潜在转化生长因子-β-结合蛋白 2; LTBP2
LTBP3,前
HGNC 批准的基因符号:LTBP2
细胞遗传学位置:14q24.3 基因组坐标(GRCh38):14:74,498,183-74,612,237(来自 NCBI)
▼ 说明
LTBP2 编码一种细胞外基质(ECM) 蛋白,该蛋白在弹性组织中表达,并与含有原纤维蛋白-1(FBN1; 134797) 的微纤维相关(Haji-Seyed-Javadi 等人总结,2012)。
▼ 克隆与表达
莫伦等人(1994) 鉴定了一种新型潜在转化生长因子-β 结合蛋白(参见 LTBP1;150390),命名为 LTBP2。
阿里等人(2009) 表征了 LTBP2 基因。该蛋白由 1,821 个氨基酸组成,由 20 个表皮生长因子(EGF) 样结构域、4 个转化生长因子-β 结合蛋白(TB) 样模块(每个模块包含 8 个半胱氨酸残基)和一个 N 末端信号肽组成。其中 16 个 EGF 结构域具有钙结合基序,有人提出这些结构域在钙结合时采用棒状分子排列,以便为蛋白质-蛋白质相互作用提供特定的表面。含有半胱氨酸的 TB 结构域是 LTBP-原纤维蛋白超家族的独特特征,提供一定程度的构象灵活性。 LTBP2 与 LTBP1 具有约 45% 的氨基酸同一性,与 fibrillin-1(FBN1; 134797) 具有约 25% 的氨基酸同一性,但与其他 LTBP 家族成员不同,它不与潜在形式的 TGFB 结合(190180)。 LTBP2 的 C 端区域与 LTBP1 竞争与微原纤维中 FBN1 的 N 端区域的特异性结合,但不与 FBN2(612570) 结合。
通过 RT-PCR 分析,Narooie-Nejad 等人(2009) 显示 LTBP2 在人眼中高表达,包括被认为与原发性先天性青光眼病因相关的小梁网和睫状突。人眼的免疫组织化学分析显示,LTBP2 在后弹力层和晶状体囊中表达最高,在睫状突、小梁网以及巩膜和角膜基质之间的过渡区的非色素上皮中也有表达。角膜基质、巩膜和虹膜中的表达极少。
▼ 基因家族
有关 LTBP 基因家族的综述,请参见 Oklu 和 Hesketh(2000)。
▼ 基因结构
阿里等人(2009)确定LTBP2基因包含35个外显子。
▼ 测绘
莫伦等人(1994) 通过体细胞杂交分析和荧光原位杂交将 LTBP2 基因定位到染色体 14q24。
▼ 分子遗传学
原发性先天性青光眼 3D
Ali 等人在 4 个巴基斯坦近亲家庭和 8 名患有原发性先天性青光眼(GLC3D; 613086) 的吉普赛人中进行了研究(2009) 鉴定了 LTBP2 基因中的纯合无义突变。数据表明,R299X(602091.0001) 是吉普赛人群中主要的原发性先天性青光眼创始人突变。
Narooie-Nejad 等人在 2 个患有原发性先天性青光眼的伊朗近亲家庭中(2009) 孤立鉴定了各自的纯合 1-bp 缺失(602091.0006-602091.0007)。
Azmanov 等人在 12 名患有先天性青光眼的罗姆/吉普赛先证者中进行了研究(2011) 鉴定了 R299X 创始人突变的纯合性。在另一名患者中,他们发现了 R299X 的复合杂合性和 CYP1B1 基因的错义突变(R368H;601771.0012)。然而,作者表示,他们的初步观察结果表明,该患者和其他患者中的 CYP1B1/LTBP2 组合没有临床意义,并且双基因遗传不太可能。
小球晶状体和/或巨角膜,伴有晶状体异位以及伴有或不伴有继发性青光眼
Kumar 等人发现,来自印度近亲家庭的 3 名受影响兄弟患有孤立性小球晶状体和晶状体脱位,对应到染色体 14q24-q32.12(MSPKA; 251750)(2010) 鉴定了 LTBP2 基因中移码突变的纯合性(602091.0005)。受影响的同胞中排除了原发性先天性青光眼,并且没有任何全身受累。
Desir 等人在来自摩洛哥近亲家庭的 3 名受影响同胞中,患有巨角膜、小球晶状体、晶状体异位和继发性青光眼,对应到染色体 14q23.3-q24.3(2010) 分析了候选基因 LTBP2,并鉴定了 1 bp 插入的纯合性(602091.0008)。在一名类似受影响的马其顿吉普赛裔女孩中,他们发现了 LTBP2 中 R299X 突变的纯合性,该突变先前在原发性先天性青光眼患者(包括欧洲吉普赛裔患者)中发现。
