RET 手指蛋白样 3; RFPL3
RFP 类似 3
HGNC 批准的基因符号:RFPL3
细胞遗传学位置:22q12.3 基因组坐标(GRCh38):22:32,354,885-32,361,161(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
通过分析 22q12-q13 的粘粒基因组克隆和 PCR,Seroussi 等人(1999) 获得了编码 RET 指蛋白(RFP; 602165)-like-1(RFPL1; 605968)、RFPL2(605969) 和 RFPL3 以及反义 RFPL1S(605972) 和 RFPL3S(605971) 的 cDNA。推导的 288 个氨基酸的 RFPL3 蛋白与 RFPL1 和 RFPL2 具有 91% 至 94% 的一致性。 RFPL3 的外显子 1 编码假定的 RING 样基序,外显子 2 编码 B30-2 结构域。塞鲁西等人(1999) 提出 RFPL3 源于染色体内复制。
▼ 基因结构
RFPL3 基因包含 2 个外显子(Seroussi 等,1999)。
▼ 基因功能
Bonnefont 等人使用微阵列表达分析(2008) 发现人类 RFPL1、RFPL2 和 RFPL3 基因被皮质生成转录因子 PAX6 反式激活(607108)。实时 PCR 表明 RFPL1,2,3 在胚胎干细胞源性神经发生和胎儿新皮质中高表达。
▼ 测绘
RFPL3 基因与 RFPL1 和 RFPL2 位于染色体 22q12.2-q13.3 上的簇中(Seroussi 等人,1999;Bonnefont 等人,2008)。
▼ 进化
博内丰等人(2008) 观察到,在分化的人类胚胎干细胞和发育中的人类新皮质中,神经发生开始时出现高 RFPL1,2,3 转录水平,而独特的小鼠 RFPL 基因在肝脏中表达,但在神经组织中不表达。对RFPL基因家族进化史的研究表明,RFPL1,2,3基因祖先是在Euarchonta-Glires分裂后出现的。随后的重复事件导致大约 3400 万年前卡他类动物中存在多个 RFPL1,2,3 基因,导致类人猿谱系中基因拷贝数的增加。在卡他尼中,RFPL1,2,3 表达谱向肝脏上方的新皮质和小脑分化。重要的是,与小脑、黑猩猩和猕猴的新皮质相比,人类的皮质 RFPL1,2,3 表达显着增加。还观察到 RFPL 蛋白进化的加速,在 RFPL1、2、3 簇和 2 个新功能化事件中出现正选择迹象(在所有 RFPL 中获得特定的 RFPL 定义基序,在卡他尼虫中获得 N 端 29 个氨基酸序列) RFPL1,2,3)。因此,博内丰等人(2008) 提出 RFPL1,2,3 基因的最近出现和增殖有助于灵长类动物新皮质大小和/或组织的变化。