HECT 结构域和 RCC1 样结构域 1; HERC1
P532
HGNC 批准的基因符号:HERC1
细胞遗传学位置:15q22.31 基因组坐标(GRCh38):15:63,608,618-63,833,948(来自 NCBI)
▼ 说明
HERC1 基因编码具有一个 HECT 结构域和 2 个 RCC1 样结构域(RLD) 的大蛋白,该蛋白充当 E3-泛素连接酶,靶向蛋白进行降解,并在细胞内膜转移中发挥假定的作用。 HECT 结构域与 TSC1(605284)-TSC2(191092) 复合物相互作用,并可能通过充当 TSC2 的泛素连接酶并降低其稳定性,从而在 mTOR(601231) 通路中发挥 HERC1 的调节作用。 RLD 结构域充当小蛋白(例如 ARF(103180) 和 Rab 家族 GTPases)的鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF),参与细胞内膜转移(Rosa 等人,1996 年和 Aggarwal 等人,2016 年)。
▼ 克隆与表达
Rosa 等人使用与 RCC1 显示显着同源性的 cDNA 片段来筛选人胎脑 cDNA 文库(1996) 分离出 HERC1 的全长 cDNA,编码推导的 4,861 个氨基酸的蛋白质。作者最初根据计算的分子量将蛋白质 p619 指定为 p619,但在勘误表中指出,该蛋白质的正确 M(r) 约为 532 kD(p532)。 HERC1 蛋白包含 N 端和 C 端 RLD 结构域、异三聚体 G 蛋白 β 亚基特征的 7 个 WD 结构域(被认为参与蛋白质-蛋白质相互作用)、3 个假定的 SH3 结合位点、7 个极性氨基酸区域、一个假定的亮氨酸拉链和一个 C 端 HECT 结构域。 Northern 印迹分析检测到 15 kb HERC1 转录本在所有受检的人类和小鼠组织中普遍表达,其中睾丸和大脑中的水平最高,肝脏中的水平最低。 HERC1 在所有测试的人类肿瘤细胞系中均过度表达,无论其发育起源如何。亚细胞定位研究表明 HERC1 位于细胞质和高尔基体中。
▼ 基因功能
罗莎等人(1996) 发现 HERC1 的 C 端 RLD 与肉豆蔻酰化 ARF(103180) 特异性相互作用,肉豆蔻酰化 ARF 是一种小型 GTP 结合蛋白,也位于高尔基体中。 N 端 RLD 刺激 ARF1 和 RAB 蛋白家族某些成员(包括 RAB3A(179490) 和 RAB5(179512))上的鸟嘌呤核苷酸交换。 Rosa 和 Barbacid(1997) 使用酵母 2-杂交系统发现 HERC1 的 C 末端 RLD 与网格蛋白重链相互作用(118955)。这种相互作用仅发生在细胞质中,并通过与热休克蛋白 HSP70 形成 ATP 依赖性三元复合物来介导(参见 140550)。 Rosa 和 Barbacid(1997) 认为 HERC1 参与膜转运过程。
通过对小鼠脑裂解物进行免疫复合物分析,Chong-Kopera 等人(2006) 通过 Herc1 的 C 末端区域(包含 E3 泛素连接酶结构域)将 Herc1 鉴定为 Tsc2(191092) 相互作用蛋白。 Herc1 与 Tsc2 相互作用并对 mTorc1(参见 MTOR,601231)通路产生负向调节。 Herc1 不与 Tsc1 结合(605284),但 Tsc1 有效地与 Herc1 竞争 Tsc2 结合。这些发现提供了 TSC1 通过抑制 TSC2 和 E3 泛素连接酶 HERC1 之间的相互作用来稳定 TSC2 的潜在生化机制。
▼ 测绘
作者:FISH,Cruz 等人(1999) 将 HERC1 基因定位到染色体 15q22。
▼ 分子遗传学
Ortega-Recalde 等人的 2 名同胞出生于哥伦比亚,父母无关,患有大头畸形、面容畸形和精神运动迟缓(MDFPMR; 617011)(2015) 鉴定了 HERC1 基因中的复合杂合突变(W875X, 605109.0001 和 G4520E, 605109.0002)。这些突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。没有进行变异的功能研究和患者细胞的研究。
