人滑膜肉瘤
人滑膜肉瘤(300813)包含复发性特异的染色体易位t(X; 18)(p11.2; q11.2)。通过用跨越X染色体断点的YAC筛选滑膜肉瘤cDNA文库,Clark等人(1994)确定了一个杂种转录本,其中包含对应到18号染色体的5个主序列(由它们指定的SYT;参见SS18; 600192)和对应到X染色体的3个主序列(由它们指定的SSX)。SYT探针在13个滑膜肉瘤中的10个中检测到基因组重排。cDNA克隆的测序表明,正常的SYT基因编码富含谷氨酰胺,脯氨酸和甘氨酸的蛋白质,而在滑膜肉瘤中,SYT基因的重排导致形成SYT-SSX融合蛋白。
细胞遗传学位置:Xp11.23
基因座标(GRCh38):X:48,255,391-48,267,443
Location | Phenotype | Phenotype MIM number |
Inheritance | Phenotype mapping key |
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Xp11.23 | ?Sarcoma, synovial | 300813 | 3 |
船员等(1995)证明,在人体滑膜肉瘤中发现的t(X; 18)(p11.2; q11.2)导致18号染色体SS18基因(SYT)与2个不同基因SSX1或SSX2融合(300192),在Xp11.2。SSX1和SSX2基因编码富含电荷氨基酸的188个氨基酸的紧密相关蛋白(81%一致性)。每个SSX蛋白的N端部分均与Kruppel相关框(KRAB)同源,后者是以前仅在Kruppel型锌指蛋白中发现的转录阻遏域,例如锌指蛋白117(ZNF117; 194624)和ZNF83(194558)。PCR分析表明,在检查的32个滑膜肉瘤中有29个存在SYT-SSX1或SYT-SSX2融合转录本,这表明PCR检测这些杂种转录本可能是一种有用的诊断方法。序列分析证明了融合转录本中的进一步异质性,形成了2个不同的SYT-SSX1融合连接和2个不同的SYT-SSX2融合连接。SYT-SSX1和SYT-SSX2杂种转录本均编码融合蛋白,其中正常SYT蛋白的C端8个氨基酸已被SSX基因编码的78个氨基酸取代。存在于这两种融合产物中的SSX1和SSX2蛋白序列共有78个氨基酸中的66个。
▼ 基因功能
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滑膜肉瘤的SYT-SSX1形式与SYT-SSX2形式相比,预后明显较差(Kawai等,1998;Ladanyi等,2002)。这表明SYT-SSX融合基因可能影响与肿瘤生长和进展有关的分子机制,并且SYT-SSX1对这些机制的影响要比SYT-SSX2大。谢等(2002)对来自滑膜肉瘤的74份新鲜的融合变体型肿瘤样品进行了蛋白质印迹分析,发现SYT-SSX1与cyclin A1(CCNA1; 604036)和cyclin D1(CCND1; 168461)的高表达之间存在显着相关性。); P = 0.003和P = 0.025。数据表明,SYT-SSX可能影响细胞周期机制,而SYT-SSX1变体的更具攻击性的表型是由于肿瘤细胞的加速增殖所致。
▼ 测绘
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克拉克等(1994)在滑膜肉瘤相关易位t(X; 18)(p11.2; q11.2)的染色体Xp11.2断点处鉴定了SSX1基因。
钱德等(1995)发现至少5个拷贝的SSX1基因座聚集在X染色体上的一个区域中,该区域还含有几个类似OAT的序列(311240)。