原钙粘蛋白-γ,亚家族 A,成员 5; PCDHGA5
PCDH-γ-A5
HGNC 批准的基因符号:PCDHGA5
细胞遗传学位置:5q31.3 基因组坐标(GRCh38):5:141,364,162-141,512,975(来自 NCBI)
▼ 说明
钙粘蛋白是钙依赖性细胞间粘附分子,原钙粘蛋白构成非经典钙粘蛋白的一个亚家族。 PCDHGA5 是染色体 5q31 上 PCDHG 基因簇(604968) 内 22 个串联排列的基因之一。 22 个 PCDHG 基因作为“变量”发挥作用。外显子分别剪接到下游恒定区以形成不同的 PCDHG 转录物。可变的 PCDHG 外显子编码原钙粘蛋白的胞外和跨膜结构域,共同区域编码胞内结构域(Wu et al., 2001)。有关 PCDHG 基因的更多信息,请参阅 604968。
▼ 克隆与表达
Matsuyoshi 等人使用带有简并引物的 PCR 来筛选黑色素瘤细胞系(1997)获得了编码PCDHGA5部分的cDNA片段,他们将其命名为ME3。 RT-PCR 分析检测到 ME3 在 2 个黑色素瘤细胞系中的 1 个中表达,但在正常黑色素细胞中没有表达。
Wu 和 Maniatis(1999) 通过对脑 cDNA 文库进行 PCR 克隆了全长 PCDHGA5。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Wu 等人(2001) 将 PCDHGA5 基因定位到染色体 5q31,位于 PCDHGB2 基因(606300) 和 PCDHGB3 基因(606301) 之间。他们将小鼠 PCDHG 基因定位于 18c 号染色体。