Khan 等人在来自 3 个近亲家庭的 8 名患有巨角膜和因球形晶状体和/或晶状体异位导致继发性青光眼的患者中(2011) 鉴定了 1 bp 缺失、无义突变和错义突变的纯合性(分别为 602091.0009-602091.0011)。
威尔-马切萨尼综合征 3
Haji-Seyed-Javadi 等人在患有 Weill-Marchesani 综合征(WMS3; 614819) 的伊朗近亲大家庭的受影响成员中(2012) 鉴定了 LTBP2 基因中错义突变(V1177M; 602091.0012) 的纯合性。
▼ 动物模型
希普利等人(2000) 有针对性地破坏小鼠中的 Ltbp2。全部在胚胎第 3.5 天至 6.5 天之间死亡。阿里等人(2009) 发现小鼠 Ltbp2 在全身结缔组织中表达,特别是脊髓、心肌、骨骼肌以及肾小管和生精小管。
▼ 命名法
LTBP3 符号以前在文献中用于 LTBP2,但 LTBP3 是不同 LTBP 基因的官方符号;参见 602090。
▼ 等位基因变异体(12 个精选示例):
.0001 青光眼 3,原发性先天性,D
包括小球晶状体和/或巨角膜,伴有晶状体异位以及伴有或不伴有继发性青光眼
LTBP2、ARG299TER
在患有先天性青光眼的巴基斯坦近亲家庭成员中(GLC3D;613086),Ali 等人(2009) 鉴定了 LTBP2 基因外显子 4 中核苷酸 895 处的 C 到 T 转变的纯合性,导致密码子 299(R299X) 处的 arg 到 ter 取代。
阿里等人(2009) 还在 15 名 CYP1B1(601771) 阴性吉普赛患者中的 8 名中发现了这种突变。作者认为,R299X 是吉普赛人群中的主要始祖突变,占该人群中 CYP1B1 阴性病例的 50% 以上以及所有 PCG 病例的近 40%。
Azmanov 等人在 12 名患有先天性青光眼的罗姆/吉普赛先证者中进行了研究(2011) 鉴定了 R299X 创始人突变的纯合性。在另一名患者中,他们发现了 R299X 的复合杂合性和 CYP1B1 基因的错义突变(R368H;601771.0012)。然而,作者表示,他们的初步观察结果表明,该患者和其他患者中的 CYP1B1/LTBP2 组合没有临床意义,并且双基因遗传不太可能。
Desir 等人对一名患有巨角膜、小球形晶状体和晶状体脱位的马其顿吉普赛裔 3 岁女孩(MSPKA; 251750) 进行了研究(2010) 鉴定了 LTBP2 基因中 R299X 突变的纯合性。她未受影响的父母是杂合突变,而在 100 名白人对照中未发现这种突变。 2岁时初次就诊时,她的眼压正常,3岁时仍未患青光眼。
.0002 青光眼 3,原发性先天性,D
LTBP2,1-BP DEL,412G
在患有先天性青光眼的巴基斯坦近亲家庭成员中(GLC3D;613086),Ali 等人(2009) 鉴定了 LTBP2 基因外显子 1(412delG) 位置 412 处的单核苷酸缺失的纯合性,导致移码并导致下游 140 个氨基酸的推定终止密码子(Ala138ProfsTer278)。
.0003 青光眼 3,原发性先天性 D
LTBP2、14-BP DEL、NT1243
在患有先天性青光眼的巴基斯坦近亲家庭成员中(GLC3D;613086),Ali 等人(2009) 鉴定了 LTBP2 基因外显子 6 中从核苷酸 1243(1243-1256del) 开始的 14 bp 缺失的纯合性,导致移码和蛋白质过早终止(Glu415ArgfsTer596)。
.0004 青光眼 3,原发性先天性 D
LTBP2、GLN111TER
在患有先天性青光眼的巴基斯坦近亲家庭成员中(GLC3D;613086),Ali 等人(2009) 鉴定了 LTBP2 基因外显子 1 中核苷酸 331 处 C 到 T 转换的纯合性,导致密码子 111(Q111X) 处发生 gln 到 ter 取代。
.0005 小球晶状体和/或巨角膜,伴有晶状体异位以及伴有或不伴有继发性青光眼
LTBP2,1-BP INS,5446C
Kumar 等人在来自印度近亲家庭的 3 名患有小球形晶状体和晶状体脱位的兄弟中(MSPKA; 251750)(2010) 鉴定了 LTBP2 基因外显子 36 中 1 bp 插入(5446insC) 的纯合性,预计通过用 27 个新氨基酸替换最后 6 个氨基酸来延长 LTBP2 蛋白。
.0006 青光眼 3,原发性先天性 D
LTBP2,1-BP DEL,1415C