Nguyen 等人是一名 18 岁男性,父母是摩洛哥近亲,患有 MDFPMR(2016) 鉴定了 HERC1 基因中的纯合截短突变(R3250X; 605109.0003)。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。患者成纤维细胞表现出突变转录本减少并且完全缺失该蛋白,表明该突变导致无义介导的 mRNA 衰减。与对照组相比,患者成纤维细胞的 TSC2(191092) 或 mTORC1(参见 MTOR,601231)均未显示变化; HERC2(605837)水平也没有变化。阮等人(2016) 假设由于 HERC1 丢失而导致的 mTOR 通路的改变可能是组织特异性的。
在 2 名同胞中,父母为印度近亲,患有 MDFPMR,Aggarwal 等人(2016) 鉴定了 HECT1 基因中的纯合剪接位点突变(605109.0004)。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。阿加瓦尔等人(2016) 表明,这些患者中发生的 HECT 结构域丢失可能具有致病意义,因为该结构域与 TSC2(191092) 相互作用,并通过泛素化和靶向降解降低其稳定性,这可能会破坏 mTOR 通路的调节。这种突变还可能破坏细胞内的转移。
两姐妹,由阿塞拜疆血亲父母所生,MDFPMR、Schwarz 等人(2020) 发现了 HERC1 基因中的纯合错义突变(R4691P; 605109.0005)。该突变通过全外显子组测序进行鉴定,并通过桑格测序进行确认。该突变位于 C 端 HECT 结构域,导致 Schwarz 等人(2020)假设它影响蛋白质折叠和与结合伙伴的相互作用。对其中一名同胞的成纤维细胞进行的测试显示,与对照组相比,HERC1 蛋白的表达有所增加。施瓦茨等人(2020) 观察到,与对照组相比,S6K1(608938) 磷酸化增强,LC3B-II:LCB-I 比率降低,表明患者成纤维细胞在营养饥饿下自噬减少。施瓦茨等人(2020) 的结论是,R4691P 突变具有功能获得效应,导致 mTORC1 活性增加。
▼ 动物模型
真下等人(2009)描述了一种小鼠突变体“tambaleante”;(tbl,在西班牙语中意为“令人震惊”),其特征是严重的共济失调、后肢姿势异常以及从 2 个月大开始与小脑浦肯野细胞进行性退化相关的震颤。与野生型小鼠相比,突变小鼠的生长和寿命也有所缩短。位置克隆鉴定出 Herc1 结构域中的纯合错义突变(G483E) 与该表型有关。该突变发生在 N 端 RLD1 结构域的高度保守残基处。突变组织显示突变蛋白增加、mTOR 活性降低以及小脑自噬增加。
Bachiller 等人通过对 tbl 小鼠运动功能的电生理分析(2015) 发现 Herc1 故障会在大约 30 天龄时产生运动缺陷,然后出现共济失调和小脑细胞损失。对骨骼肌的检查表明,与对照组相比,突变小鼠的神经肌肉接头存在形态和功能缺陷,包括较小的突触后区域和受损的突触小泡释放。这些变化早在两周大时就很明显。总体而言,研究结果表明 HERC1 对于神经肌肉接头的正常发育、维持和功能至关重要。
鲁伊斯等人(2016) 对纯合 tbl 突变小鼠中枢神经系统的各个区域进行了电子显微镜分析。自噬的特征,包括自噬体、溶酶体、线粒体改变和一些染色质改变,存在于小脑的浦肯野细胞、新皮质和海马锥体细胞以及脊髓运动神经元中。小脑的神经元损失更为严重。在中间神经元或神经胶质细胞中未发现自噬迹象。这些发现表明受影响的神经元是具有高度神经元活动的投射神经元,并且小脑以外的区域也可能受到影响。鲁伊斯等人(2016) 表明 Herc1 突变导致泛素蛋白酶体系统失调可能导致自噬活性增加。
▼ 等位基因变异体(5 个精选示例):
.0001 巨大头畸形、面部畸形和精神运动迟缓
HERC1、TRP875TER
