表皮视网膜脱氢酶,2
RDHE2
表皮视网膜脱氢酶2
HGNC 批准的基因符号:SDR16C5
细胞遗传学位置:8q12.1 基因组坐标(GRCh38):8:56,300,005-56,320,175(来自 NCBI)
▼ 说明
RDHE2 属于短链醇脱氢酶/还原酶家族,其催化从视黄醇生成视黄醛的第一步和限速步骤(Matsuzaka 等,2002)。
▼ 克隆与表达
松坂等人(2002) 通过微阵列测定寻常型银屑病患者受影响皮肤中上调的 EST 鉴定了 RHDE2。他们利用培养的人角质形成细胞 cDNA 文库的 5-prime 和 3-prime RACE,克隆了 3 个全长 RHDE2 cDNA,这些 cDNA 具有不同的 3-prime 末端,这些末端是由于使用替代的聚腺苷酸化信号或位点而产生的。所有 3 个 cDNA 均编码推导的 309 个氨基酸的蛋白质,其中包含 70% 的短链醇脱氢酶/还原酶中保守的 3 个基序。 Northern印迹分析检测到仅在成人肺中表达的约2.4kb的转录物。 RT-PCR 在几乎所有检查的组织中均检测到表达。
▼ 基因功能
通过实时定量 RT-PCR,Matsuzaka 等人(2002) 发现寻常型银屑病患者受影响皮肤中 RDHE2 的表达比非病变或正常皮肤高约 3 倍。
▼ 基因结构
松坂等人(2002) 确定 RDHE2 基因包含 7 个外显子,跨度为 20 kb。 5-prime 侧翼区域富含 GC,包含 GC 框和多个转录因子的结合位点,但没有 TATA 或 CAAT 框。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Matsuzaka 等人(2002) 将 RDHE2 基因定位到染色体 8q12.1。 Southern印迹分析表明RDHE2是一个单拷贝基因。