长基因间非编码 RNA 672; LINC00672

lincRNA 672

HGNC 批准的基因符号:LASP1NB

细胞遗传学位置:17q12 基因组坐标(GRCh38):17:38,925,614-38,929,381(来自 NCBI)

▼ 说明

长基因间非编码 RNA(lincRNA),例如 LINC00672,是长度超过 200 个核苷酸、不编码蛋白质的 RNA 分子。它们参与广泛的细胞生物学过程,包括表观遗传特征和基因表达的调节、干细胞多能性的维持和胚胎干细胞分化(Li等人的总结,2017)。

▼ 克隆与表达

李等人(2017) 基于 LINC00672 在子宫内膜癌(EC;参见 608089) 样本中的表达低于来自 2 个中国人群的邻近非肿瘤组织,鉴定了 LINC00672。 2,365 bp LINC00672 转录物有一个 125 bp 区域,该区域在脊椎动物中高度保守。 HEC-1A 和 Ishikawa 人 EC 细胞系的分级显示,LINC00672 在染色质组分中富集。

▼ 基因结构

李等人(2017) 报道 LINC00672 基因包含 2 个外显子。 LINC00672 的启动子区域具有典型的 p53(TP53; 191170) 结合位点。

▼ 测绘

李等人(2017) 报道,LINC00672 基因定位于子宫内膜癌易感位点内染色体 17q12 的正向链。 LINC00672 基因与 LASP1 基因(602920) 相邻,并且这种方向在进化上是保守的。

▼ 基因功能

Li 等人使用荧光素酶测定(2017) 表明 LINC00672 启动子活性在 p53 抑制的 EC 细胞中降低。染色质免疫沉淀分析显示 p53、RNA 聚合酶 II(参见 180660)和 p300(EP300;602700)与 LINC00672 启动子直接结合。 HEC-1A 和 Ishikawa 细胞中的 LINC00672 过度表达导致细胞在细胞周期的 G2-M 期积累、增殖减少、集落形成和迁移能力降低。相比之下,LINC00672 的敲低在所有测定中都产生相反的效果。 RNA Pull-down 实验揭示了 LINC00672 与异质核核糖核蛋白 F(HNRNPF; 601037) 和 H(HNRNPH1; 601035) 的相互作用,并且这些相互作用是由 LINC00672 的保守区介导的。染色质免疫沉淀显示 LINC00672 的过表达导致 LASP1 启动子处 p53 和 hnRNP 的富集。 LINC00672 过表达还降低了化疗药物紫杉醇的 50% 抑制浓度(IC50),而 LINC00672 的敲低则具有相反的效果。李等人(2017) 得出结论,LINC00672 可以通过 p53 介导的基因抑制影响 LASP1 表达,从而影响 EC 恶性肿瘤和对紫杉醇的化疗敏感性。

▼ 动物模型

Li 等人使用小鼠 EC 异种移植物(2017) 表明,过表达 LINC00672 的细胞表现出生长抑制,而 LINC00672 敲低的细胞则促进生长。过表达LINC00672的异种移植物对紫杉醇表现出更高的敏感性,增殖更少,细胞凋亡更多,而LINC00672敲低的异种移植物对紫杉醇强烈不耐受。