RHO 相关 BTB 结构域蛋白 3; RHOBTB3

KIAA0878

HGNC 批准的基因符号:RHOBTB3

细胞遗传学位置:5q15 基因组坐标(GRCh38):5:95,717,624-95,796,361(来自 NCBI)

▼ 说明

Rho GTPases RHOBTB 亚家族的成员在进化上是保守的。它们的特点是模块化组织,由一个 GTPase 结构域、一个富含脯氨酸的区域、串联的 2 个 BTB(广泛复合物、tramtrack 和 bric-a-brac)结构域和一个保守的 C 端区域组成。 BTB 结构域,也称为 POZ(痘病毒和锌指)结构域,参与蛋白质-蛋白质相互作用(Ramos 等人总结,2002)。

▼ 克隆与表达

Nagase 等人通过对大小分级大脑 cDNA 文库中的克隆进行随机测序(1998)获得了编码RHOBTB3的cDNA,他们将其称为KIAA0878。推导的蛋白质含有611个氨基酸。 RT-PCR 和 ELISA 显示在卵巢中高表达,在心脏、脑、肝脏、胰腺和睾丸中中等表达,在所有其他测试组织中表达较弱。

通过搜索 EST 数据库,Ramos 等人(2002) 获得了编码 RHOBTB1(607351)、RHOBTB2(607352) 和 RHOBTB3 的全长 cDNA。 RHOBTB3 包含 RHOBTB 蛋白的所有特征结构域。 C 端结构域由 4 个连续 α 螺旋中的约 80 个氨基酸组成,最后三分之一具有高含量的带电残基。 RHOBTB3 以 RHOBTB1 和 RHOBTB2 中未发现的异戊二烯化基序结尾。 RHOBTB3 与小鼠 Rhobtb3 具有 88% 的核苷酸同一性。 Northern 点印迹分析显示 RHOBTB3 普遍表达,在胎盘、睾丸、胰腺、肾上腺和唾液腺以及神经和心脏组织中表达水平最高。 RHOBTB3 也在胎儿组织中表达,特别是脑、心脏和肺。小鼠组织的 Northern 印迹分析显示其表达无处不在,在大脑、心脏和子宫中表达水平最高。

▼ 基因功能

埃斯皮诺萨等人(2009) 发现 RHOBTB3 直接与小 GTP 酶 RAB9(300284) 结合,并与 RAB9 一起将 M6PR 蛋白(154540) 从内体回收到反高尔基体网络。 RHOBTB3 结合并水解 ATP 而不是 GTP,并且与 RAB9 的结合打开了自我抑制的 RHOBTB3 蛋白,以允许最大程度的 ATP 水解。由于 RHOBTB3 与膜上的货物选择蛋白 TIP47(M6PRBP1;602702)相互作用,Espinosa 等人(2009) 提出 RHOBTB3 可以从囊泡中去除 TIP47,以允许它们在高尔基体上有效对接和融合。

▼ 基因结构

拉莫斯等人(2002) 确定 RHOBTB3 基因包含 12 个外显子,跨度约为 66 kb。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,拉莫斯等人(2002) 将 RHOBTB3 基因定位到 PCSK1 基因(162150) 上游的染色体 5q14.3。