ST6 α-N-乙酰基-神经氨酰-2,3-β-半乳糖基-1,3-N-乙酰基半乳糖胺α-2,6-唾液酸转移酶 4; ST6GANAC4
唾液酸转移酶 3C; SIAT3C
NeuAc-α-2,3-Gal-β-1,3-GalNAc-α-2,6-唾液酸转移酶 IV
ST6GalNAc IV
HGNC 批准的基因符号:ST6GALNAC4
细胞遗传学位置:9q34.11 基因组坐标(GRCh38):9:127,907,886-127,917,041(来自 NCBI)
▼ 说明
GalNAc-α-2,6-唾液酸转移酶家族的成员催化唾液酸从 CMP-Neu5Ac 转移形成 α-2,6 连接。 ST6GalNAc IV 显示出有限的底物特异性,仅利用三糖序列 Neu5Ac-α-2,3-Gal-β-1,3-GalNAc,表明它不区分 α- 和 β- 连接的 GalNAc(Harduin-Lepers 等人) .,2000)。
▼ 克隆与表达
通过数据库搜索与大鼠 N-乙酰半乳糖胺 α-2,6-唾液酸转移酶(ST6GalNAc) III 同源的序列,Harduin-Lepers 等人(2000) 鉴定了人类 ST6GalNAc 家族的一个新成员,并将其命名为 ST6GalNAc IV。他们结合数据库搜索和 PCR 技术组装了 cDNA 序列。 ST6GalNAc IV cDNA 编码推导的 302 个氨基酸的 II 型膜蛋白,其中包含唾液酸基序 L、S 和 VS。 Harduin-Lepers 等人使用 SDS/PAGE 和蛋白质印迹分析重组蛋白(2000) 检测到一种分子量为 35 kD 的蛋白质。他们通过瞬时表达能够将唾液酸残基转移到 GalNAc 残基的 α-2,6 位的活性重组酶来确认 ST6GalNAc IV cDNA 的身份。 ST6GalNAc IV 蛋白与大鼠 St6GalNAc III 和小鼠 ST6GalNAc IV 蛋白分别具有 46.6% 和 88.1% 的序列同一性。哈杜因-莱珀斯等人(2000) 得出结论,ST6GalNAc IV 是红鳍东方鲀 SIAT3C 基因的人类直系同源物。
通过 Northern blot 分析,Harduin-Lepers 等人(2000) 在各种成人组织中检测到 2.2-kb ST6GalNAc IV 转录本的组成型表达,以及在脑、心脏和骨骼肌中额外的 2.5-kb 转录本的较低水平表达。通过 RT-PCR 分析,他们在多种培养的人类癌细胞中检测到了 ST6GalNAc IV 的表达。
通过 5-prime RACE-PCR,Kim 等人(2003) 除了来自人胎儿大脑的全长 ST6GalNAc IV 转录本之外,还克隆了 ST6GalNAc IV 剪接变体。在胎儿肝脏或成人大脑或肝脏中未发现该变异。它缺少外显子 2,该外显子包含框内起始密码子。胎儿组织的 Northern 印迹分析检测到肝脏中 ST6GalNAc IV 表达最高。在肾脏和肺中的表达非常低,并且在胎儿脑中检测不到。
李等人(1999) 从大脑 cDNA 文库中克隆了小鼠 St6GalNAc IV。推导的 302 个氨基酸的蛋白质包含一个短的 N 端尾部,随后是一个跨膜区、一个中央唾液酸基序 L 和一个 C 端唾液酸基序 S。
▼ 基因功能
李等人(1999) 测定了可溶形式的小鼠 St6GalNAc IV 将放射性标记的 N-乙酰神经氨酸(NeuAc) 从 CMP-NeuAc 转移到几种糖脂、糖蛋白和游离寡糖底物的能力。只有胎球蛋白(AHSG; 138680) 和胎球蛋白中发现的未缀合的 NeuAc-α-2,3-Gal-β-1,3-GalNAc 残基是良好的受体底物。糖脂 GM1b 含有相同的碳水化合物残基,是一种弱得多的底物。掺入的唾液酸含有 α-2,6 连接,证实该酶属于 ST6GalNAc 家族。
▼ 基因结构
哈杜因-莱珀斯等人(2000) 确定 SIAT3C 基因包含 7 个外显子并跨越至少 10 kb 的基因组 DNA。
金等人(2003) 确定 ST6GalNAc IV 的 5-prime 区域缺乏典型的 TATA 和 CAAT 框,但包含几个假定的转录因子结合位点。
▼ 测绘
Gilley 和 Fried(1999) 通过 FISH 和辐射杂交分析将红鳍东方鲀 SIAT3C 基因的人类直系同源物定位到染色体 9q31。哈杜因-莱珀斯等人(2000) 通过序列分析将人类 SIAT3C 基因定位到 9q31。