在一个患有原发性先天性青光眼(GLC3D; 613086) 的伊朗近亲家庭中,Narooie-Nejad 等人(2009) 在 LTBP2 基因的外显子 7 中发现了纯合 1-bp 缺失(1415delC),导致移码和过早终止。在 400 名对照个体中未发现该缺失。
.0007 青光眼 3,原发性先天性 D
LTBP2,1-BP DEL,5376C
在一个患有原发性先天性青光眼(GLC3D; 613086) 的伊朗近亲家庭中,Narooie-Nejad 等人(2009) 在 LTBP2 基因的外显子 36 中发现了纯合 1-bp 缺失(5376delC),导致该蛋白的 C 末端添加了 28 个氨基酸。在 400 名对照个体中未发现该缺失。
.0008 小球晶状体和/或巨角膜,伴有晶状体异位以及伴有或不伴有继发性青光眼
LTBP2,1-BP DUP,1796C
Desir 等人发现,来自摩洛哥近亲家庭的一名兄弟和 2 名姐妹患有小球晶状体、巨角膜、晶状体脱位和继发性青光眼(MSPKA; 251750)(2010) 鉴定了 LTBP2 基因外显子 9 中 1 bp 重复(1796dupC) 的纯合性,导致移码,预计会导致提前终止密码子(Val600GlyfsTer4)。他们未受影响的父母是杂合突变,而在 100 名摩洛哥对照者中未发现这种突变。对患者和对照成纤维细胞的 mRNA 分析显示结果与无义介导的 mRNA 衰减一致。最大的同胞是一名 14 岁男孩,表现出一些马方样特征(参见马方综合征,154700),包括臂展大于身高、上下半身比例下降和高拱形上颚。
.0009 小球晶状体和/或巨角膜,伴有晶状体异位以及伴有或不伴有继发性青光眼
LTBP2,1-BP DEL,1012T
Khan 等人在来自沙特阿拉伯近亲家庭的 2 名表兄弟姐妹中,年龄分别为 2 岁和 14 ,患有巨角膜、晶状体脱位和继发性青光眼(MSPKA; 251750)(2011) 鉴定了 LTBP2 基因外显子 4 中 1 bp 缺失(1012delT) 的纯合性,导致移码,预计会导致提前终止密码子(Ser338ProfsTer2)。他们未受影响的父母都是突变杂合子。年长的男孩又高又瘦,上颚相对较高,但没有其他特征表明马凡综合征(154700)。
.0010 小球晶状体和/或巨角膜,伴有晶状体异位以及伴有或不伴有继发性青光眼
LTBP2、GLN1619TER
Khan 等人在来自沙特阿拉伯近亲家庭的 2 名患有小球晶状体、巨角膜、晶状体脱位和继发性青光眼的兄弟中(MSPKA; 251750)(2011) 鉴定了 LTBP2 基因外显子 33 中 4855C-T 转换的纯合性,导致 gln1619 到 ter(Q1619X) 的取代。他们未受影响的父母是突变杂合子。
.0011 小球晶状体和/或巨角膜,伴有晶状体异位以及伴有或不伴有继发性青光眼
LTBP2、CYS1438TYR
Khan 等人发现,沙特阿拉伯的一个近亲兄弟有 2 名患有巨角膜、晶状体脱位和继发性青光眼(MSPKA; 251750),其中 1 名还患有小球形晶状体眼(2011) 鉴定了 LTBP2 基因外显子 29 中 4313G-A 转变的纯合性,导致保守残基处的 cys1438 至 tyr(C1438Y) 取代。他们受影响的父亲和受影响的姑妈也是该突变的纯合子,这种突变在男孩的基因中发现了杂合性。未受影响的母亲,但在 100 个种族匹配的对照中不存在。
.0012 韦尔-马切萨尼综合征 3(1 个家族)
LTBP2、VAL1177MET
Haji-Seyed-Javadi 等人在患有 Weill-Marchesani 综合征(WMS3; 614819) 的伊朗大近亲家庭中受影响的兄弟姐妹及其受影响的表弟中(2012) 鉴定了 LTBP2 基因外显子 24 中 3529G-A 转变的纯合性,导致第九个钙结合表皮的共有钙结合序列中高度保守的残基处出现 val1177-to-met(V1177M) 取代生长因子(131530) 样基序。该突变也以纯合性形式存在于另外 3 名受影响的亲属中,他们表现出威尔-马切萨尼综合征的一些特征,但没有眼部异常。未受影响的家庭成员对于野生型 LTBP2 要么是杂合子,要么是纯合子,并且在 400 个种族匹配的对照中未发现该突变。对先证者皮肤成纤维细胞的细胞外基质(ECM)进行组织学检查,发现与对照组相比,弹性纤维出现聚集和破碎,电子显微照片显示患者皮肤中的 ECM 明显破坏,弹性纤维显着减少。丰富的胶原纤维和患者相邻纤维之间的空间增加。哈吉-赛义德-贾瓦迪等人(2012) 得出结论,V1177M 突变会破坏微纤维并导致 ECM 子结构发生变化。