泛素D; UBD

DIUBIQUITIN
FAT10

HGNC 批准的基因符号:UBD

细胞遗传学位置:6p22.1 基因组坐标(GRCh38):6:29,555,515-29,559,732(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Fan 等人利用 6 号染色体上含有 HLA-F 基因座(143110) 区域的 YAC 的选择性 cDNA 杂交,然后进行 Southern 和 Northern 印迹分析(1996) 分离出一种 cDNA,他们将其称为 1F12,编码类似于双泛素的蛋白质。仅在 Epstein-Barr 病毒转化的 B 细胞系中检测到 1.1-kb 转录物。

通过树突状细胞(DC) 文库的消减杂交和 EST 数据库搜索,Bates 等人(1997)获得了编码双泛素的全长cDNA。预测的 165 个氨基酸蛋白有 2 个泛素样结构域,每个结构域有 2 个半胱氨酸。 Southern印迹分析表明该cDNA代表单拷贝基因。 RT-PCR 分析检测到 DC、B 细胞和肾癌细胞系中的表达,但在 T 细胞、骨髓单核细胞或成纤维细胞系中未检测到表达。新鲜分离的细胞中的表达仅限于 DC 和 B 细胞。原位杂交分析显示,双泛素在分离的生发中心细胞、隐窝上皮细胞和外上皮细胞中清晰表达,但在基底细胞中没有表达。

▼ 基因功能

邱等人(2007) 表明 E1L2(UBE1L2; 611361) 可以通过在 E1L2 的活性位点半胱氨酸和 FAT10 的 C 端二甘氨酸基序之间形成硫酯来激活 FAT10。内源性 E1L2 和 FAT10 也在 TNF-α(TNF; 191160) 和干扰素-γ(IFNG; 147570) 刺激的人类细胞中形成硫酯。通过 RNA 干扰敲低 E1L2 显着减少了细胞中 FAT10 的结合。

通过蛋白质印迹分析,Buchsbaum 等人(2012) 表明,人类 FAT10 需要泛素化才能被蛋白酶体降解,而缺乏 17 个赖氨酸的 FAT10 由于降解及其以不溶形式积累而消失。 FAT10 在表达不可聚合泛素的细胞和含有 E1L2 耐热突变的细胞中稳定。尽管 FAT10 可以作为稳定蛋白质的降解信号,但还需要进一步的多泛素化。为了响应细胞凋亡的诱导,FAT10 迅速泛素化并降解。布克斯鲍姆等人(2012) 提出 FAT10 在促生存途径中发挥作用。

张等人(2016) 观察到人 A549 呼吸道上皮细胞或小鼠感染 H5N1 禽流感病毒后 FAT10 上调。进一步分析表明,FAT10 增加了 H5N1 病毒的复制并降低了受感染细胞的活力。 H5N1 感染细胞的 RNA 上调 FAT10,该过程由 RIGI(DDX58;609631)-NFKB(参见 164011)途径介导。在 H5N1 感染期间,A549 细胞中 FAT10 的敲低会上调 I 型 IFN(例如 IFNB1;147640)表达并增强 STAT1(600555) 磷酸化。张等人(2016)提出FAT10通过抑制I型IFN来促进H5N1病毒复制。

▼ 测绘

通过 YAC 分析,Fan 等人(1996) 将双泛素基因定位到 6 号染色体的 HLA-F 区域。