的突尼斯犹太家庭的第 3 代受影响成员中（2015）在 HMCN1 基因（c.4162delC; 608548.0002）中发现了一个杂合 1-bp 缺失，该缺失与疾病分离，并且在 100 个种族匹配的对照、内部外显子组数据库或 dbSNP、1000 个基因组中未发现项目，或 NHLBI 外显子组数据库。

▼ 等位基因变异体（2 个选定示例）：

.0001 黄斑变性，与年龄相关，1，易感性
HMCN1、GLN5345ARG

Klein 等人之前报道过，在一个患有 ARMD1（603075）的大型 3 代家庭中受影响的个体中（1998），舒尔茨等人（2003）鉴定了 FBLN6 基因外显子 104 中的 16263A-G 转变，预计会导致 EGF 结构域中的 gln5345 至 arg（Q5345R）取代。在另外 288 名不相关的 ARMD 个体中，有 7 名发现了这种突变，这些个体也具有跨度为 1 Mb 的侧翼单倍型，而且在 174 名年龄从 57 岁到 89 岁不受影响的对照受试者中，有 4 名也发现了这种突变，表明不完全外显。

费舍尔等人（2007）发现 Q5345R 取代（他们将其称为 Q5346R）在对照群体中以低频多态性（0.0026）的形式发生。研究结果表明，这种多态性可能会导致一小部分患者对 ARMD 易感，但不会对疾病产生实质性影响。

.0002 与年龄相关的黄斑变性，1
HMCN1、1-BP DEL、4162C

Pras 等人在一个 3 代突尼斯犹太家庭的 7 名患有年龄相关性黄斑变性的成员中（ARMD1；603075）（2015）鉴定了 HMCN1 基因外显子 27 中 1 bp 缺失（c.4162delC、chr1.185,970,522、GRCh37）的杂合性，导致移码，预计会导致提前终止密码子（Pro1388Hisfs13）。在 100 个种族匹配的对照、内部外显子组数据库、dbSNP、1000 基因组计划或 NHLBI 外显子组数据库中均未发现该突变。