核糖体 RNA 加工 1B; RRP1B

核糖体 RNA 加工蛋白 1，酿酒酵母，同源物，B
KIAA0179 基因； KIAA0179
NNP1-样； NNP1L

HGNC 批准的基因符号：RRP1B

细胞遗传学位置：21q22.3 基因组坐标（GRCh38）：21:43,659,560-43,696,079（来自 NCBI）

▼ 说明

RRP1B 是一种核仁蛋白，预计参与 60S 核糖体 RNA 加工的后续步骤（Chamousset 等，2010）。

▼ 克隆与表达

Nagase 等人通过对从大小分级的人未成熟骨髓细胞系 cDNA 文库中获得的克隆进行测序，（1996） 克隆了 RRP1B，他们将其称为 KIAA0179。推导的蛋白质含有762个氨基酸。 Northern印迹分析检测到所有检查的组织和细胞系中的表达。

Jansen 等人通过在 EST 数据库中搜索 NNP1（610653） 的同源物（1997） 鉴定出 KIAA0179，他们将其称为 NNP1L。推导的NNP1L蛋白含有762个氨基酸。 NNP1 和 NNP1L 的 N 末端区域具有 80% 的相似性，包括预测的核定位信号的存在，但蛋白质的 C 末端不同。

查穆塞特等人（2010） 指出推导的 758 个氨基酸的 RRP1B 蛋白具有 N 端 NOP52（RRP1; 610653） 同源结构域和推定的 C 端蛋白磷酸酶-1（PP1; 参见 176875） 结合 RVxF 基序。 U2OS 或 HeLa 细胞的免疫荧光显微镜显示，RRP1B 主要与 B23（NPM1；164040） 和 pescadillo（605819） 共定位，它们是核仁颗粒成分的标记。 RRP1B 和其他颗粒成分蛋白随着有丝分裂中核仁的分解而扩散，并在末期晚期在核仁前体中重新积累。蔗糖梯度分级证实了 RRP1B 与核前 60S 的特异性关联。蛋白质印迹分析检测到 RRP1B 的表观分子量约为 84 kD。

通过免疫组织化学分析，Paik 等人（2010） 发现 RRP1B 与转录因子 E2F1（189971） 共定位于几种人类细胞系的核仁和点状核质灶中。

▼ 基因功能

Chamousset 等人使用基于定量蛋白质组学的方法和免疫沉淀分析（2010） 表明 RRP1B 与 HeLa 和 U2OS 细胞核仁中的 PP1-β（PPP1CB; 600590） 和 PP1-γ（PPP1CC; 176914） 相互作用。 RRP1B 不与定位于细胞质的 PP1-α（PPP1CA; 176875） 相互作用。突变分析表明，RRP1B 的 RVxF 基序是 PP1 结合所必需的。用 RNase 处理 U2OS 或 HeLa 细胞会破坏 RRP1B 与核仁的关联。 RRP1B 的敲除不会改变细胞生长或增殖，但它增加了 Northern 印迹分析检测到的较大 RNA 种类的数量。免疫共沉淀分析显示，RRP1B 与 60S 核糖体亚基加工复合物（包括 NOL1（164031） 和 NOP52）相互作用。

Paik 等人使用半定量 RT-PCR（2010） 发现，E2F1 的过度表达（而非其他 E2F 家族成员）在几种人类细胞系中上调了 RRP1B 的表达。相反，E2F1 的敲低会减少 RRP1B 的转录。 RRP1B 表达在人类细胞系和原代包皮成纤维细胞的 G1/S 转变时达到峰值，与 E2F1 表达一致。截短分析与报告基因检测相结合表明，E2F1 仅在最近的 E2F 位点结合并激活 RRP1B 启动子。将人类细胞系暴露于几种 DNA 损伤剂后，RRP1B 表达也会升高。 RRP1B 的敲低减少了基因毒剂或 E2F1 过表达诱导的细胞凋亡，但对 E2F1 调节的细胞增殖没有影响。 RRP1B 的敲低会降低 E2F1 依赖性凋亡基因子集的表达，包括 半胱天冬酶-3（CASP3; 600636）、半胱天冬酶-7（CASP7; 601761） 和 APAF1（602233）。免疫共沉淀、蛋白质下拉和染色质免疫沉淀测定表明，RRP1B 对这些基因的调节是通过 RRP1B 与 E2F1 之间的直接相互作用而发生的。

▼ 基因结构

詹森等人（1997）确定RRP1B基因含有14个外显子。

▼ 测绘

Nagase 等人通过对人-啮齿动物杂交细胞系进行 PCR 检测。 Jansen 等（1996） 将 RRP1B 基因定位到 21 号染色体（1997） 通过基因组序列分析，将 RRP1B 基因定位到染色体 21q22.3，靠近胱抑素 B 基因（CSTB；601145）。 RRP1B 基因也位于 RRP1 基因附近 75 kb 处。