信号蛋白 5A; SEMA5A

信号蛋白F; SEMAF;SEMF

HGNC 批准的基因符号:SEMA5A

细胞遗传学位置:5p15.31 基因组坐标(GRCh38):5:9,035,033-9,546,075(来自 NCBI)

▼ 说明

信号蛋白家族的成员,例如 SEMA5A,参与神经发育过程中的轴突引导(Adams 等,1996)。

▼ 克隆与表达

亚当斯等人(1996) 克隆了小鼠 Sema5a,他们将其命名为 Semf。推导的 1,077 个氨基酸的蛋白质包含一个 N 端信号序列,随后是一个信号蛋白结构域、7 个血小板反应蛋白 1 型重复序列(参见 188060)、一个推定的跨膜结构域和一个短胞质尾。它还具有 13 个保守的半胱氨酸和一个保守的 N-糖基化位点。对整个小鼠胚胎的 Northern 印迹分析在胚胎第 10 天检测到 2 个 Semf 转录本,并且它们的表达在出生时下降。 Semf、Semg(SEMA5B; 609298)、Semd(SEMA3A; 603961) 和 Seme(SEMA3C; 602645) 在早期小鼠胚胎的特定区域中表达,它们的表达划分了发育中体节或未分化神经上皮的不同区室。在成年动物中,在肌肉、心脏、肺和脾脏中检测到最高的 Semf 表达。

西蒙斯等人(1997) 在 YAC 中识别出部分 SEMAF 序列,覆盖 5 号染色体上的 cri-du-chat(123450) 关键区域。通过胎盘 RNA 的 5-prime RACE,Simmons 等人(1998) 克隆全长 SEMAF。推导的 1,074 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 120 kD。小鼠和人类 SEMAF 蛋白具有相同的结构域,并且具有 93% 的氨基酸同一性。人SEMAF的Sema结构域覆盖484个氨基酸,7个1型血小板反应蛋白样重复覆盖约400个氨基酸,胞质尾部长81个氨基酸。 Northern 印迹分析在所有检查的组织中检测到 9.6 和 15 kb 的转录本。最高表达是在成人结肠、心脏和肾脏中。在胎儿脑、肺和肾中检测到弱表达。

▼ 基因功能

坎特等人(2004) 发现大鼠 Sema5a 充当双功能引导信号,对反屈束(FR) 轴突的发育产生吸引和抑制作用,反屈束是一种与边缘功能相关的间脑纤维束。 Sema5a 的血小板反应蛋白重复序列​​与硫酸软骨素蛋白聚糖(CSPG) 和硫酸乙酰肝素蛋白聚糖(HSPG) 的糖胺聚糖部分发生物理相互作用。当与 FR 轴突的 HSPG 结合时,Sema5a 充当有吸引力的指导线索,而当与间脑前体 2 的 CSPG 结合时,Sema5a 充当抑制性指导线索。坎特等人(2004) 得出结论,神经元对 SEMA5A 的反应取决于结合的蛋白聚糖和生物环境。

阿蒂贾尼等人(2004) 表明哺乳动物丛蛋白 B3(PLXNB3; 300214) 是一种高亲和力 Sema5a 受体。 Plxnb3 被 Sema5a 激活,并且 Sema5a-Plxnb3 复合物通过肝细胞生长因子(142409) 受体 Met(164860) 触发细胞内信号传导。

韦斯等人(2009) 证明自闭症患者大脑中 SEMA5A 的表达减少。

▼ 基因结构

西蒙斯等人(1998)确定SEMA5A基因包含10个外显子,跨度超过200 kb。

▼ 测绘

由于它包含在覆盖 cri-du-chat 关键区域的 YAC 重叠群中,Simmons 等人(1998) 将 SEMA5A 基因定位到染色体 5p15.2。他们确定 SEMAF 基因覆盖了至少 10% 的 cri-du-chat 关键区域。

通过回交分析,西蒙斯等人(1998) 将小鼠 Sema5a 基因定位到 15 号染色体。

▼ 分子遗传学

有关 SEMA5A 基因变异与自闭症之间可能关联的讨论,请参阅 209850。