V-RAF鼠肉瘤3611病毒致癌同源物1
通过筛选严谨的胎儿肝脏cDNA文库中的v-raf相关序列,Mark等人(1986)发现了一个序列,除了预期的RAF1(164760)。他们将此序列称为PKS(大概是“蛋白激酶序列”),与RAF1的核苷酸同源性为71%。激酶结构域的预测氨基酸序列与v-raf序列十分相似,表明PKS可能编码具有丝氨酸/苏氨酸激酶活性的多肽。马克等(1986) 发现从2例伴有蛋白异常血症的血管免疫母细胞淋巴结病患者分离的外周血单核细胞中,PKS mRNA的表达(2.7 kb)升高,该疾病是在B细胞淋巴增生激活后产生自身抗体的疾病。
细胞遗传学位置:Xp11.3
基因座标(GRCh38):X:47,561,204-47,571,907
通过用v-raf癌基因探针筛选小鼠cDNA文库,Huebner等人(1986)也分离了代表与RAF1不同的基因的转化raf相关的cDNA,A-raf。作为分析与RAF1相关的cDNA的第一步,他们分离了人的ARAF cDNA,并用它在小鼠和人中定位基因。
贝克等(1987)从cDNA的2,453-核苷酸序列推导了人ARAF1癌基因的完整606-氨基酸序列。
Yuryev等(2000)指出,ARAF包含一个N端调节域和一个C端催化域。调节结构域包含RAS(HRAS;190020)结合结构域和富含半胱氨酸的结构域。分离大鼠肝脏的免疫组织化学分析和免疫电子显微镜检查显示,一部分Araf定位于线粒体。
▼ 基因功能
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由于在其激酶结构域中与RAF1具有80%的同源性,Huebner等(2003年)(1986)推测ARAF1基因产物可能具有丝氨酸/苏氨酸特异性激酶活性。
RAF原癌基因编码胞质蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶,在细胞生长和发育中起关键作用。小鼠中的Araf1主要在泌尿生殖道组织中表达(Lee等,1994)。
Pelkmans和Zerial(2005)探索了一些激酶在小窝动力学中的作用。他们使用RNAi鉴定了海绵体循环不同步骤的功能。在第一步中,ARAF1(一种参与有丝分裂信号的丝氨酸/苏氨酸激酶)的沉默导致了弥漫性CAV1(601047)-GFP染色,除了具有特征性的斑点样图案外,还可以横向移动。作者建议,在没有ARAF1的情况下,小窝涂层的稳定性或组装效率较低。他们的观察揭示了小窝转移的新原理,并表明小窝的动态特性及其转运能力受在几个水平上起作用的不同激酶的调节。
Yuryev等人使用酵母2杂交分析HeLa细胞(2000)显示ARAF的N末端调节结构域与假定的线粒体蛋白TOM(PPRF6; 613979)和TIM44(TIMM44; 605058)相互作用。
▼ 基因结构
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Lee等(1994)证明人的ARAF1基因包含由至少10,776个核苷酸编码的16个外显子。
▼ 测绘
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Huebner等(1986)使用人类ARAF cDNA在小鼠和人类中定位基因。在中国仓鼠-小鼠杂交细胞中,小鼠基因与X染色体共分离。在人类中,分别命名为ARAF1和ARAF2的2个孤立分离的基因座分别定位于染色体X和7(Huebner等人(1986)并没有得出结论说7号染色体上的ARAF2基因座已被转录,实际上现在被称为ARAF2P的ARAF2基因座已被证明是假基因(Lee等人,1994)。)小鼠的单个X连锁的ARAF基因座和人的ARAF1基因座在几种小鼠和人类细胞系中活跃地转录。通过原位杂交,Huebner等人(1986年)将ARAF1基因定位到Xp21-q11,大多数颗粒位于Xp13-p11。Popescu和Mark(1989)通过原位杂交将该基因区域化为Xp11.4-p11.2。
Avner等(1987)发现在老鼠中,A-raf癌基因在X染色体上,靠近Hprt基因10到17 cM。该定位被认为与人着丝粒和Xp21之间的X染色体短臂上存在ARAF癌基因兼容。