细胞质聚腺苷酸同源基因样; CPHXL
细胞质聚腺苷酸同源基因 1; CPHX1
HGNC 批准的基因符号:CPHXL
细胞遗传学位置:16q23.1 基因组坐标(GRCh38):16:75,714,131-75,726,490(来自 NCBI)
▼ 说明
CPHXL 是转录因子配对(PRD) 样同源框基因家族的成员。 CPHXL 在早期胚胎中表达,被认为在胚胎基因组激活和植入前胚胎发育的调节中发挥作用(Tohonen 等人,2015 年和 Madissoon 等人,2016 年)。
▼ 克隆与表达
Tohonen 等人对 2 至 3 天大的人类胚胎的卵母细胞、受精卵和卵裂球进行单细胞 RNA 测序(2015) 鉴定了在植入前发育过程中从卵母细胞到 4 细胞阶段以及从 4 细胞阶段到 8 细胞阶段的转变过程中表达的基因。其中包括 PRD 样同源基因基因 CPHX1(CPHXL)、DUXA(611168)、DUXB(618698)、ARGFX(611164)、DPRX(611165)、LEUTX(618701) 和 CPHX2。
麦迪逊等人(2016) 在早期 8 细胞阶段胚胎中发现的 9 个人类 PRD 样同源基因结构域基因的克隆剪接变体:ARGFX、CPHX1、CPHX2、DPRX、DUXA、DUXB、NOBOX(610934)、TPRX1(611166) 和 TPRX2(TPRX2P) )。 PRD 样同源基因基因中的同源结构域由大约 60 个氨基酸组成,折叠成 N 末端臂和 3 个 α 螺旋。 FANTOM5 数据库,表明基因在发育后期可能被沉默。
▼ 基因功能
Madissoon 等人在胚胎干细胞(ESC) 中过度表达 9 个 PRD 样同源基因基因(2016)证实这些基因主要是转录激活子(CPHX1、CPHX2、ARGFX)或阻遏子(DPRX、DUXA、TPRX2),并且具有在人类植入前发育过程中被激活的不同靶基因。麦迪逊等人(2016) 发现大多数 PRD 样同源基因基因调控的基因转录起始位点上游的 36 bp 基序富集。
▼ 测绘
Leidenroth 和 Hewitt(2010) 指出,人类 CPHXL 是染色体 16q23.1 上的主要锚定基因,用于识别跨物种的同线性区域。
麦迪逊等人(2016) 报道 CPHX1、CPHX2 和 DUXB 基因聚集在染色体 16q23.1 上的 68 kb 区域内。