叶芝结构域蛋白 4; YEATS4
神经胶质瘤扩增序列 41;GAS41
HGNC 批准的基因符号:YEATS4
细胞遗传学位置:12q15 基因组坐标(GRCh38):12:69,359,743-69,462,793(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
基因扩增通常被认为发生在肿瘤发展的晚期,是高级别神经胶质瘤的一个共同特征。费舍尔等人(1997) 报道了 cDNA 的克隆和测序,他们将其命名为 GAS41,通过显微切割介导的 cDNA 捕获在胶质母细胞瘤细胞系中鉴定出该 cDNA(Gracia 等,1996)。在多形性胶质母细胞瘤和 III 级星形细胞瘤中发现 GAS41 拷贝数增加,并且在 I 级和 II 级星形细胞瘤中出现频率较高。序列比较表明 GAS41 蛋白、酵母和人 AF9(159558) 以及人 ENL(159556) 之间具有高度相似性。费舍尔等人(1997)指出AF9和ENL都属于一类转录因子,表明GAS41也可能代表转录因子。由于 GAS41 是第一个在低级别胶质瘤中发现拷贝数增加的基因,这项研究提供了第一个证据表明基因扩增可能发生在早期肿瘤发展中。
▼ 基因功能
NuA4 组蛋白乙酰转移酶(HAT) 复合物负责酵母中组蛋白 H4(参见 602822)和 H2A(参见 613499)N 末端尾部的乙酰化。其催化亚基 Esa1 与人 TIP60(HTATIP; 601409) 同源。 Doyon 等人使用亲和纯化、蛋白质印迹分析、细胞分级分离、免疫沉淀和质谱分析(2004) 发现 TIP60 及其剪接变体 TIP60B/PLIP 是多亚基 NuA4 复合物的一部分,在多种人类细胞系中具有 HAT 活性。他们鉴定了 12 个酵母 NuA4 亚基中的 11 个的人类同源物,包括 GAS41。
通过对人 293T 细胞进行免疫沉淀分析,Park 和 Roeder(2006) 发现 GAS41 与 TIP60 复合体核心亚基和 H2AZ(H2AFZ; 142763) 相关,H2AZ(H2AFZ; 142763) 是 SWI2/SNF2(SMARCA2; 600014) 相关 CBP(CREBBP; 600140) 激活蛋白(SRCAP) 复合物,证实 GAS41 是 TIP60 和 SRCAP 复合物的真正亚基。含有 GAS41 的 TIP60 复合物在游离核心组蛋白上表现出典型的 TIP60 介导的 H3 和 H4 乙酰转移酶活性。用小干扰 RNA 敲低 GAS41 表达或特异性中断 GAS41 蛋白 C 端卷曲螺旋基序可激活 p53(TP53; 191170) 肿瘤抑制途径。 p53 通路的激活不是由 TIP60 复合物组装或 p53 的 TIP60 共激活子功能的变化引起的。在正常未应激细胞中,GAS41 预先结合到 2 个 p53 肿瘤抑制通路基因 p21(CDKN1A; 116899) 和 p14(ARF)(CDKN2A; 600160) 的启动子上,但 GAS41 在响应 p53 激活应激信号时与两个启动子解离。 。
Fazzio 等人在小鼠胚胎干(ES) 细胞中使用 RNA 干扰(2008) 发现 Tip60-p400(EP400; 606265) HAT 和核小体重塑复合物的 7 个成分(包括 Yeats4)的任何耗尽都会导致相同的表型。与在球形 3 维集落中生长的正常 ES 细胞不同,耗尽任何 7 个 Tip60-p400 HAT 成分的 ES 细胞表现出扁平且拉长的形态,具有单层生长和减少的细胞与细胞接触。这些敲低细胞继续循环,S期细胞减少,G2期细胞增加。 Tip60-p400 HAT 成分敲低的效果是 ES 细胞所特有的,因为在小鼠胚胎成纤维细胞中敲低后观察到的变化可以忽略不计。
通过酵母 2-杂交和共免疫沉淀分析,Lauffart 等人(2002) 表明 TAAC1(605301) 与 GAS41 C 端 109 个氨基酸相互作用。
齐默尔曼等人(2002) 发现,对鸡前淋巴细胞系中的两个 Gas41 等位基因进行靶向破坏会导致 RNA 合成显着减少以及随后的细胞死亡,这表明 GAS41 是 RNA 转录所必需的。
布拉斯等人(2004) 发现鸡 Gas41 启动子包含几个潜在的 Myb(189990) 结合位点,并证明 Gas41 是 v-Myb 靶基因。
▼ 测绘
GAS41 基因定位于染色体 12q13-q15(Gracia 等,1996)。