DLC1 RHO GTP 酶激活蛋白; DLC1
RHO GTP 酶激活蛋白 7; ARHGAP7
HGNC 批准的基因符号:DLC1
细胞遗传学位置:8p22 基因组坐标(GRCh38):8:13,083,361-13,604,620(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
为了鉴定与肝细胞癌(HCC;114550)有关的基因,Yuan 等人(1998) 将代表性差异分析(RDA)(一种基于 PCR 的消减杂交技术)应用于来自同一患者的原发性 HCC 和邻近非癌组织的 DNA。他们将新基因 DLC1 鉴定为在原发肿瘤中被删除的片段。 16 个原发性 HCC 中的 7 个和 11 个 HCC 细胞系中的 10 个显示 DLC1 基因杂合性丢失(LOH)。 Northern 印迹分析在所有检查的人体组织(包括肝脏)中检测到主要的 7.5 kb 和次要的 4.5 kb DLC1 转录物,但在 14 个 HCC 细胞系中的 4 个中未发现 DLC1 表达。作者分离出全长 DLC1 cDNA,编码推导的 1,091 个氨基酸的蛋白质。 DLC1 基因与大鼠 p122 RhoGap 基因具有高度序列相似性。
▼ 基因功能
钱等人(2007) 表明 DLC1 与人张力蛋白(TNS; 600076) 及其鸡同源物结合。结合需要张力蛋白 C 末端的 SRC(190090) 同源 2(SH2) 和磷酸酪氨酸结合(PTB) 结构域以及不同的 DLC1 序列。 SH2 结合依赖于 DLC1 中的 tyr442,但不依赖于磷酸酪氨酸。 DLC1 与其他蛋白质竞争与张力蛋白 C 末端的结合,包括 β-3 整联蛋白(ITGB3;173470)与 PTB 结构域的结合。 DLC1 中 tyr442 突变为 phe(Y442F),导致该蛋白无法结合张力蛋白 SH2 结构域或全长张力蛋白。与野生型 DLC1 定位于粘着斑相反,Y442F 蛋白呈弥漫性细胞质,但它保留了降低细胞内 Rho(RHOA; 165390)-GTP 水平的能力。 Y442F 突变体表现出明显降低的生物活性,RhoGAP 缺陷突变体也是如此。
使用 RNA 干扰,Xue 等人(2008) 表明,在体外,Dlc1 表达减少对过度表达 Myc(190080) 和缺乏 p53(TP53; 191170) 的小鼠肝脏祖细胞的集落形成能力几乎没有影响。相比之下,这些细胞中的 Dlc1 敲低会加速移植到受体小鼠肝脏后的肿瘤发生。将 Dlc1 重新引入表达致癌 Ras(HRAS; 190020) 突变的小鼠肝癌细胞系和低内源性 Dlc1 水平可减少移植后的肿瘤负荷。薛等人(2008) 得出结论,DLC1 是一种肿瘤抑制基因。
▼ 测绘
作者:FISH,Yuan 等人(1998) 将 DLC1 基因对应到 8p22-p21.3,这是实体瘤中经常缺失的区域。作者认为 DLC1 是人类肝癌、前列腺癌、肺癌、结直肠癌和乳腺癌的候选抑癌基因。
袁等人(1999) 将小鼠同源物 Arhgap7 对应到染色体 8A4-B2,该区域显示与人类染色体 8p22-p21 同线性的同源性。
▼ 分子遗传学
威尔逊等人(2000)描述了 DLC1 基因的结构,并使用 SSCP 分析在 126 个结直肠和 33 个卵巢原发性肿瘤和细胞系中寻找序列变异。在原发性结直肠肿瘤中发现了 1 个外显子错义突变和 3 个内含子插入/缺失,以及种系 DNA 中存在许多多态性。外显子错义突变的罕见性以及不存在蛋白质截短突变表明 DLC1 并不是结直肠肿瘤和卵巢肿瘤中 8p 上经常观察到的 LOH 的靶标。基因结构的描绘允许对其他肿瘤类型中的 DLC1 进行突变分析,根据其位置和与 ARHGAP1(602732) 的同源性,DLC1 仍然是候选肿瘤抑制基因。
▼ 动物模型
薛等人(2008) 指出小鼠 Dlc1 敲除会导致胚胎死亡。
▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):
.0001 躯体结直肠癌
DLC1、THR522ALA
在显示微卫星不稳定性的原发性结直肠癌(114500) 中,Wilson 等人(2000) 检测到 DLC1 基因的外显子 4 发生转变,导致 thr522 氨基酸替换为 ala。