MAT2A反义辐射诱导循环长非编码RNA的启动子; PARTICL

长非编码 RNA 颗粒
lncRNA颗粒
PARTICLE

HGNC 批准的基因符号：PARTICL

细胞遗传学位置：2p11.2 基因组坐标（GRCh38）：2:85,537,467-85,538,886（来自 NCBI）

▼ 说明

长非编码 RNA（lncRNA） 与 PARTICL 一样，是超过 200 个核苷酸的转录物，缺乏重要的 ORF，主要参与基因调控（OLeary et al., 2015）。

▼ 克隆与表达

O'Leary 等人使用微阵列分析（2015） 发现 PARTICL（他们称之为 PARTICLE）是人类 T47D 乳腺癌细胞在低剂量伽马射线照射后上调的 4 个 lncRNA 之一。 1,432 个核苷酸的 PARTICLE 转录本包含一条 Poly（A） 尾。 EST 数据库分析显示 PARTICLE 在所有检查的正常人体组织中表达，其中甲状腺水平最高，大脑水平最低。 MDA-MB-361人乳腺癌细胞的原位杂交显示，PARTICLE具有点状胞质分布。

▼ 基因功能

O'Leary 等人使用 Northern 印迹分析和原位杂交（2015） 发现，对几种人类细胞系进行低剂量（0.25 Gy） 伽马射线照射会导致 MAT2A（601468） 表达早期增加，从而催化甲基供体 S-腺苷甲硫氨酸（SAM） 的形成，随后表达增加粒子转录本。人类乳腺癌细胞的低剂量照射也导致 MAT2A、PARTICLE 和 SAM 分泌到培养基中。较高剂量的辐射（2.50 Gy）在所有测定中的效果较弱。正常供体全血的体外辐射以及头颈癌患者的放射治疗导致循环粒子和 MAT2A RNA 的类似增加。通过短发夹 RNA 敲低 PARTICLE 可增强 MAT2A mRNA 和蛋白质的表达，增加 MAT2A 报告基因活性，并在低剂量照射后增加细胞内和细胞外 SAM 浓度。奥利里等人（2015） 确定 PARTICLE 基因与 MAT2A 基因启动子区域的 CpG 岛部分重叠。低剂量照射诱导该 CpG 岛甲基化，并且这种甲基化通过 PARTICLE 的敲低而消除。粒子形成RNA-DNA三螺旋，MAT2A基因的启动子区域位于CpG岛上游456bp处。染色质免疫沉淀分析和 EMSA 显示 PARTICLE 与基因沉默因子相互作用，包括赖氨酸甲基转移酶 G9A（EHMT2; 604599） 和转录因子 MYB（189990），并且它直接与多梳阻遏复合物（PRC） 亚基 SUZ12 相互作用。 606245）。奥利里等人（2015） 得出结论，PARTICLE 将 G9A、MYB 和 SUZ12 招募到 MAT2A 启动子以实现基因沉默。

▼ 基因结构

奥利里等人（2015） 确定 PARTCL 基因是无内含子的。

▼ 测绘

通过基因组序列分析，O'Leary 等人（2015） 将 PARTICL 基因对应到染色体 2p11.2，它与相对链上 MAT2A 基因的启动子区域重叠。