细胞外基质蛋白 1; ECM1

HGNC 批准的基因符号:ECM1

细胞遗传学位置:1q21.2 基因组坐标(GRCh38):1:150,508,109-150,513,789(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

马蒂厄等人(1994) 鉴定了一种由小鼠成骨基质细胞系分泌的新型 85-kD 蛋白质。巴拉罗等人(1995) 表明全长 cDNA 为 1.9 kb,包含 1,677 bp 的开放解读码组,编码 559 个氨基酸的蛋白质。

斯密茨等人(1997) 描述了一种含有人类同源物的基因组克隆,称为细胞外基质蛋白 1(ECM1),来自 1 号染色体粘粒文库。 ECM1 基因似乎主要在胎盘和心脏中表达为 1.8 kb 转录本,而在扁桃体中检测到额外的 1.4 kb 选择性剪接信息。人ECM1转录本全长包含1,838 bp,与小鼠Ecm1 cDNA的总体同源性为79.6%。该转录本编码的蛋白质由 540 个氨基酸组成,与相应的小鼠蛋白质有 69.4% 的相同性和 81.3% 的相似性。选择性剪接变体长 1,450 bp,编码 415 个氨基酸的蛋白质。

▼ 基因结构

斯密茨等人(1997)证明人类ECM1基因的编码区包含10个外显子。

▼ 基因功能

小山等人(2003) 指出,HLA 亚型易感性和其他自身免疫性疾病的高发病率表明,针对特定粘膜皮肤抗原的自身抗体可能与苔藓硬化症的病因有关(151590)。地衣硬化症和类脂蛋白沉积症之间的临床病理学相似性(由 ECM1 突变引起)表明,该蛋白可能是地衣硬化症的自身抗原。通过免疫印迹,在 30 份地衣硬化症血清样本中的 20 份中发现了针对 ECM1 的 IgG 自身抗体。最高滴度为 20 分之一。这些样本以及来自其他 56 名苔藓硬化症患者的样本均显示出对重组 ECM1 蛋白的免疫反应性; 85 个对照血清样本中有 6 个呈阳性。研究结果表明,对 ECM1 的特异性体液免疫反应可能与苔藓硬化症的病因有关,并可能为疾病诊断、监测和治疗方法提供帮助。

▼ 测绘

通过荧光原位杂交,Smits 等人(1997) 将 ECM1 基因定位到表皮分化复合体区域外的 1q21(参见 152445)。巴拉罗等人(1995)将该基因定位到小鼠 3 号染色体上。

▼ 分子遗传学

类脂蛋白沉积症,也称为皮肤和粘膜玻璃样变或 Urbach-Wiethe 病(247100),是一种罕见的常染色体隐性遗传疾病,其典型特征是皮肤、粘膜和某些内脏普遍增厚。典型特征包括珠状眼睑丘疹和导致声音嘶哑的喉部浸润。在组织学上,存在广泛的透明(糖蛋白)物质沉积和基底膜破坏/重复。 Hamada 等人使用来自 6 个近亲家庭的 DNA(2002) 将这种疾病对应到染色体 1q21 标记 D1S498(lod = 21.85,theta = 0),位于 2.3-cM 关键区域内。使用候选基因方法,作者在 ECM1 中鉴定了 6 种不同的纯合功能丧失突变。

▼ 等位基因变异体(7 个精选示例):

.0001 Urbach 和 Wiethe 的类脂蛋白沉积
ECM1,1-BP DEL,1019A

Hamada 等人在患有类脂蛋白沉积症(247100) 的科威特近亲家庭受影响个体中(2002) 鉴定了 ECM1 基因外显子 7 中单碱基对缺失(A1019) 的纯合性。该突变导致下游 108 bp 处出现过早终止密码子。

.0002 Urbach 和 Wiethe 的类脂蛋白分解
ECM1、GLN346TER

滨田等人(2002) 发现一名 14 岁巴基斯坦男孩患有类脂蛋白沉积症(247100);他是近亲交配的产物,并且在 ECM1 基因外显子 7 的第 1036 位上从 C 到 T 的转变是纯合的。该突变导致密码子 gln346 转换为提前终止密码子(Q346X)。

.0003 Urbach 和 Wiethe 的类脂蛋白沉积
ECM1,1163-BP DEL

滨田等人(2002) 报道了沙特一个近亲家庭中有 4 名同胞患有类脂蛋白沉积症(247100)。所有受影响的个体都是 ECM1 基因中 1163 bp 缺失的纯合子,该缺失消除了部分内含子 8 以及全部外显子 9 和 10。

.0004 Urbach 和 Wiethe 的类脂蛋白沉积
ECM1,1-BP DEL,507T

Hamada 等人在 2 名具有不同 ECM1 单倍型的不相关的类脂蛋白沉积症受试者(247100) 中(2003) 在 ECM1 基因的外显子 6 中发现了 507delT 突变。作者认为,导致移码和下游 23 bp 过早终止的缺失可能代表类脂蛋白沉积症的复发突变。

.0005 Urbach 和 Wiethe 的类脂蛋白沉积
ECM1、ARG53TER

Hamada 等人在患有类脂蛋白沉积症(247100) 的患者中(2003) 在 ECM1 基因的外显子 3 中发现了纯合的 arg53-to-ter(R53X) 突变。

.0006 Urbach 和 Wiethe 的类脂蛋白沉积
ECM1、PHE167ILE

Hamada 等人在一名来自非近亲家庭的患有类脂蛋白沉积症(247100) 的 2 岁男孩中(2003) 在 ECM1 基因的外显子 6 中发现了杂合 phe167-to-ile(F167I) 突变。他在另一个等位基因的第 6 外显子中也携带了 trp160-to-ter(W160X) 突变。

.0007 Urbach 和 Wiethe 的类脂蛋白沉积
ECM1、TRP160TER

参见 602201.0006 和 Hamada 等人(2003)。