锌指蛋白 42; ZFP42
表达基因 1 降低;雷克斯1
HGNC 批准的基因符号:ZFP42
细胞遗传学位置:4q35.2 基因组坐标(GRCh38):4:187,995,771-188,005,246(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
霍斯勒等人(1989) 克隆了小鼠 Zfp42,他们将其称为 Rex1。推导的 288 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 32.3 kD。 Rex1 具有酸性激活剂结构域的 N 端酸性拉伸特征,后面是 4 个重复的 C2H2 锌指基序。它还具有 3 个假定的磷酸化位点和一个可能的 N-糖基化位点。 Northern 印迹分析在 F9 小鼠干细胞中检测到 1.9 kb 的转录物。
罗杰斯等人(1991)发现Rex1在第4.5天小鼠囊胚的内细胞团中表达。它还存在于囊胚的极滋养层中,大约一天后,还存在于外胎盘锥和卵柱的胚外外胚层中,这些都是滋养层衍生的组织。随着内细胞团分化为胚胎外胚层,Rex1 丰度下降。 Rex1 还在妊娠第 18 天(妊娠最后一天)的胎盘中以及早期精子发生过程中的精母细胞中表达。在发育中的睾丸中,Rex1 表达急剧上升,与减数分裂在第 10 天左右的开始同时发生。
Henderson 等人通过在 EST 数据库中搜索与小鼠 Rex1 相似的序列(2002) 鉴定了人类 ZFP42,他们将其称为 REX1。推断出的小鼠和人类蛋白质具有高度相似性。 RT-PCR分析显示REX1在未分化的H7人类干细胞和滋养层分化的H7细胞中表达。
▼ 基因功能
Hosler 等人使用差异噬菌斑杂交(1989) 在 F9 小鼠畸胎瘤干细胞中,在视黄酸诱导分化为壁层内胚层或内脏内胚层时,在一组下调的基因中发现了 Rex1。
罗杰斯等人(1991) 发现 D3 小鼠胚胎干细胞系在使用 4 种不同的生长条件进行分化后,Rex1 的表达下调。
在获得多能性过程中,X 染色体失活(Xi) 的重编程伴随着 Xi 的触发因素 XIST(314670) 的抑制,以及其反义对应物 TSIX(300181) 的上调。纳瓦罗等人(2010) 指出小鼠 Rex1 是 Tsix 表达和多能性维持所必需的。他们发现 Rex1 与 Tsix 启动子内的 DXPas34 微卫星的两端结合。小鼠胚胎干细胞的敲低研究表明,Rex1 下调与 Tsix 下调、激活组蛋白标记的丧失以及 RNA 聚合酶 II 对 Tsix 转录本的占用减少相关(参见 180660)。纳瓦罗等人(2010) 得出结论认为,REX1 是 TSIX 有效延伸和获得多能性所必需的。
贡坦等人(2012) 确定多能因子 REX1 是 RNF12(300379) 在 X 染色体失活机制中的关键靶标。 RNF12 导致 REX1 泛素化和蛋白酶体降解,Rnf12 敲除小鼠胚胎干细胞显示 Rex1 水平增加。使用染色质免疫沉淀测序,在 Xist 和 Tsix 调节区检测到 Rex1 结合位点。研究发现,雌性胚胎干细胞中 Rex1 的过度表达会抑制 Xist 转录和 X 染色体失活,而雄性 Rex1 +/- 胚胎干细胞则表现出异位 X 染色体失活。由此,Gontan 等人(2012) 提出 RNF12 通过剂量依赖性催化作用导致 REX1 分解,从而代表启动 X 染色体失活的重要途径。 Rex1 和 Xist 仅存在于胎盘哺乳动物中,这表明这两个基因的共同进化和 X 染色体失活。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Henderson 等人(2002) 将 ZFP42 基因定位到染色体 4q35.2。他们指出,小鼠 Zfp42 基因定位到与人类染色体 4q35.2 具有同线性同源性的 8 号染色体区域。