Ortega-Recalde 等人的 2 名同胞出生于哥伦比亚,父母无关,患有大头畸形、面容畸形和精神运动迟缓(MDFPMR; 617011)(2015) 鉴定了 HERC1 基因中的复合杂合突变:c.2625G-A 转换(c.2625G-A,NM_003922.3),导致 trp875-to-ter(W875X) 取代,以及 c.13559G-一个转变,导致高度保守残基处的 gly4520-to-glu(G4520E;605109.0002)取代。这些突变是通过全外显子组测序发现并通过桑格测序确认的,并根据公共 SNP 数据库(包括 dbSNP(版本 129-137))进行筛选。这些突变随着家族中的疾病而分离。没有进行变异的功能研究和患者细胞的研究。
.0002 巨大头畸形、面部畸形和精神运动迟缓
HERC1、GLY4520GLU
讨论 HERC1 基因中的 c.13559G-A 转变(c.13559G-A,NM_003922.3),导致 gly4520-to-glu(G4520E) 取代,在 2 个同胞中以复合杂合状态发现大头畸形、畸形面容和精神运动迟缓(MDFPMR; 617011),作者:Ortega-Recalde 等人(2015),参见 617011.0001。
.0003 巨大头畸形、面部畸形和精神运动迟缓
HERC1、ARG3250TER(SCV000212106)
Nguyen 等人描述了一名 18 岁男性,其父母为摩洛哥近亲,患有大头畸形、面容畸形和精神运动迟缓(MDFPMR; 617011)(2016) 在 HERC1 基因的外显子 49 中发现了纯合 c.9748C-T 转换(SCV000212106),导致 arg3250 到 ter(R3250X) 的取代。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离,并且在任何公开数据库中都没有发现。患者成纤维细胞表现出突变转录本减少并且完全缺失该蛋白,表明该突变导致无义介导的 mRNA 衰减。与对照组相比,患者成纤维细胞的 TSC2(191092) 或 mTORC1(参见 MTOR,601231)均未显示变化; HERC2(605837)水平也没有变化。阮等人(2016) 假设由于 HERC1 丢失而导致的 mTOR 通路的改变可能是组织特异性的。
.0004 巨大头畸形、面部畸形和精神运动迟缓
HERC1、IVS26、A-C、-2
2 名同胞,父母为印度近亲,患有大头畸形、面容畸形和精神运动迟缓(MDFPMR; 617011) Aggarwal 等人(2016) 在 HERC1 基因中发现了纯合的 A 到 C 颠换(c.4906-2A-C),导致剪接位点突变、外显子 27 中 10 bp 的缺失,导致移码和过早终止。该突变是通过外显子组测序发现并通过桑格测序确认的,并根据 dbSNP、1000 Genomes Project、Exome Variant Server 和 ExAC 数据库进行筛选;它与家庭混乱有关。患者细胞的突变 mRNA 水平显着降低,表明突变导致无义介导的 mRNA 衰减。阿加瓦尔等人(2016) 表明,这些患者中发生的 HECT 结构域丢失可能具有致病意义,因为该结构域与 TSC2(191092) 相互作用,并通过泛素化和靶向降解降低其稳定性,这可能会激活 mTOR 通路,导致过度生长。
.0005 巨大头畸形、面部畸形和精神运动迟缓
HERC1、ARG4691PRO
Schwarz 等人的 2 姐妹,由阿塞拜疆近亲出生,患有大头畸形、面容畸形和精神运动迟缓(MDFPMR; 617011)(2020) 鉴定了 HERC1 基因中 c.14072G-C 颠换(c.14072G-C,NM_003922)的纯合性,导致 HECT C 端高度保守残基处的 arg4691-to-pro(R4601P) 取代领域。该突变经全外显子组测序鉴定并经桑格测序证实,与家族中的疾病分离。它在 gnomAD 或 1000 基因组计划数据库中不以纯合状态存在。与对照组相比,其中一名患者的成纤维细胞显示出 HERC1 蛋白表达增加,营养饥饿下 S6K1(608938) 磷酸化增强,LC3B-II:LCB-I 比率降低,表明自噬减少。施瓦茨等人(2020) 得出结论,R4691P 突变导致 mTORC1 功能获得和活性增加。